三嶋雄一郎 (Yuichiro Mishima) - マイポータル

基本情報

所属: 京都産業大学生命科学部准教授

学位: 博士（理学）(神戸大学)

研究者番号: 00557069
J-GLOBAL ID: 201601014578670062
researchmap会員ID: B000256337

外部リンク: https://www.mishima-lab.com

ゼブラフィッシュをモデルとして新しい転写後制御機構の発掘と解明を目指しています。受精後の母性mRNAの安定性がコドンの組み合わせによって規定されていることを発見し（Mol Cell. 2016）、この遺伝暗号の新たな機能「mRNA安定性コード」の解明に向けて研究を行っています。

研究キーワード

研究分野

経歴

2019年4月 - 現在

京都産業大学生命科学部准教授
2018年4月 - 2019年3月

京都産業大学総合生命科学部准教授
2012年10月 - 2018年3月

東京大学分子細胞生物学研究所助教
2009年7月 - 2012年9月

神戸大学理学部生物学科研究員
2008年4月 - 2009年6月

日本学術振興会海外特別研究員
2007年1月 - 2009年6月

Yale大学医学部遺伝学研究科研究員
2006年10月 - 2006年12月

神戸大学大学院理学研究科生物学専攻研究員

学歴

2003年4月 - 2006年9月

神戸大学大学院理学研究科生物学専攻（理学博士）
2001年4月 - 2003年3月

奈良先端科学技術大学院大学バイオサイエンス研究科（修士）
1997年4月 - 2001年3月

大阪市立大学理学部生物学科（学士）

受賞

2017年4月

平成 29 年度科学技術分野の文部科学大臣表彰若手科学者賞「脊椎動物の初期発生における mRNA 制御機構の研究」文部科学省

三嶋雄一郎

論文

pSNAP: Proteome-wide analysis of elongating nascent polypeptide chains

Junki Uchiyama, Rohini Roy, Dan Ohtan Wang, Kazuya Morikawa, Yuka Kawahara, Mio Iwasaki, Chiaki Yoshino, Yuichiro Mishima, Yasushi Ishihama, Koshi Imami

iScience 104516-104516 2022年6月査読有り
Ribosome slowdown triggers codon-mediated mRNA decay independently of ribosome quality control.

Yuichiro Mishima, Peixun Han, Kota Ishibashi, Seisuke Kimura, Shintaro Iwasaki

The EMBO journal 41(5) e109256 2022年1月18日査読有り筆頭著者責任著者
Transient ribosome slowdown at the decoding step triggers mRNA degradation independent of Znf598 in zebrafish

Yuichiro Mishima, Peixun Han, Seisuke Kimura, Shintaro Iwasaki

2021年5月14日
Tethered Function Assay to Study RNA-Regulatory Proteins in Zebrafish

Yuichiro Mishima, Kunio Inoue

Methods in Molecular Biology 347(354) 347-354 2021年2月招待有り筆頭著者責任著者
Protocol for Disome Profiling to Survey Ribosome Collision in Humans and Zebrafish

Mari Mito, Yuichiro Mishima, Shintaro Iwasaki

STAR Protocols 1(3) 100168-100168 2020年12月査読有り
Genome-wide Survey of Ribosome Collision.

Peixun Han, Yuichi Shichino, Tilman Schneider-Poetsch, Mari Mito, Satoshi Hashimoto, Tsuyoshi Udagawa, Kenji Kohno, Minoru Yoshida, Yuichiro Mishima, Toshifumi Inada, Shintaro Iwasaki

Cell reports 31(5) 107610-107610 2020年5月5日査読有り
Deadenylation by the CCR4-NOT complex contributes to the turnover of hairy-related mRNAs in the zebrafish segmentation clock.

Fujino Y, Yamada K, Sugaya C, Ooka Y, Ovara H, Ban H, Akama K, Otosaka S, Kinoshita H, Yamasu K, Mishima Y, Kawamura A

FEBS Letters 592(20) 3388-3398 2018年10月査読有り
PAINTing translation

Mishima Y

Nature Chemical Biology 2018年7月招待有り筆頭著者責任著者
Pervasive yet nonuniform contributions of Dcp2 and Cnot7 to maternal mRNA clearance in zebrafish

Yuichiro Mishima, Yukihide Tomari

GENES TO CELLS 22(7) 670-678 2017年7月査読有り筆頭著者責任著者
Codon Usage and 30 UTR Length Determine Maternal mRNA Stability in Zebrafish

Yuichiro Mishima, Yukihide Tomari

MOLECULAR CELL 61(6) 874-885 2016年3月査読有り筆頭著者責任著者
Roles of mRNA Fate Modulators Dhh1 and Pat1 in TNRC6-dependent Gene Silencing Recapitulated in Yeast

Shiho Makino, Yuichiro Mishima, Kunio Inoue, Toshifumi Inada

JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY 290(13) 8331-8347 2015年3月査読有り責任著者
MicroRNAs Trigger Dissociation of eIF4AI and eIF4AII from Target mRNAs in Humans

Akira Fukao, Yuichiro Mishima, Naoki Takizawa, Shigenori Oka, Hiroaki Imataka, Jerry Pelletier, Nahum Sonenberg, Christian Thoma, Toshinobu Fujiwara

MOLECULAR CELL 56(1) 79-89 2014年10月査読有り
Elements and machinery of non-coding RNAs: toward their taxonomy

Tetsuro Hirose, Yuichiro Mishima, Yukihide Tomari

EMBO REPORTS 15(5) 489-507 2014年5月査読有り
miR-1 and miR-206 regulate angiogenesis by modulating VegfA expression in zebrafish

Carlos Stahlhut, Yajaira Suarez, Jun Lu, Yuichiro Mishima, Antonio J. Giraldez

DEVELOPMENT 139(23) 4356-4364 2012年12月査読有り責任著者
Widespread roles of microRNAs during zebrafish development and beyond

Yuichiro Mishima

DEVELOPMENT GROWTH & DIFFERENTIATION 54(1) 55-65 2012年1月査読有り筆頭著者責任著者
Translational inhibition by deadenylation-independent mechanisms is central to microRNA-mediated silencing in zebrafish

Yuichiro Mishima, Akira Fukao, Tomoyoshi Kishimoto, Hiroshi Sakamoto, Toshinobu Fujiwara, Kunio Inoue

PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA 109(4) 1104-1109 2012年1月査読有り筆頭著者責任著者
A Novel miRNA Processing Pathway Independent of Dicer Requires Argonaute2 Catalytic Activity

Daniel Cifuentes, Huiling Xue, David W. Taylor, Heather Patnode, Yuichiro Mishima, Sihem Cheloufi, Enbo Ma, Shrikant Mane, Gregory J. Hannon, Nathan D. Lawson, Scot A. Wolfe, Antonio J. Giraldez

SCIENCE 328(5986) 1694-1698 2010年6月査読有り
DAZL Relieves miRNA-Mediated Repression of Germline mRNAs by Controlling Poly(A) Tail Length in Zebrafish

Yasuaki Takeda, Yuichiro Mishima, Toshinobu Fujiwara, Hiroshi Sakamoto, Kunio Inoue

PLOS ONE 4(10) e7513 2009年10月査読有り
Zebrafish miR-1 and miR-133 shape muscle gene expression and regulate sarcomeric actin organization

Yuichiro Mishima, Cei Abreu-Goodger, Alison A. Staton, Carlos Stahlhut, Chong Shou, Chao Cheng, Mark Gerstein, Anton J. Enright, Antonio J. Giraldez

GENES & DEVELOPMENT 23(5) 619-632 2009年3月査読有り筆頭著者
miR-1-2 gets to the heart of the matter

Yuichiro Mishima, Carlos Stahlhut, Antonio J. Giraldez

CELL 129(2) 247-249 2007年4月招待有り筆頭著者

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書籍等出版物

動物の事典

末光隆志, 三嶋雄一郎, 他 (担当:分担執筆, 範囲:3.7.2 マイクロRNA 3.7.3 RNA干渉法)

朝倉書店 2020年11月 (ISBN: 9784254171662)
遺伝暗号による遺伝子発現制御

三嶋雄一郎

生体の科学（医学書院） 2019年4月
DOJIN BIOSCIENCEシリーズ「非コードRNA」

三嶋雄一郎 (担当:共著, 範囲:第9章動物発生とsmall RNA)

化学同人 2016年
実験医学増刊号「ノンコーディングRNAテキストブック」

三嶋雄一郎 (担当:共著, 範囲:miRNAの網羅的解析)

羊土社 2015年
microRNAはどのようにして標的mRNAを抑制するのか?

三嶋雄一郎

実験医学増刊号（羊土社） 2013年
ゼブラフィッシュmiR-1と miR-133は骨格筋の遺伝子発現と筋節アクチンを制御する

三嶋雄一郎

実験医学（羊土社） 2009年
RNA実験ノート下巻

三嶋雄一郎, 井上邦夫 (担当:共著, 範囲:Whole mount in situハイブリダイゼーションによるmiRNAの発現解析)

羊土社 2008年
RNA実験ノート上巻

三嶋雄一郎, 井上邦夫 (担当:共著, 範囲:ゼブラフィッシュ胚からのRNA抽出)

羊土社 2008年
microRNAによるゼブラフィッシュ初期発生制御機構

三嶋雄一郎, 井上邦夫 (担当:共著)

実験医学（羊土社） 2007年
実験医学増刊号「躍進するRNA研究」

三嶋雄一郎, 坂本博, 井上邦夫 (担当:共著, 範囲:mRNA局在化の分子機構)

羊土社 2004年