上村直史 (Naofumi Kamimura) - マイポータル - researchmap

基本情報

所属: 長岡技術科学大学物質生物系准教授

学位: 工学(長岡技術科学大学)

連絡先: zkamivos.nagaokaut.ac.jp
J-GLOBAL ID: 201301046390235420
researchmap会員ID: B000234201

外部リンク: https://whs.nagaokaut.ac.jp/mme-lig/

主要な論文

157

The Syringate O-Demethylase Gene of Sphingobium sp. Strain SYK-6 Is Regulated by DesX, while Other Vanillate and Syringate Catabolism Genes Are Regulated by DesR

Takuma Araki, Kenta Tanatani, Naofumi Kamimura, Yuichiro Otsuka, Muneyoshi Yamaguchi, Masaya Nakamura, Eiji Masai

APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY 86(22) 2020年11月査読有り

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共同研究・競争的資金等の研究課題

10

リグニンから新たな窒素置換化合物を生産するプロセス開発と機能性材料への応用

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2025年4月 - 2028年3月

鈴木悠造, 上村直史, 道信剛志
芳香族オリゴマー分解酵素の発掘がもたらすリグニンからのプラスチック生産革命

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2024年4月 - 2028年3月

上村直史, 中村彰宏
非従来型モノマー導入リグニンによる生育・加工特性に優れた木質バイオマスの創製

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2022年4月 - 2026年3月

坂本真吾, 梶田真也, 上村直史, 光田展隆
センサー細菌を活用した環境中におけるリグニン生分解の実態解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 基盤研究(C) 2021年4月 - 2024年3月

上村直史, 亀井一郎
リグニンからのプラスチック原料生産を促進するバイオセンサーの開発

公益財団法人八洲環境技術振興財団研究開発・調査助成環境保全、地球温暖化防止、エネルギー利用上の技術 2023年4月 - 2024年3月
リグニンの主要結合を開裂する微生物の探索とリグニンからのポリマー原料生産への応用

公益財団法人発酵研究所一般研究助成研究課題３ 2020年4月 - 2022年3月
リグニン由来の低分子芳香族を特異的に検出する革新的環境センサーの開発

学術研究費補助金若手研究 2018年4月 - 2021年3月

上村直史
微生物分解と化学変換を組み合わせた樹木バイオマスからの工業原料生産

公益財団法人ユニオンツール育英奨学会科学技術研究費助成金 2017年4月 - 2018年3月

上村直史
リグニン有効利用の鍵となるβ-アリールエーテル代謝酵素遺伝子の探索と解析

公益財団法人内田エネルギー科学振興財団試験研究費助成 2016年4月 - 2017年3月

上村直史
デッドエンド化合物の生成を回避する細菌の代謝機構

学術研究費補助金若手研究(Ｂ) 2014年4月 - 2016年3月

上村直史

経歴

2

2022年4月 - 現在

長岡技術科学大学, 技学研究院物質生物系, 准教授
2013年4月 - 2022年3月

長岡技術科学大学, 技学研究院生物機能工学専攻, 助教

学歴

1

- 2011年3月

長岡技術科学大学大学院, 工学研究科, 生物統合工学専攻

受賞

2

2021年8月

リグニン学会奨励賞, 細菌によるリグニン由来芳香族化合物分解システムの解明, リグニン学会

上村直史
2016年6月

BEST POSTER AWARD, Essential Aldehyde Dehydrogenases for Lignin Degradation in Sphingobium sp. Strain SYK-6, Lignobiotech IV Symposium

上村直史

講演・口頭発表等

349

リグニンを原料とするメチオニン発酵生産系の開発に向けた基盤株の構築

林郁香, 水出暁登, 藤田雅也, 上村直史, 政井英司

日本農芸化学会2026年度大会 2026年3月12日
Sphingobium lignivorans SYK-6株を基盤とする非可食バイオマスのみで成り立つポリマー原料生産

水出暁登, 加藤諒, 藤田雅也, 荒木拓馬, 鈴木悠造, 大塚祐一郎, 中村雅哉, 道信剛志, 上村直史, 政井英司

日本農芸化学会2026年度大会 2026年3月12日
Search for potential enzymes and bacteria that can degrade polyesters based on lignin-derived 2-pyrone-4,6-dicarboxylic acid

Ryo Kato, Miho Kobayashi, Yijie Jin, Manami Uemura, Takumi Ishikawa, Masaya Fujita, Tsuyoshi Michinobu, Naofumi Kamimura, Eiji Masai

Pacifichem 2025 2025年12月17日
Elucidating catabolic system of syringic acid in Pseudomonas sp. NGC7 for lignin biorefinery

Zen Ookawa, Yudai Higuchi, Masaya Fujita, Tomonori Sonoki, Naofumi Kamimura, Eiji Masai

Pacifichem 2025 2025年12月17日
Bacterial sensor for 2-pyrone-4,6-dicarboxylic acid, a polymer building block produced through microbial lignin valorization

Hyo Suzuki, Kenta Tanatani, Masaya Fujita, Takuma Araki, Yuzo Suzuki, Tsuyoshi Michinobu, Yuichiro Otsuka, Masaya Nakamura, Eiji Masai, Naofumi Kamimura

Pacifichem 2025 2025年12月17日
The catabolism operons for a β-5 lignin-derived compound in Sphingobium lignivorans SYK-6 are integrally regulated by PhcR

Mitsuru Kawazoe, Shojiro Hishiyama, Masaya Fujita, Naofumi Kamimura, Eiji Masai

Pacifichem 2025 2025年12月17日
Developing a polymer building block production system using non-edible biomass through metabolic engineering of Sphingobium lignivorans SYK-6

Akito Mizuide, Ryo Kato, Masaya Fujita, Takuma Araki, Yuzo Suzuki, Yuichiro Otsuka, Masaya Nakamura, Tsuyoshi Michinobu, Naofumi Kamimura, Eiji Masai

Pacifichem 2025 2025年12月17日
Microbial production of a lignin-derived polymer building block, 2-pyrone-4,6-dicarboxylic acid, from softwood and hardwood black liquors

Naofumi Kamimura, Mina Endo, Banri Nakamura, Takuya Akiyama, Ryo Kato, Mitsuru Kawazoe, Masaya Fujita, Takuma Araki, Yuzo Suzuki, Tsuyoshi Michinobu, Yuichiro Otsuka, Masaya Nakamura, and Eiji Masai

Pacifichem 2025 2025年12月17日
Characterization of the inner membrane transporter gene phcK for the uptake of a β-5-type lignin-derived dimer in Sphingobium lignivorans SYK-6

Mitsuru Kawazoe, Masaya Fujita, Shojiro Hishiyama, Naofumi Kamimura, Eiji Masai

10th STI-GIGAKU 2025 2025年11月11日
Sphingobium lignivorans SYK-6株におけるβ-1型二量体化合物の新規代謝システム

赤木桃果, 加藤諒, 藤田雅也, 菱山正二郎, 片平類, Gregg T. Beckham, 上村直史, 政井英司

第70回リグニン討論会 2025年11月7日
Sphingobium lignivorans SYK-6株の代謝改変に基づく黒液からのポリマー原料生産系の開発

水出暁登, 加藤諒, 藤田雅也, 荒木拓馬, 鈴木悠造, 大塚祐一郎, 中村雅哉, 道信剛志, 上村直史, 政井英司

第70回リグニン討論会 2025年11月7日
Sphingobium lignivorans SYK-6代謝改変株による黒液からの4S-3-カルボキシムコノラクトン生産系の確立

原田真登, 川島萌, 碇耀斗, 川添充, 水出暁登, 藤田雅也, 鈴木悠造, 荒木拓馬, 大塚祐一郎, 道信剛志, 上村直史, 政井英司

第70回リグニン討論会 2025年11月7日
細菌のβ-5型二量体化合物代謝を支える精緻な転写制御システム

川添充, 藤田雅也, 菱山正二郎, 上村直史, 政井英司

第70回リグニン討論会 2025年11月6日
木質由来バイオマスポリマー分解酵素の探索とモノマーリサイクルシステムの構築

小林未歩, 加藤諒, 金易介, 藤田雅也, 道信剛志, 上村直史, 政井英司

第65回新潟生化学懇話会 2025年10月18日
Sphingobium lignivorans SYK-6株におけるβ-1型二量体新規代謝系遺伝子の転写制御

廣井彩香, 加藤諒, 藤田雅也, 菱山正二郎, 片平類, Gregg T. Beckham, 上村直史, 政井英司

第65回新潟生化学懇話会 2025年10月18日
リグニンを原料として用いるメチオニン発酵生産系の開発

林郁香, 水出暁登, 藤田雅也, 上村直史, 政井英司

第65回新潟生化学懇話会 2025年10月18日
細菌におけるリグニン由来二量体内膜輸送体の解析

川添充, 藤田雅也, 菱山正二郎, 上村直史, 政井英司

第65回新潟生化学懇話会 2025年10月18日
Sphingobium lignivorans SYK-6株におけるβ-1型二量体化合物新規代謝酵素遺伝子の解析

赤木桃果, 加藤諒, 藤田雅也, 菱山正二郎, 片平類, Gregg T. Beckham, 上村直史, 政井英司

第65回新潟生化学懇話会 2025年10月18日
木質バイオマスからのポリマー原料4S-3-カルボキシムコノラクトンの微生物生産

原田真登, 川島萌, 碇耀斗, 川添充, 水出暁登, 藤田雅也, 鈴木悠造, 荒木拓馬, 大塚祐一郎, 道信剛志, 上村直史, 政井英司

第65回新潟生化学懇話会 2025年10月18日
バガスアルカリ加水分解物からのバニリン酸生産においてシリンガ酸の分解が抑制される分子機構の解析

池田和磨, 児玉直哉, 大川全, 樋口雄大, 上村直史, 政井英司, 園木和典

日本農芸化学会 2025年度大会 2025年3月8日

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委員歴

2

2024年9月 - 2026年8月

日本生物工学会, 生物工学会誌バイオミディア委員
2022年6月 - 2025年6月

リグニン学会, 評議員

書籍等出版物

7

木材科学講座10 バイオマス

編者(宮藤, 久士, 河本, 晴雄, 梶田, 真也, 亀井, 一郎), 著者(上村, 直史, 他31名) (担当:分担執筆, 範囲:第7章生物化学的変換細菌によるリグニン変換)

海青社 2025年4月 (ISBN: 9784860990701)
リグニン4億年の歴史―合成と分解をめぐる進化の物語―

上村直史

公益社団法人日本生物工学会 2025年2月25日
リグニンから微生物発酵を介してプラスチック生産

上村直史

公益社団法人日本生物工学会 2024年4月25日
化学とバイオが連携したリグニンからの芳香族ポリマー合成—Interdisciplinary Approach to the Synthesis of Poly (ethylene vanillate) from Sulfite Lignin

園木和典, 樋口雄大, 吉川琢也, 上村直史, 竹内大介, 政井英司

東京 : シーエムシー出版 2023年6月
リグニン利活用のための最新技術動向 (新材料・新素材シリーズ) 梅澤俊明監修

中村雅哉, 敷中一洋, 大塚祐一郎, 上村直史, 政井英司, 片山義博 (担当:分担執筆, 範囲:第4章リグニンの応用展開, 4.リグニンから新規プラットホームケミカルの変換技術開発と高分子材料開発)

シーエムシー出版 2020年3月 (ISBN: 9784781314945)
Lignin Valorization: Emerging Approaches

Yudai Higuchi, Kenji Takahashi, Naofumi Kamimura, Eiji Masai (担当:共著, 範囲:Chapter 9 Bacterial Enzymes for the Cleavage of Lignin β-Aryl Ether Bonds: Properties and Applications)

ROYAL SOCIETY OF CHEMISTRY 2018年4月 (ISBN: 9781782625544)
Biodegradative Bacteria: How Bacteria Degrade, Survive, Adapt, and Evolve

Naofumi Kamimura, Eiji Masai (担当:共著, 範囲:The Protocatechuate 4,5-Cleavage Pathway: Overview and New Findings)

Springer 2013年11月30日 (ISBN: 4431545190)

主要な所属学協会

5

2018年12月 - 現在

リグニン学会
2005年10月 - 現在

日本農芸化学会

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主要な研究キーワード

3

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主要な研究分野

2

ライフサイエンス / 応用微生物学 / リグニン、微生物代謝、バクテリア、代謝工学

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産業財産権

11

特開2024-109093 アセトバニロン変換酵素遺伝子及びそれを用いた有用物質生産

樋口雄大, 園木和典, 政井英司, 上村直史
特許第7392928号 2-ピロン-4,6-ジカルボン酸の製造方法

中村雅哉, 大塚祐一郎, 亀山敏治, 亀山昂暉, 政井英司, 上村直史, 片山義博
特許第7385870号ムコン酸産生形質転換微生物及びその利用

園木和典, 政井英司, 上村直史
特許第7097547号細胞壁が改変された植物、斯かる植物を得るための方法及び核酸、並びに斯かる植物を用いたグルコースの製造方法

光田展隆, 坂本真吾, 中田未友希, 梶田真也, 政井英司, 上村直史, ▲徳▼江洋介
特許第7083124号ムコン酸産生形質転換微生物及びその利用

園木和典, 政井英司, 上村直史
特許第7067706号形質転換微生物及びその利用

政井英司, 上村直史, 高橋健司, 園木和典
特開2021-141874 2-ピロン-4,6-ジカルボン酸の製造方法

中村雅哉, 大塚祐一郎, 亀山敏治, 亀山昂暉, 政井英司, 上村直史, 片山義博
WO2020-080467 ムコン酸産生形質転換微生物及びその利用

園木和典, 政井英司, 上村直史
特開2019-129799 細胞壁が改変された植物、斯かる植物を得るための方法及び核酸、並びに斯かる植物を用いたグルコースの製造方法

光田展隆, 坂本真吾, 中田未友希, 梶田真也, 政井英司, 上村直史, ▲徳▼江洋介
特開2018-183131 ムコン酸産生形質転換微生物及びその利用

園木和典, 政井英司, 上村直史
WO2018-199112 形質転換微生物及びその利用

政井英司, 上村直史, 高橋健司, 園木和典