上村直史 (Naofumi Kamimura) - マイポータル - researchmap

基本情報

所属: 長岡技術科学大学大学院工学研究科生物機能工学専攻助教

学位: 工学(長岡技術科学大学)

J-GLOBAL ID: 201301046390235420
researchmap会員ID: B000234201

外部リンク: http://bio.nagaokaut.ac.jp/~masai-l/

研究分野

1

ライフサイエンス / 応用微生物学 /

論文

49

Functional roles of multiple Ton complex genes in a Sphingobium degrader of lignin-derived aromatic compounds

Masaya Fujita, Shodai Yano, Koki Shibata, Mizuki Kondo, Shojiro Hishiyama, Naofumi Kamimura, Eiji Masai

Scientific Reports 11(1) 2021年12月査読有り
Protocatechuic acid fuel cell: A sustainable energy generation system based on microbial metabolism of lignin-derived aromatic compounds

Toshimasa Homma, Yoshino Tsurusaki, Naofumi Kamimura, Eiji Masai, Lily Zuin Ping Ang

Biomass and Bioenergy 154 2021年11月査読有り
Lignin valorization through efficient microbial production of beta-ketoadipate from industrial black liquor

Yuzo Suzuki, Yuichiro Otsuka, Takuma Araki, Naofumi Kamimura, Eiji Masai, Masaya Nakamura, Yoshihiro Katayama

BIORESOURCE TECHNOLOGY 337 2021年10月査読有り
Caffeoylquinic acids: chemistry, biosynthesis, occurrence, analytical challenges, and bioactivity

Armando Alcázar Magaña, Naofumi Kamimura, Amala Soumyanath, Jan F. Stevens, Claudia S. Maier

Plant Journal 107(5) 1299-1319 2021年9月査読有り招待有り
LsdD has a critical role in the dehydrodiconiferyl alcohol catabolism among eight lignostilbene α,β-dioxygenase isozymes in Sphingobium sp. strain SYK-6

Naofumi Kamimura, Yusaku Hirose, Ryuto Masuba, Ryo Kato, Kenji Takahashi, Yudai Higuchi, Shojiro Hishiyama, Eiji Masai

International Biodeterioration and Biodegradation 159 2021年4月査読有り
Characterization of aromatic acid/proton symporters in Pseudomonas putida KT2440 toward efficient microbial conversion of lignin-related aromatics.

Ayumu Wada, Érica T Prates, Ryo Hirano, Allison Z Werner, Naofumi Kamimura, Daniel A Jacobson, Gregg T Beckham, Eiji Masai

Metabolic engineering 64 167-179 2021年3月査読有り
Iron acquisition system of Sphingobium sp. strain SYK-6, a degrader of lignin-derived aromatic compounds

Masaya Fujita, Taichi Sakumoto, Kenta Tanatani, HongYang Yu, Kosuke Mori, Naofumi Kamimura, Eiji Masai

Scientific Reports 10(1) 2020年12月査読有り
The Syringate O-Demethylase Gene of Sphingobium sp. Strain SYK-6 Is Regulated by DesX, while Other Vanillate and Syringate Catabolism Genes Are Regulated by DesR

Takuma Araki, Kenta Tanatani, Naofumi Kamimura, Yuichiro Otsuka, Muneyoshi Yamaguchi, Masaya Nakamura, Eiji Masai

APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY 86(22) 2020年11月査読有り
Roles of two glutathione S-transferases in the final step of the β-aryl ether cleavage pathway in Sphingobium sp. strain SYK-6

Yudai Higuchi, Daisuke Sato, Naofumi Kamimura, Eiji Masai

2020年7月8日査読有り
Development of the production of 2-pyrone-4,6-dicarboxylic acid from lignin extracts, which are industrially formed as by-products, as raw materials

Yuzo Suzuki, Yuriko Okamura-Abe, Masaya Nakamura, Yuichiro Otsuka, Takuma Araki, Hiroyuki Otsuka, Ronald Ragudo Navarro, Naofumi Kamimura, Eiji Masai, Yoshihiro Katayama

JOURNAL OF BIOSCIENCE AND BIOENGINEERING 130(1) 71-75 2020年7月査読有り
Identification of enzymatic genes with the potential to reduce biomass recalcitrance through lignin manipulation in Arabidopsis

Sakamoto S, Kamimura N, Tokue Y, Nakata-T. M, Yamamoto M, Hu S, Masai M, Mitsuda N, Kajita S

Biotechnology for Biofuels 13 97-97 2020年5月査読有り
A TonB-dependent receptor constitutes the outer membrane transport system for a lignin-derived aromatic compound

Masaya Fujita, Kosuke Mori, Hirofumi Hara, Shojiro Hishiyama, Naofumi Kamimura, Eiji Masai

Communications Biology 2(1) 2019年12月査読有り
Regulation of vanillate and syringate catabolism by a MarR-type transcriptional regulator DesR in Sphingobium sp. SYK-6

Araki T, Umeda S, Kamimura N, Kasai D, Kumano S, Abe T, Kawazu C, Otsuka Y, Nakamura M, Katayama Y, Fukuda M, Masai E

Scientific Reports 9 18036 2019年12月査読有り
Discovery of novel enzyme genes involved in the conversion of an arylglycerol-β-aryl ether metabolite and their use in generating a metabolic pathway for lignin valorization.

Higuchi Y, Kato R, Tsubota K, Kamimura N, Westwood NJ, Masai E

Metabolic engineering 2019年8月査読有り
Isolation of a novel platform bacterium for lignin valorization and its application in glucose-free cis,cis-muconate production.

Shinoda E, Takahashi K, Abe N, Kamimura N, Sonoki T, Masai E

Journal of industrial microbiology & biotechnology 46(8) 1071-1080 2019年8月査読有り
Advances in microbial lignin degradation and its applications.

Kamimura N, Sakamoto S, Mitsuda N, Masai E, Kajita S

Current opinion in biotechnology 56 179-186 2018年12月査読有り
DdvK, a novel major facilitator superfamily transporter essential for 5,5'-dehydrodivanillate uptake by Sphingobium sp. strain SYK-6.

Mori K, Niinuma K, Fujita M, Kamimura N, Masai E

Applied and environmental microbiology 2018年8月査読有り
Identification of the protocatechuate transporter gene in Sphingobium sp. strain SYK-6 and effects of overexpression on production of a value-added metabolite

Kosuke Mori, Naofumi Kamimura, Eiji Masai

Applied Microbiology and Biotechnology 102(11) 4807-4816 2018年6月1日査読有り
Two novel decarboxylase genes play a key role in the stereospecific catabolism of dehydrodiconiferyl alcohol in Sphingobium sp. strain SYK-6

Kenji Takahashi, Kyohei Miyake, Shojiro Hishiyama, Naofumi Kamimura, Eiji Masai

Environmental Microbiology 20(5) 1739-1750 2018年5月1日査読有り
Bacterial Catabolism of β-Hydroxypropiovanillone and β-Hydroxypropiosyringone Produced in the Reductive Cleavage of Arylglycerol-β-Aryl Ether in Lignin

Higuchi Y, Aoki S, Takenami H, Kamimura N, Takahashi K, Hishiyama S, Lancefield CS, Ojo OS, Katayama Y, Westwood NJ, Masai E

Applied and environmental microbiology 84(7) 2018年4月1日査読有り

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共同研究・競争的資金等の研究課題

6

センサー細菌を活用した環境中におけるリグニン生分解の実態解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2021年4月 - 2024年3月

上村直史, 亀井一郎
リグニンの主要結合を開裂する微生物の探索とリグニンからのポリマー原料生産への応用

公益財団法人発酵研究所一般研究助成研究課題３ 2020年4月 - 2022年3月
リグニン由来の低分子芳香族を特異的に検出する革新的環境センサーの開発

学術研究費補助金若手研究 2018年4月 - 2021年3月

上村直史
微生物分解と化学変換を組み合わせた樹木バイオマスからの工業原料生産

公益財団法人ユニオンツール育英奨学会科学技術研究費助成金 2017年4月 - 2018年3月

上村直史
リグニン有効利用の鍵となるβ-アリールエーテル代謝酵素遺伝子の探索と解析

公益財団法人内田エネルギー科学振興財団試験研究費助成 2016年4月 - 2017年3月

上村直史
デッドエンド化合物の生成を回避する細菌の代謝機構

学術研究費補助金若手研究(Ｂ) 2014年4月 - 2016年3月

上村直史

講演・口頭発表等

174

多様なリグニン組成に対応できるPseudomonas sp.NGC7株を利用したムコン酸生産(II):針葉樹リグニンからの生産

阿久津美歩, 杉田晴佳, 高橋健司, 上村直史, 政井英司, 園木和典

日本農芸化学会大会講演要旨集(Web) 2019年3月5日
リグニン由来フェノール類からのプロトカテク酸の生産

後藤杏香, 上村直史, 稲垣翔, 宮本正紀, 政井英司, 園木和典

日本農芸化学会大会講演要旨集(Web) 2019年3月5日
多様なリグニン組成に対応できるPseudomonas sp.NGC7株を利用したムコン酸生産(I):新規単離微生物株を用いたムコン酸生産株の作出

阿部七瀬, 篠田英里, 高橋健司, 杉田晴佳, 上村直史, 園木和典, 政井英司

日本農芸化学会大会講演要旨集(Web) 2019年3月5日
モノリグノール生合成中間体の変換酵素遺伝子を利用したリグニンエンジニアリング

徳江洋介, 坂本真吾, 上村直史, 政井英司, 光田展隆, 梶田真也

第63回リグニン討論会 2018年11月2日
Sphingobium sp. SYK-6株におけるリグニン由来芳香族化合物の内膜transporterの探索

永吉昂太, 森光祐, 上村直史, 政井英司

第63回リグニン討論会 2018年11月2日
Sphingobium sp. SYK-6株におけるリグニン・ビフェニル化合物代謝系遺伝子群の転写制御システム

新沼皐, 荒木拓馬, 上村直史, 政井英司

第63回リグニン討論会 2018年11月2日
Sphingobium sp. SYK-6株におけるb-1型リグニン由来化合物の立体選択的な代謝システム

前川滉大, 小林将大, 樋口雄大, 上村直史, 菱山正二郎, 政井英司

第63回リグニン討論会 2018年11月2日
バクテリア細胞外膜におけるリグニン由来化合物取り込みメカニズムの解明

藤田雅也, 森光祐, 上村直史, 政井英司

第63回リグニン討論会 2018年11月2日
Parvibaclum lavametivorans DS-1株由来の PIDBR遺伝子を導入した組換えポプラの解析

胡石, 諾恩達古拉, 美麗, 山本雅信, 平山晴佳加, 秋山拓也, 渡辺眞悟, 上村直史, 政井英司, John Ralph, 梶田真也

第63回リグニン討論会 2018年11月2日
Sphingobium sp. SYK-6株由来Cα-dehydrogenaseとマウス由来Cx43を共発現する組換えポプラの解析

竹下諒, Lutfar Rahman, 今井真子, 諾恩達古拉, 上杉幹子, 上村直史, 政井英司, 梶田真也

第63回リグニン討論会 2018年11月2日
リグニンだけを炭素源としたcis,cis-ムコン酸生産に効果的な培養要素の同定

阿久津美歩, 杉田晴佳, 上村直史, 政井英司, 園木和典

第63回リグニン討論会 2018年11月2日
植物細胞壁におけるリグニンエンジニアリングのための新規酵素遺伝子の探索

徳江洋介, 坂本真吾, 上村直史, 政井英司, 光田展隆, 梶田真也

第63回リグニン討論会 2018年11月2日
β-O-4還元的開裂産物β-hydroxypropiovanilloneのバクテリアにおける代謝経路

樋口雄大, 青木翔吾, 高橋健司, 上村直史, 菱山正二郎, 片山義博, 政井英司

第63回リグニン討論会 2018年11月2日
バクテリアにおけるリグニン由来芳香族化合物の取り込みシステム

森光佑, 藤田雅也, 新沼皐, 上村直史, 政井英司

第63回リグニン討論会 2018年11月1日
植物細胞壁成分リグニンの生分解とその応用

上村直史, 政井英司

第11回北陸合同バイオシンポジウム 2018年10月27日
高濃度メチオニン存在下におけるSphingobium sp. SYK-6株のリグニン代謝阻害

保里明日香, 荒木拓馬, 上村直史, 政井英司

第11回北陸合同バイオシンポジウム 2018年10月26日
Sphingobium sp. SYK-6における金属元素取り込みメカニズムの解明

佐久本太一, 藤田雅也, 森光佑, 上村直史, 政井英司

第11回北陸合同バイオシンポジウム 2018年10月26日
バクテリアのリグニン・β-aryl ether代謝で生成するアセトフェノン類のカルボキシル化変換機構の解明

菊入祐生, 竹浪寛樹, 樋口雄大, 上村直史, 政井英司

第11回北陸合同バイオシンポジウム 2018年10月26日
リグニンだけを炭素源としたcis,cis‐ムコン酸生産に効果的な培養要素の同定

阿久津美歩, 阿久津美歩, 杉田晴佳, 杉田晴佳, 上村直史, 上村直史, 政井英司, 政井英司, 園木和典, 園木和典

リグニン討論会講演集 2018年10月17日
Sphingobium sp. SYK-6株におけるリグニン由来ビフェニル化合物代謝系遺伝子群の転写制御機構

新沼皐, 荒木拓馬, 上村直史, 政井英司

生命科学系フロンティアミーティング2018 2018年10月6日

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経歴

1

2013年4月 - 現在

長岡技術科学大学助教

学歴

1

- 2011年3月

長岡技術科学大学大学院工学研究科生物統合工学専攻

受賞

2

書籍等出版物

3

リグニン利活用のための最新技術動向 (新材料・新素材シリーズ) 梅澤俊明監修

中村雅哉, 敷中一洋, 大塚祐一郎, 上村直史, 政井英司, 片山義博 (担当:分担執筆, 範囲:第4章リグニンの応用展開, 4.リグニンから新規プラットホームケミカルの変換技術開発と高分子材料開発)

シーエムシー出版 2020年3月 (ISBN: 9784781314945)
Lignin Valorization: Emerging Approaches

Yudai Higuchi, Kenji Takahashi, Naofumi Kamimura, Eiji Masai (担当:共著, 範囲:Chapter 9 Bacterial Enzymes for the Cleavage of Lignin β-Aryl Ether Bonds: Properties and Applications)

ROYAL SOCIETY OF CHEMISTRY 2018年4月 (ISBN: 9781782625544)
Biodegradative Bacteria: How Bacteria Degrade, Survive, Adapt, and Evolve

Naofumi Kamimura, Eiji Masai (担当:共著, 範囲:The Protocatechuate 4,5-Cleavage Pathway: Overview and New Findings)

Springer 2013年11月30日 (ISBN: 4431545190)

所属学協会

5

2021年7月 - 現在

日本腐植物質学会
2020年4月 - 現在

日本木材学会
2018年12月 - 現在

リグニン学会
2006年4月 - 現在

環境バイオテクノロジー学会
2005年10月 - 現在

日本農芸化学会