藤本瑞 (Zui Fujimoto) - マイポータル

基本情報

所属: 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構基盤技術研究本部高度分析研究センターセンター長

学位: 博士（農学）(2003年12月東京大学)

研究者番号: 20370679
J-GLOBAL ID: 200901029902634114
researchmap会員ID: 0000043264

外部リンク: http://www.naro.affrc.go.jp/laboratory/naac/index.html

生体高分子（おもにタンパク質）の立体構造と機能の解明を行っています。

研究キーワード

研究分野

経歴

2026年4月 - 現在

国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構, 高度分析研究センター, センター長
2025年4月 - 2026年3月

国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構, 基盤技術研究本部高度分析研究センター生体高分子解析ユニット, 主席研究員
2022年4月 - 2025年3月

国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構本部知的財産部知的財産戦略室, 主席研究員
2021年4月 - 2022年3月

国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構基盤技術研究本部高度分析研究センター生体高分子解析ユニット
2016年4月 - 2021年3月

国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構, 高度解析センター
2003年4月 - 2016年3月

独立行政法人農業生物資源研究所, 主任研究官(員)
1994年10月 - 2003年3月

農林水産省農業生物資源研究所, 研究員
1994年4月 - 1994年9月

農林水産省農業環境技術研究所, 研究員

学歴

1992年4月 - 1994年3月

東京大学, 農学系研究科, 農芸化学専攻

受賞

論文

133

Crystal structure of rice L-galactose dehydrogenase

Zui Fujimoto, Mitsuru Momma, Nobuhiro Suzuki

Acta Crystallographica Section F Structural Biology Communications 2026年9月1日
Crystal structure of endo-β-1,6-galactanase from Streptomyces avermitilis

Zui Fujimoto, Naomi Kishine, Toshihisa Kotake, Satoshi Kaneko

Acta Crystallographica Section D Structural Biology 2026年8月1日
Structural Characteristics for the Interaction of 1-Benzyl-2-Methylbenzimidazoles as Insect Growth Regulators and Juvenile Hormone Binding Protein

Udawaththa Kankanamge Don Sahan Suganda Gunasekara, Konatsu Inoue, Zui Fujimoto, Shuhei Henmi, Wataru Tsuchiya, Rintaro Suzuki, Keisuke Kutsuwada, Izumi Ikeda, Toshimasa Yamazaki, Takahiro Shiotsuki

Insects 2026年6月22日
Structural characterization of OsPDIL2-3, a rice protein disulfide isomerase involved in prolamin accumulation

Zui Fujimoto, Kento Yonezawa, Mutsumi Sakurai, Naomi Kishine, Mitsuru Momma, Nobutaka Shimizu, Yasushi Kawagoe

Biochemical Journal 2026年5月6日
Structural characterization of the native oligomerization mode of MvaT proteins in Pseudomonas

Delyana Vasileva, Chiho Suzuki-Minakuchi, Takatoshi Arakawa, Yoshitaka Moriwaki, Kento Yonezawa, Nobutaka Shimizu, Zui Fujimoto, Tohru Terada, Kazunori Okada, Hideaki Nojiri

Microbiology Spectrum 2026年5月5日
Genetically Encoded FRET-Based Nanosensor for Insect Juvenile Hormone

Shingo Kikuta, Takahiro Shiotsuki, Wataru Tsuchiya, Rintaro Suzuki, Takahiro Kikawada, Zui Fujimoto, Toshimasa Yamazaki

ACS Omega 2025年11月11日
Tetrameric structure of Bacillus subtilis DegQ and its predicted interaction with the DegS–DegU two-component system

Zui Fujimoto, Naomi Kishine, Kengo Saitou, Keitarou Kimura

Acta Crystallographica Section F Structural Biology Communications 2025年10月1日
Crystal structure of Klebsiella pneumoniae maltohexaose-producing α-amylase

Zui Fujimoto, Naomi Kishine, Mitsuru Momma

The Journal of Biochemistry 2025年9月3日
Identification of a cytochrome P450, CYP6CY6v2, as a cytokinin side-chain hydroxylase from the aphid Acyrthosiphonpisum.

Kei Sato, Zui Fujimoto, Yoshihito Suzuki

Insect biochemistry and molecular biology 182 104333 2025年6月2日査読有り
A unique substrate specificity of PonAAS2, an aromatic aldehyde synthase, involved in phytohormone auxin biosynthesis in a gall-inducing sawfly Euura sp. “Pontania”

Yoshihito Suzuki, Hikaru Ichikawa, Yuri Kunioka, Umi Miyata, Shugo Nakamura, Zui Fujimoto

Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry 2025年3月24日査読有り
Chitin‐signaling‐dependent responses to insect oral secretions in rice cells propose the involvement of chitooligosaccharides in plant defense against herbivores

Yasukazu Kanda, Tomonori Shinya, David Wari, Yuko Hojo, Yuka Fujiwara, Wataru Tsuchiya, Zui Fujimoto, Bart P. H. J. Thomma, Yoko Nishizawa, Takashi Kamakura …

The Plant Journal 2025年1月査読有り
Deciphering transcriptomic signatures explaining the phenotypic plasticity of nonheading lettuce genotypes under artificial light conditions.

Hiroto Yamashita, Kaede C Wada, Noritoshi Inagaki, Zui Fujimoto, Jun-Ichi Yonemaru, Hironori Itoh

Plant, cell & environment 2023年8月2日査読有り
Cell-surface protein YwfG of Lactococcus lactis binds to α-1,2-linked mannose

Wataru Tsuchiya, Zui Fujimoto, Noritoshi Inagaki, Hiroyuki Nakagawa, Miwa Tanaka, Hiromi Kimoto-Nira, Toshimasa Yamazaki, Chise Suzuki

PLOS ONE 18(1) e0273955-e0273955 2023年1月5日査読有り
Genetic effects of Red Lettuce Leaf genes on red coloration in leaf lettuce under artificial lighting conditions

Kaede C. Wada, Noritoshi Inagaki, Hiroaki Sakai, Hiroto Yamashita, Yusuke Nakai, Zui Fujimoto, Jun‐ichi Yonemaru, Hironori Itoh

Plant-Environment Interactions 3(4) 179-192 2022年8月査読有り
Crystal structure of the ferredoxin reductase component of carbazole 1,9a-dioxygenase from Janthinobacterium sp. J3.

Yuji Ashikawa, Zui Fujimoto, Kengo Inoue, Hisakazu Yamane, Hideaki Nojiri

Acta crystallographica. Section D, Structural biology 77(Pt 7) 921-932 2021年7月1日査読有り
Tetramer formation of Bacillus subtilis YabJ protein that belongs to YjgF/YER057c/UK114 family.

Zui Fujimoto, Le Thi Thu Hong, Naomi Kishine, Nobuhiro Suzuki, Keitarou Kimura

Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry 85(2) 297-306 2021年2月18日査読有り筆頭著者
Structure-based substrate specificity analysis of GH11 xylanase from Streptomyces olivaceoviridis E-86.

Zui Fujimoto, Naomi Kishine, Koji Teramoto, Sosyu Tsutsui, Satoshi Kaneko

Applied Microbiology and Biotechnology 105(5) 1943-1952 2021年2月10日査読有り筆頭著者
Substrate Specificities of GH8, GH39, and GH52 β-xylosidases from Bacillus halodurans C-125 Toward Substituted Xylooligosaccharides.

Koji Teramoto, Sosyu Tsutsui, Tomoko Sato, Zui Fujimoto, Satoshi Kaneko

Applied Biochemistry and Biotechnology 193(4) 1042-1055 2021年1月4日査読有り
Unique active-site and subsite features in the arabinogalactan-degrading GH43 exo-β-1,3-galactanase from Phanerochaete chrysosporium.

Kaori Matsuyama, Naomi Kishine, Zui Fujimoto, Naoki Sunagawa, Toshihisa Kotake, Yoichi Tsumuraya, Masahiro Samejima, Kiyohiko Igarashi, Satoshi Kaneko

The Journal of Biological Chemistry 295(52) 18539-18552 2020年12月25日査読有り
Development of immunogenic chimeric virus-like particles based on bovine papillomavirus type 6.

Satoko Watanabe, Zui Fujimoto, Masaji Mase

Vaccine 38(49) 7774-7779 2020年11月17日査読有り

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MISC

ヘミセルラーゼの立体構造

藤本瑞

日本応用糖質科学会誌 14(3) 196-203 2024年8月20日査読有り招待有り
構造が解き明かす幼若ホルモンの血中輸送メカニズム

山崎俊正, 鈴木倫太郎, 藤本瑞, 塩月孝博, 門間充, 土屋渉

蚕糸・昆虫バイオテック = Sanshi-konchu biotec 81(2) 107-113 2012年8月1日
昆虫幼若ホルモンの輸送メカニズムの解明

鈴木倫太郎, 藤本瑞, 塩月孝博, 土屋渉, 門間充, 多勢祥, 宮澤光博, 山崎俊正

農業生物資源研究所主な研究成果 2011 18-19 2012年6月
環状イソマルトオリゴ糖グルカノトランスフェラーゼの分子解析と Bacillus circulans T-3040株における環状イソマルトオリゴ糖の新規な生合成経路の発見

舟根和美, 川端康之, 鈴木龍一郎, 藤本瑞, 北岡本光, 木村淳夫, 小林幹彦

応用糖質科学 1(2) 179-185 2011年10月招待有り
澱粉原料からのサイクロデキストラン製造技術の開発

舟根和美, 木村啓太郎, 鈴木龍一郎, 北岡本光, 儀部茂八, 渡嘉敷唯章, 川端康之, 小林幹彦, 藤本瑞, 木村敦夫

食品試験研究成果情報 (23) 30-31 2011年3月31日
Hormone Uptake and Release of JHBP Regulated by Opening and Closing of a Gate Helix on Ligand-Binding Pocket

SUZUKI Rintaro, FUJIMOTO Zui, SHIOTSUKI Takahiro, MOMMA Mitsuru, TASE Akira, TSUCHIYA Wataru, MIYAZAWA Mitsuhiro, YAMAZAKI Toshimasa

Peptide science : proceedings of the ... Japanese Peptide Symposium 2010 150-150 2011年3月1日
Electron transfer mechanism of carbazole 1,9a-dioxygenases

Takashi Umeda, Hiroki Aikawa, Yuji Ashikawa, Zui Fujimoto, Hisakazu Yamane, Hideaki Nojiri

JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY 150 S255-S255 2010年11月
Crystal structure of ADP bound motor domain of the rice kinesin K16 reveals a novel conformation

Shinsaku Maruta, Nobuhisa Umeki, Nozomi Umezu, Yuko Kubo, Zui Fujimoto, Toshiaki Mitsui

BIOPHYSICAL JOURNAL 497A-497A 2007年1月
Structural and functional analyses of C-terminal domain of the earthworm lectin EW29

A Kuno, T Ueda, R Suzuki, Z Fujimoto, T Hasegawa, K Kasai, J Hirabayashi

GLYCOBIOLOGY 14(11) 1107-1108 2004年11月
PFビームライン6Bおよび6CにおけるCocksfoot mottle virusのＸ線データ収集

難波一徳, 藤井佳史, 藤本瑞, 御子柴義郎, 水野洋

構造生物 7(2) 65-71 2001年
Crystal structure of coagulation factor X-binding protein complexed with the Gla domain

H Mizuno, Z Fujimoto, H Atoda, T Morita

THROMBOSIS AND HAEMOSTASIS 35-36 1999年8月
枯草菌由来α-アミラーゼの基質結合構造と触媒機構

藤本瑞, 高瀬研二, 堂井度子, 水野洋

生物物理 37 S20 1997年10月
Loop-exchanges dimer of coagulation factor IX/X-binding protein from venom of habu snake

H Mizuno, Z Fujimoto, M Koizumi, H Kano, H Atoda, T Morita

FASEB JOURNAL 11(9) A906-A906 1997年7月
Crystallographic study of the Bacillus subtilis alpha-amylase-substrate complex

Z Fujimoto, K Takase, N Doui, M Momma, T Matsumoto, T Tsukihara, H Mizuno

FASEB JOURNAL 11(9) A1145-A1145 1997年7月
CRYSTALLOGRAPHIC STUDIES OF CATALYTIC-SITE MUTANT alpha-AMYLASE FROM BACILLUS SUBTILIS.

H. Mizuno, N. Doui, Z. Fujimoto, T. Matsumoto, K. Takase

ACTA CRYSTALLOGRAPHICA A-FOUNDATION AND ADVANCES 52 C237-C237 1996年

書籍等出版物

Glycoside Hydrolases Biochemistry, Biophysics and Biotechnology

Satoshi Kaneko, Zui Fujimoto (担当:分担執筆, 範囲:Chapter 16: α-L-Rhamnosidases: Structures, substrate specificities, and their applications)

Academic Press 2023年 (ISBN: 9780323918053)
Glycoside Hydrolases Biochemistry, Biophysics and Biotechnology

Satoshi Kaneko, Zui Fujimoto (担当:分担執筆, 範囲:Chapter 8: β-D-Xylosidases: Structure-based substrate specificities and their applications)

2023年 (ISBN: 9780323918053)
Amino-Acid Homopolymers Occurring in Nature

Kimura K, Fujimoto Z (担当:分担執筆, 範囲:Enzymatic degradation of poly-gamma-glutamic acid.)

Springer 2010年

主要な講演・口頭発表等

106

Crystal structure of the novel GH31 enzyme named dextran glucanase from Paenibacillus sp. 598K

Momma M, Suzuki N, Fujimoto Z, Ichinose H, Funane K

10th Carbohydrate Bioengineering Meeting 2013年4月
Crystal structure of GH66 cycloisomaltooligosaccharide glucanotransferase from Bacillus circulans T-3040

Suzuki N, Fujimoto Z, Momma M, Kim Y-M, Kimura A, Funane K

10th Carbohydrate Bioengineering Meeting 2013年4月
Mutation analysis of poly-γ-DL-glutamic acid hydrolase (PghP) from Bacillus subtilis bacterio- phage φNIT1

Kimura K, Nguyen HN, Funane K, Fujimoto Z

International Union of Microbiological Societies 2011 Congress 2011年9月
植物多糖に作用する糖質分解酵素の構造生物学的研究

藤本瑞

日本農芸化学会2010年度大会 2010年3月
An exo-1,5-α-L-arabinofuranosidase from Streptomyces avermitilis: structure and enzymology of a modular enzyme of exo-1,5-α-L-arabinofuranosidase (GH43) and arabinan binding module (CBM42)

藤本瑞

The 2008 Plant Polysaccharide Workshop 2008年8月
How the ricin-type lectin fold recognize the xylan and xylooligosaccharides? Crystal structure of the Streptomyces olivaceoviridis E-86 xylanase

Fujimoto Z, Kaneko S, Kuno A, Kobayashi H, Kusakabe I, Mizuno H

21st International Lectin Meeting 2004年5月
Crystal structure of riceα-galactosidase in complex with D-galactose

Fujimoto Z, Kaneko S, Momma M, Kobayashi H, Mizuno H

5th Carbohydrate Bioengineering Meeting 2003年4月
Crystal structure of Irpex lacteus aspartic proteinase complexed with the inhibitor pepstatin

Fujimoto Z, Fujii Y, Kaneko S, Kobayashi H, Mizuno H

19th Congress and general assembly of the international union of crystallography 2002年7月
The atomic structure of a double shelled virus, rice dwarf virus

Nakagawa A, Mizyazaki N, Taka J, Naitow H, Ogawa A, Fujimoto Z, Mizuno H, Higashi T, Watanabe Y, Ohmura T, Holland CR, Tsukihara T

19th Congress and general assembly of the international union of crystallography 2002年7月
Crystal structure of the sugar complexes of xylanase which utilizes a galactose-binding lectin domain to bind xylan

Fujimoto Z, Kuno A, Kaneko S, Kusakabe I, Mizuno H

20th International Carbohydrate symposium 2000年8月
Structural comparison of the ricin-type lectin in plant toxin ricin and xylanase

Fujimoto Z, Kuno A, Kaneko S, Kusakabe I, Mizuno H

18th International Congress of Biochemistry and Molecular Biology 2000年7月
Crystal structure of maltopentaose bound in the catalytic-site mutant α-amylase from Bacillus subtilis and catalytic mechanism

Fujimoto Z, Takase K, Doui N, Mizuno H

19th International Carbohydrate symposium 1998年8月

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所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

食糧循環と地球温暖化対策の両立を目指す新規な分子標的硝化抑制剤の開発

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2014年7月 - 2017年3月

山崎俊正, 藤原健智, 藤本瑞
イネ顆粒デンプン合成酵素によるデンプン合成反応機構の解明

科学研究費補助金 2014年 - 2017年
酵素の立体構造解析によるイソマルトメガロ糖認識機構の解明

農林水産省農林水産業・食品産業科学技術研究推進事業 2013年 - 2014年
ＳＵＭＯ転移反応におけるダイナミズムの精密解析と生物種特異性の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2011年 - 2013年

山崎俊正, 藤本瑞, 鈴木倫太郎
酵素の立体構造解析によるイソマルトメガロ糖認識機構の解明

生物系特定産業技術研究支援センターイノベ-ション創出基礎的研究推進事業 2009年 - 2013年
ポリ－γ－グルタミン酸加水分解酵素の立体構造解析及び基質認識機構の解明

日本学術振興会科学研究費補助金若手研究(B) 2007年 - 2010年

藤本瑞
糸状菌由来α-ガラクトシダーゼの結晶構造解析及び基質認識機構の解明

日本学術振興会科学研究費補助金若手研究(B) 2004年 - 2007年

藤本瑞

藤本瑞

基本情報

研究キーワード

研究分野

経歴

学歴

受賞

論文

MISC

書籍等出版物

主要な講演・口頭発表等

所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

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