菊地浩人 (Kikuchi Hiroto) - マイポータル

基本情報

研究者番号: 00224907
J-GLOBAL ID: 201801005782155229
researchmap会員ID: B000295205

研究分野

経歴

2007年4月 - 現在

日本医科大学, 医学部, 准教授
2004年4月 - 2007年3月

日本医科大学, 医学部, 助教授
1996年4月 - 2004年3月

日本医科大学, 医学部, 講師
1991年4月 - 1996年3月

日本医科大学, 医学部, 助手
1990年4月 - 1991年3月

早稲田大学, 理工学部, 助手

委員歴

1994年10月 - 1996年10月

日本物理学会, 日本物理学会誌編集委員会新著紹介小委員会委員
1992年5月 - 1993年4月

日本物理学会, 生体物理分科世話人

主要な論文

Redshifting and Blueshifting of β82 Chromophores in the Phycocyanin Hexamer of Porphyridium purpureum Phycobilisomes Due to Linker Proteins

Hiroto Kikuchi

Life 12(11) 1833-1833 2022年11月9日査読有り筆頭著者責任著者
188

Functional roles of the hexamer structure of C‐phycocyanin revealed by calculation of absorption wavelength

Hiroto Kikuchi

FEBS Open Bio 10(11) 1-9 2020年11月29日査読有り筆頭著者責任著者
916

汎用性ある分子振動のB行列作成方法と力定数の座標変換方法に関する考察

菊地浩人

日本医科大学基礎科学紀要 (42) 37-85 2013年9月筆頭著者最終著者責任著者
178

Different inhibitory potency of febuxostat towards mammalian and bacterial xanthine oxidoreductases: insight from molecular dynamics

Hiroto Kikuchi, Hiroshi Fujisaki, Tadaomi Furuta, Ken Okamoto, Silke Leimkuehler, Takeshi Nishino

SCIENTIFIC REPORTS 2 srep00331-1-srep00331-8 2012年3月査読有り筆頭著者責任著者
143

理論生物物理と生化学を組み合わせた薬効研究キサンチン酸化還元酵素と阻害剤フェブキソスタットの結合機序

藤崎弘士, 古田忠臣, 岡本研, 菊地浩人

日本医科大学医学会雑誌 8(3) 222-227 2012年査読有り
溶媒中にある励起分子からの一光子発光に対する理論的アプローチ―基本方程式の導出―

梅崎馨章, 菊地浩人, 小田井圭

Proc Sch Sci Tokai Univ 43 107-125 2008年3月査読有り
222

Molecular analysis of TCR and peptide/MHC interaction using P18-I10-derived peptides with a single D-amino acid substitution

Yohko Nakagawa, Hiroto Kikuchi, Hidemi Takahashi

BIOPHYSICAL JOURNAL 92(7) 2570-2582 2007年4月査読有り
スペクトル形状関数の定式化‐分子の構造変化及び力定数の変化による表現―

梅崎馨章, 菊地浩人

Proc Sch Sci Tokai Univ 41 83-104 2006年3月査読有り
178

A line-shape function in terms of changes in both molecular structure and force constants: A Gaussian approximation

K Umesaki, H Kikuchi

JOURNAL OF CHEMICAL PHYSICS 124(7) 074304-1-074304-11 2006年2月査読有り責任著者
248

Computational method for calculating multidimensional Franck-Condon factors: Based on Sharp-Rosenstock's method

H Kikuchi, M Kubo, N Watanabe, H Suzuki

JOURNAL OF CHEMICAL PHYSICS 119(2) 729-736 2003年7月査読有り筆頭著者責任著者
244

Significance of a two-domain structure in subunits of phycobiliproteins revealed by the normal mode analysis

H Kikuchi, H Wako, K Yura, M Go, M Mimuro

BIOPHYSICAL JOURNAL 79(3) 1587-1600 2000年9月査読有り筆頭著者責任著者
1235

生体分子における励起エネルギー移動機構に対する理論的考察 : Forster 公式の検討と拡張へ向けて

梅崎馨章, 菊地浩人

日本医科大学基礎科学紀要 28 1-21 2000年6月査読有り責任著者
シアノバクテリアの集光性超分子会合体,フィコビリソーム

三室守, 村上明男, 菊地浩人

蛋白質核酸酵素 42(16) 2613-2625 1997年12月
183

An electronic state of the chromophore, phycocyanobilin, and its interaction with the protein moiety in C-phycocyanin: protonation of the chromophore

H Kikuchi, T Sugimoto, M Mimuro

CHEMICAL PHYSICS LETTERS 274(5-6) 460-465 1997年8月査読有り筆頭著者責任著者
174

Dynamical theory of photoisomerization of the rhodopsin chromophore: Generation of a transient electric field during photoisomerization

H Kikuchi, H Suzuki

JOURNAL OF PHYSICAL CHEMISTRY B 101(31) 6050-6056 1997年7月査読有り筆頭著者責任著者
128

Dynamical theory of the photoisomerization of rhodopsin chromophore. II: How to calculate the integrals related with transient π-electronic states

H. Kikuchi, K. Odai, H. Suzuki

J. Phys. Soc. Jpn. 64(3) 1011-1022 1995年3月査読有り筆頭著者責任著者
54

Dynamical theory of the photoisomerization of rhodopsin Chromophore. I: Calculations of the transition probability

H. Kikuchi, H. Suzuki

J. Phys. Soc. Jpn. 61(6) 1946-1959 1992年査読有り筆頭著者責任著者

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MISC

分子動力学を用いたアセチルベンゾニトリルからクロロフォルム溶媒へのエネルギー移動の計算

菊地浩人, 藤崎弘士

日本物理学会講演概要集(CD-ROM) 74(2) 2019年
溶媒中のアセチルベンゾニトリルにおけるエネルギー移動:非平衡MDによる計算

菊地浩人, 藤崎弘士

日本物理学会講演概要集(CD-ROM) 73(2) 2018年
キサンチン酸化還元酵素 : 物理学から臨床医学まで

岡本研, 菊地浩人

日本医科大学基礎科学紀要 = The Bulletin of liberal arts & sciences, Nippon Medical School (46) 37-69 2017年12月
キサンチン酸化還元酵素基質結合ポケットの動的解析

岡本研, 菊地浩人, 藤崎弘士, 古田忠臣, 西野武士

日本痛風・核酸代謝学会総会プログラム・抄録集 49th 78 2016年
ヒトには効くがバクテリアには効かない痛風薬－酵素と阻害剤BOFとの相互作用ダイナミクス－

菊地浩人, 藤崎弘士, 古田忠臣, 岡本研, 西野武士

日本物理学会講演概要集 71 3119-3119 2016年
キサンチン酸化還元酵素の基質ガイド機構の解析

岡本研, 菊地浩人, 藤崎弘士, 古田忠臣, 西野武士

日本生化学会大会(Web) 88th 3P0460 (WEB ONLY) 2015年
MDシミュレーションによるキサンチン酸化還元酵素基質結合ポケットゲート部位の揺らぎの解析

岡本研, 菊地浩人, 藤崎弘士, 古田忠臣, 西野武士

日本生化学会大会(Web) 87th 2P-496 (WEB ONLY) 2014年
生体分子の分子動力学時系列データに対する統計解析 4

戸田幹人, 高見利也, 福水健次, 菊地浩人, 藤崎弘士

日本物理学会講演概要集 68(1) 463 2013年3月5日
29pXZD-9 生体分子の分子動力学時系列データに対する統計解析4(29pXZD 領域12,領域11合同生物合同セッション(データ解析など),領域12(ソフトマター物理,化学物理,生物物理))

戸田幹人, 高見利也, 福水健次, 菊地浩人, 藤崎弘士

日本物理学会講演概要集 68 463-463 2013年
抗痛風薬フェブキソスタットとキサンチン酸化還元酵素との動的相互作用の解析

岡本研, 菊地浩人, 藤崎弘士, 古田忠臣, 西野武士

日本痛風・核酸代謝学会総会プログラム・抄録集 46th(1) 49-19 2013年
生体分子の分子動力学時系列データに対する統計解析 3

戸田幹人, 高見利也, 福水健次, 菊地浩人, 藤崎弘士

日本物理学会講演概要集 67(2) 337 2012年8月24日
分子階層モデルを使った量子ダイナミクス III

藤崎弘士, 菊地浩人, 戸田幹人, 高見利也

日本物理学会講演概要集 67(2) 342 2012年8月24日
分子階層モデルを使った量子ダイナミクス II

藤崎弘士, 菊地浩人, 戸田幹人, 高見利也

日本物理学会講演概要集 67(1) 413 2012年3月5日
生体分子の分子動力学時系列データに対する統計解析 2

戸田幹人, 高見利也, 福水健次, 菊地浩人, 藤崎弘士

日本物理学会講演概要集 67(1) 391 2012年3月5日
抗痛風薬フェブキソスタットとキサンチン酸化還元酵素との相互作用の動的解析

岡本研, 菊地浩人, 藤崎弘士, 古田忠臣, 西野武士

日本生化学会大会(Web) 85th 2T08-04 (WEB ONLY) 2012年
20pAK-11 分子階層モデルを使った量子ダイナミクスIII(20pAK 化学物理2,領域12(ソフトマター物理,化学物理,生物物理))

藤崎弘士, 菊地浩人, 戸田幹人, 高見利也

日本物理学会講演概要集 67 342-342 2012年
20pAB-4 生体分子の分子動力学時系列データに対する統計解析3(20pAB 生物物理,領域12(ソフトマター物理,化学物理,生物物理))

戸田幹人, 高見利也, 福水健次, 菊地浩人, 藤崎弘士

日本物理学会講演概要集 67 337-337 2012年
26pAH-7 分子階層モデルを使った量子ダイナミクスII(26pAH 溶液・液体2 量子系・光合成,領域12(ソフトマター物理,化学物理,生物物理))

藤崎弘士, 菊地浩人, 戸田幹人, 高見利也

日本物理学会講演概要集 67 413-413 2012年
24pAA-5 生体分子の分子動力学時系列データに対する統計解析2(24pAA 生物物理,領域12(ソフトマター物理,化学物理,生物物理))

戸田幹人, 高見利也, 福水健次, 菊地浩人, 藤崎弘士

日本物理学会講演概要集 67 391-391 2012年
分子階層モデルを使った生体分子の量子ダイナミクス

藤崎弘士, 菊地浩人, 戸田幹人, 高見利也

日本物理学会講演概要集 66(2) 309 2011年8月24日

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主要な書籍等出版物

Antenna systems and energy transfer in cyanophyta and rhodophyta. In: Light-harvesting Antennas in Photosynthesis edited by B. R. Green and W. W. Parson. Advanced in Photosynthesis and Respiration: Series Editor Govindjee

M. Mimuro, H. Kikuchi (担当:分担執筆, 範囲:pp. 281-306)

Springer, The Netherlands 2003年 (ISBN: 9780792363354)
Structure and Function of Phycobilisome. In: Concepts in Photobiology: Photosynthesis and Photomorphogenesis edited by G. S. Singhal, G. Renger, S.K. Sopory, K-D. Irrgang and Govindjee

Mamoru MIMURO, Hiroto KIKUCHI, Akio MURAKAMI (担当:分担執筆, 範囲:pp. 104-135)

Springer, The Netherlands 1999年 (ISBN: 9789401148320, 9789401060264)

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共同研究・競争的資金等の研究課題

基盤研究（Ｃ）[研究代表者]「ヒトには効くがバクテリアには効かない痛風薬 ―酵素薬剤相互作用のダイナミクス―」

文科省科学研究費補助金 2014年4月 - 2017年3月

菊地浩人
基盤研究（Ｃ）[研究代表者]「キサンチン酸化還元酵素における阻害剤の研究 ―「鍵と鍵穴」のドグマを超えて―」

文科省科学研究費補助金 2011年4月 - 2013年3月

菊地浩人
基盤研究（Ｃ）[研究分担者]「生体分子の量子ダイナミクス:その理論的解明と制御」

文科省科学研究費補助金 2010年4月 - 2013年3月

藤崎弘士
基盤研究（Ａ） [研究分担者] 「モリブデン金属酵素の微細構造と水酸化反応機構・蛋白質揺らぎの解明」

文科省科学研究費補助金 2004年4月 - 2008年3月

西野武士
萌芽的研究 [研究分担者] 「基準振動解析による蛋白質の構造の必然性の解明―光合成系を例にして」

文部省科学研究費補助金 1999年4月 - 2001年3月

三室守
基盤研究（Ａ）[研究分担者]「蛋白質集合体の対称性の起源と系譜－機能的要請か、系統性か」

文部省科学研究費補助金 1996年4月 - 1998年3月

三室守