樋口芳樹 (Yoshiki Higuchi) - マイポータル

基本情報

所属: 兵庫県立大学理学研究科特任教授

学位: 理学博士(1984年3月大阪大学)

J-GLOBAL ID: 200901089463368472
researchmap会員ID: 1000057791

外部リンク: http://www.sci.u-hyogo.ac.jp/life/biophys1/index-j.html

1979年 3月 大阪大学理学部卒業
1984年 3月 大阪大学大学院理学研究科博士後期課程修了（理学博士）
1984年 4月 日本学術振興会特定領域奨励研究員（大阪大学蛋白質研究所、昭和60年10月31日まで）
1985年11月 姫路工業大学工学基礎研究所助手（1987年4月講師）
1987年 9月 兵庫県在外研究員 米国アリゾナ大学生化学教室客員教授1992年12月末まで）
1990年 4月 姫路工業大学理学部講師（1992年4月助教授）
1995年10月 京都大学大学院理学研究科助教授
2002年 4月 姫路工業大学大学院理学研究科教授
2004年 4月 兵庫県立大学大学院生命理学研究科教授
2013年 4月 公立学校法人・兵庫県立大学大学院生命理学研究科教授
2020年 4月 同 副学長 兼 総合教育機構長
2021年 4月 兵庫県公立大学法人・兵庫県立大学 理事・副学長 兼 大学院理学研究科教授
2022年 4月 兵庫県公立大学法人・兵庫県立大学 理事・副学長 兼 学術総合情報センター長
2023年 4月 兵庫県公立大学法人・兵庫県立大学 名誉教授　特任教授（総合教育機構）（現在に至る）

研究キーワード

研究分野

委員歴

2012年1月 - 現在

国際蛋白質科学会, Protein Science誌編集アドバイザー
2003年 - 現在

日本生化学会, 評議員
2010年4月 - 2023年3月

日本結晶学会, 評議員
1996年4月 - 1998年3月

日本生物物理学会, 編集委員,幹事
1994年4月 - 1996年3月

日本結晶学会, 編集委員

受賞

2022年12月

兵庫県教育功労者表彰（知事表彰）, 大学教育, 兵庫県

樋口芳樹
2020年4月

文部科学大臣表彰, ヒドロゲナーゼの水素代謝分子機構の構造基盤解明の研究, 文部科学省

樋口芳樹
2017年11月

兵庫県科学賞, ヒドロゲナーゼの構造生物学, 兵庫県

樋口芳樹
2014年10月

第３８回井植文化賞, X線結晶解析法によるタンパク質の構造解明とその応用, 公益財団井植記念会

樋口芳樹
1999年11月

日本結晶学会賞, ヒドロゲナーゼのX線結晶解析, 日本結晶学会

樋口芳樹

論文

222

Structure and function relationship of formate dehydrogenases: an overview of recent progress

Ami Kobayashi, Midori Taketa, Keisei Sowa, Kenji Kano, Yoshiki Higuchi, Hideaki Ogata

IUCrJ 10(5) 544-554 2023年9月1日査読有り招待有り責任著者
New insights into the oxidation process from neutron and X-ray crystal structures of an O₂-sensitive [NiFe]-hydrogenase

Takeshi Hiromoto, Koji Nishikawa, Seiya Inoue, Hideaki Ogata, Yuta Hori, Katsuhiro Kusaka, Yu Hirano, Kazuo Kurihara, Yasuteru Shigeta, Taro Tamada …

Chemical Science 35(14) 9306-9315 2023年8月査読有り最終著者責任著者
X‐ray crystallographic and mutational analysis of the <scp>NylC</scp> precursor: Catalytic mechanism of autocleavage and substrate hydrolysis of nylon hydrolase

Seiji Negoro, Naoki Shibata, Dai‐ichiro Kato, Yusuke Tanaka, Kengo Yasuhira, Keisuke Nagai, Shohei Oshima, Yoko Furuno, Risa Yokoyama, Kaito Miyazaki …

The FEBS Journal 2023年2月17日査読有り最終著者
Reversible Glutamate Coordination to High-Valent Nickel Protects the Active Site of a [NiFe] Hydrogenase from Oxygen

Catharina J. Kulka-Peschke, Anne-Christine Schulz, Christian Loren, Yvonne Rippers, Stefan Wahlefeld, Janina Preissler, Claudia Schulz, Charlotte Wiemann, Cornelius C. M. Bernitzky, Chara Karafoulidi-Retsou …

Journal of the American Chemical Society 144(37) 17022-17032 2022年9月21日査読有り
Structural Insights into the Very Low Activity of the Homocoenzyme B ₁₂ Adenosylmethylcobalamin in Coenzyme B ₁₂ ‐Dependent Diol Dehydratase and Ethanolamine Ammonia‐Lyase

Naoki Shibata, Yoshiki Higuchi, Bernhard Kräutler, Tetsuo Toraya

Chemistry – A European Journal e202202196(65) e202202196 2022年9月19日査読有り
Structural and spectroscopic characterization of CO inhibition of [NiFe]-hydrogenase from Citrobacter sp. S-77.

Takahiro Imanishi, Koji Nishikawa, Midori Taketa, Katsuhiro Higuchi, Hulin Tai, Shun Hirota, Hironobu Hojo, Toru Kawakami, Kiriko Hataguchi, Kayoko Matsumoto …

Acta crystallographica. Section F, Structural biology communications 78(Pt 2) 66-74 2022年2月1日査読有り最終著者責任著者
Experimental and theoretical study on converting myoglobin into a stable domain-swapped dimer by utilizing a tight hydrogen bond network at the hinge region

Cheng Xie, Hiromitsu Shimoyama, Masaru Yamanaka, Satoshi Nagao, Hirofumi Komori, Naoki Shibata, Yoshiki Higuchi, Yasuteru Shigeta, Shun Hirota

RSC Advances 11(59) 37604-37611 2021年11月査読有り
The Challenge of Visualizing the Bridging Hydride at the Active Site and Proton Network of [NiFe]-Hydrogenase by Neutron Crystallography

Takeshi Hiromoto, Koji Nishikawa, Taro Tamada, Yoshiki Higuchi

Topics in Catalysis 64(9-12) 622-630 2021年8月査読有り招待有り最終著者責任著者
Rational design of metal-binding sites in domain-swapped myoglobin dimers

Satoshi Nagao, Ayaka Idomoto, Naoki Shibata, Yoshiki Higuchi, Shun Hirota

Journal of Inorganic Biochemistry 217 111374-111374 2021年4月査読有り
Towards cryogenic neutron crystallography on the reduced form of [NiFe]-hydrogenase

Takeshi Hiromoto, Koji Nishikawa, Seiya Inoue, Hiroaki Matsuura, Yu Hirano, Kazuo Kurihara, Katsuhiro Kusaka, Matthew Cuneo, Leighton Coates, Taro Tamada …

Acta Crystallographica Section D Structural Biology 76(10) 946-953 2020年10月1日査読有り最終著者責任著者
Thermodynamic control of domain swapping by modulating helical propensity in the hinge region of myoglobin

Satoshi Nagao, Ayaka Suda, Hisashi Kobayashi, Naoki Shibata, Yoshiki Higuchi, Shun Hirota

Chemistry – An Asian Journal 15 1743-1749 2020年4月査読有り
3D domain swapping of azurin from Alcaligenes xylosoxidans

Robby Noor Cahyono, Masaru Yamanaka, Satoshi Nagao, Naoki Shibata, Yoshiki Higuchi, Shun Hirota

Metallomics 12(3) 337-345 2020年査読有り
Structural Basis of the Function of [NiFe]-hydrogenases

K. Nishikawa, H. Ogata, Y. Higuchi

Chemistry Letters 49(2) 164-173 2020年1月査読有り最終著者責任著者
Wnt Signaling to β-catenin Depends on a Direct Heterotypic Interaction Between the DIX Domains of Dishevelled and Axin

K. Yamanishi, M. Fiedler, S. Terawaki, Y. Higuchi, M. Bienz, N. Shibata

Science Signalling 12(611) 2019年12月10日査読有り責任著者
NAD+-reducing [NiFe]-hydrogenase

Y. Shomura, Y. Higuchi

Encyclopedia of Inorganic and Bioinorganic Chemistry 2019年12月査読有り招待有り最終著者責任著者
Protein surface charge effect on 3D domain swapping in cells for c-type cytochromes

H. Yang, M. Yamanaka, S. Nagao, K. Yasuhara, N. Shibata, Y. Higuchi, S. Hirota

Biochim. Biophys. Acta. 1867(11) 140265-140273 2019年9月査読有り
Cysteine SH and glutamate COOH contributions to [NiFe] hydrogenase proton transfer revealed by highly sensitive FT-IR spectroscopy

H. Tai, K. Nishikawa, Y. Higuchi, Z-w. Mao, S. Hirota

Angew. Chem. Int. Ed. 58(38) 13285-13290 2019年9月査読有り
Structural Changes of the Trinuclear Copper Center in Bilirubin Oxidase upon Reduction

Tokiwa, Takaki, Shoji, Mitsuo, Sladek, Vladimir, Shibata, Naoki, Higuchi, Yoshiki, Kataoka, Kunishige, Sakurai, Takeshi, Shigeta, Yasuteru, Misaizu, Fuminori

Molecules (Basel, Switzerland) 24(1) 2019年1月査読有り
Head-to-Tail Complex of Dishevelled and Axin-DIX Domains: Expression, Purification, Crystallographic Studies and Packing Analysis.

Kumpei Yamanishi, Wataru Kumano, Shin-Ichi Terawaki, Yoshiki Higuchi, Naoki Shibata

Protein and peptide letters 26(10) 792-797 2019年査読有り
New Assay Method Based on Raman Spectroscopy for Enzymes Reacting with Gaseous Substrates

Y. K. Nakagawa, K. Nishikawa, S. Nakashima, S. Inoue, T. Ohta, T. Ogura, Y. Shigeta, K. Fukutani, T. Yagi, Y. Higuchi

Protein Science 29 663-670 2019年1月査読有り最終著者責任著者

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MISC

ナイロン分解酵素NylB の構造進化，触媒機構とアミド合成への応用

根来誠司, 武尾正弘, 柴田直樹, 樋口芳樹, 加藤太一郎, 重田育照

月刊バイオインダストリー 36(6) 2019年6月招待有り
X 線結晶構造に基づくB12 補酵素がラジカル酵素反応を制御する仕組みの解明

柴田直樹, 末吉由依, 樋口芳樹, 虎谷哲夫

放射光 33(1) 33-42 2019年1月査読有り招待有り
[NiFe]ヒドロゲナーゼがもつ鉄硫黄クラスターによる酸素防御機構

庄村康人, 樋口芳樹

生物物理 58(6) 2018年12月査読有り招待有り
Crystal structures of the NAD+-reducing soluble [NiFe]-hydrogenase

庄村康人, 樋口芳樹

SPring-8 SACLA リサーチフロンティア 2017 2017 26-27 2018年8月査読有り招待有り
NAD+還元[NiFe]ヒドロゲナーゼのレドックススイッチ機構の構造基盤の解明

庄村康人, 樋口芳樹

ライフサイエンス新着レビュー 2017 2017年11月招待有り
ヒドロゲナーゼによる水素分解・合成機構および酵素燃料電池への応用

廣田俊, 加納健司, 樋口芳樹

バイオインダストリー 33(1) 43-48 2016年1月査読有り招待有り
タンパク質立体構造散歩「翻訳終結因子」

木平清人, 樋口芳樹

生物物理 55(2) 117-227 2015年3月査読有り招待有り
Change in structure and ligand binding properties of hyperstable cytochrome c555 from Aquifex aeolicus by domain swapping

Yamanaka Masaru, Nagao Satoshi, Komori Hirofumi, Higuchi Yoshiki, Hirota Shun

2015年3月1日
水素酸化触媒ヒドロゲナーゼにおける電流-電圧曲線へのこだわり

宋慶盛, 北隅優希, 白井理, 樋口芳樹, 加納健司

Review of Polarography 61(3) 2015年
Rational Design of Heterodimeric Protein using Domain Swapping for Myoglobin

Lin Ying-Wu, Nagao Satoshi, Zhang Mohan, Shomura Yasuhito, Higuchi Yoshiki, Hirota Shun

2014年11月4日
Control of the Transition between Ni-C and Ni-SIa States by the Redox State of the Proximal Fe-S Cluster in the Catalytic Cycle of [NiFe] Hydrogenase

Tai Hulin, Nishikawa Koji, Suzuki Masayuki, Higuchi Yoshiki, Hirota Shun

2014年10月8日
立体構造を基盤としたナイロン加水分解酵素の開発と耐熱化機構

根来誠司, 永井圭介, 大島祥平, 飯田一希, 加藤太一郎, 武尾正弘, 持地広造, 柴田直樹, 樋口芳樹

酵素工学ニュース 69 12-18 2013年4月査読有り招待有り
膜結合型ヒドロゲナーゼの酸素耐性機構の解明

庄村康人, 樋口芳樹

生物物理 53(2) 82-85 2013年4月査読有り招待有り
2P-044 分子動力学シミュレーションによるナイロン加水分解酵素(NylC)の自己分断機構の解析(酵素学,酵素工学,一般講演)

永井圭介, 大島祥平, 柴田直樹, 樋口芳樹, 馬場剛史, 重田育照, 加藤太一郎, 武尾正弘, 根来誠司

日本生物工学会大会講演要旨集 65 114-114 2013年
シトクロムc ポリマー：水溶性球状タンパク質に見出された多量化機構

廣田俊, 樋口芳樹

日本結晶学会誌 54(5) 270-275 2012年10月査読有り招待有り
Crystal structure of O2-tolerant [NiFe] hydrogenase reveals the mechanism of O2-tolerance attributable to a redox-dependent conformational change of [4Fe-3S] cluster

SHOMURA Yasuhito, HIGUCHI Yoshiki

SPring-8 リサーチフロンティア 2011 2012年7月査読有り招待有り
4Fe-3S］クラスターによる［NiFe］ヒドロゲナーゼの酸素耐性機構の構造基盤

庄村康人, 樋口芳樹

SPring-8利用者情報誌 17(2) 105-110 2012年4月査読有り招待有り
酸素耐性ヒドロゲナーゼの構造化学的研究－酵素分子に見出された活性保護機構－

樋口芳樹, 庄村康人

燃料電池 11(4) 43-48 2012年4月招待有り
ヒドロゲナーゼの新規酸素耐性機構 -膜結合型[NiFe]ヒドロゲナーゼ

庄村康人, 樋口芳樹

化学 67 70-71 2012年4月招待有り
新規の鉄-硫黄クラスターが生み出すヒドロゲナーゼの酸素耐性機構

庄村康人, 樋口芳樹

ライフサイエンス新着レビュー (2011) 2011年10月招待有り

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書籍等出版物

ハイドロジェノミクス：水素を使いこなす

堀優太, 西川幸志, 重田育照, 樋口芳樹 (担当:分担執筆, 範囲:生物酵素およびヒドロゲナーゼ)

共立出版 2023年3月28日
生命金属ダイナミクス : 生体内における金属の挙動と制御

古川良明, 神戸大朋, 城宜嗣, 津本浩平 (担当:共著, 範囲:水素酸化還元酵素ヒドロゲナーゼ)

エヌ・ティー・エス 2021年1月20日 (ISBN: 9784860437060)
イメージング時代の構造生命科学 : 細胞の動態、膜のないオルガネラ、分子の構造変化をトランススケールに観る

樋口芳樹 (担当:分担執筆, 範囲:生物のエネルギー代謝酵素の分子進化)

羊土社実験医学増刊 2020年3月 (ISBN: 9784758103855)
進化を続ける構造生物学

樋口芳樹 (担当:分担執筆, 範囲:電子密度分布は構造の全てを語る)

化学同人 2014年7月 (ISBN: 9784759815153)
構造生命科学で何がわかるのか,何ができるのか : 最先端のタンパク質解析技術から構造情報の活用事例,創薬展開まで

樋口芳樹

羊土社実験医学増刊 2014年6月 (ISBN: 9784758103398)
CSJカレントレビュー15，次世代のバイオ水素エネルギー開発

庄村康人, 樋口芳樹 (担当:共著, 範囲:ヒドロゲナーゼの酸素による不活性化およびその耐性機構)

化学同人 2014年3月 (ISBN: 9784759813753)
光合成のエネルギー利用と環境応用

樋口芳樹 (担当:分担執筆, 範囲:ヒドロゲナーゼ)

シーエムシー出版 2014年1月 (ISBN: 9784781309279)
Molecular Solar Biofuels

LUBITZ, Wolfgang, 緒方英明, REIJERSE Edward, 樋口芳樹 (担当:分担執筆, 範囲:Structural and Functional Features of Hydrogenase Enzymes)

Royal Society Chemistry, 2011年 (ISBN: 9781849730341)
構造生物学

樋口芳樹, 中川敦史 (担当:編者(編著者))

2010年4月 (ISBN: 9784320057012)
Structural Basis of Dynamic Polymerization of DIX Domains: Revised Model of Wnt Signaling (SPring-8 Research Frontiers 2007)

SPring-8 2008年
バイオ電気化学の実際・酵素工学の実際

緒方英明, 樋口芳樹 (担当:分担執筆, 範囲:ヒドロゲナーゼ)

シーエムシー出版 2007年3月 (ISBN: 9784882316794)
EPR in the 21th Century

W. Lubitz, M. Brecht, S. Foerster, M. Stein, Y. Higuchi, T. Buhrke, B. Friedrich (担当:分担執筆, 範囲:EPR and theoretical investigations of [NiFe] hydrogenase: Insight into the mechanism of biological hydrogen conversion)

Elsevier 2002年
水素の物性・反応の機能性化と応用－生体反応：ヒドロゲナーゼ

樋口芳樹 (担当:分担執筆, 範囲:生体反応・ヒドロゲナーゼ)

アイピーシー 2001年
Hydrogen as a fuel: Learning from Nature

樋口芳樹 (担当:分担執筆, 範囲:Molecular architectures)

Taylor and Franc publishers 2001年 (ISBN: 9780415242424)
Hydrogen as a fuel: Learning from Nature -Molecular architectures

Taylor and Franc publishers 2001年
廣川タンパク質化学・ヒドロゲナーゼ４巻

樋口芳樹 (担当:分担執筆, 範囲:ヒドロゲナーゼのX線結晶解析)

広川書店 2000年2月 (ISBN: 4567160401)
Hydrogenases, Protein Chemistry -Oxidoreductase

2000年
化学者のための基礎講座12．Ｘ線構造解析・タンパク質のＸ線構造解析

三木邦夫, 田中勲, 樋口芳樹, 中川敦史 (担当:分担執筆, 範囲:タンパク質のＸ線構造解析)

朝倉書店 1999年3月 (ISBN: 9784254145946)
Method in Enzymology (Hexadecaheme Cytochrome c)

Elsevier 1994年
Synchrotron Radiation in the Biosciences (Structure Study of Hydrogenase and Related Proteins in Sulfate-reducing Bacteria)

樋口芳樹, 森本幸生, 岬慎太郎, 中川敦史, 伊中浩治, 安岡則武 (担当:分担執筆, 範囲:Structure Study of Hydrogenase and Related Proteins in Sulfate-reducing Bacteria)

Oxford University Press 1994年 (ISBN: 019853986X)

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講演・口頭発表等

Structural Studies on [NiFe]-hydrogenases-Role of water/proton-network for O2-stability

樋口芳樹

3rd International Solar Fuels Conference (ISF-3) and International Conference on Artificial Photosynthesis-2019 (ICARP2019) 2019年11月21日招待有り
Role of water network for O2-stability of [NiFe]-hydrogenases

樋口芳樹

12th International Hydrogenase Conference 2019 2019年4月1日招待有り
Structural study on [NiFe]-hydrogenases

樋口芳樹

I2CNER International Workshop, Catalysis for Future Energy Technologies 2019 2019年1月31日招待有り
Aiming Towards Comprehensive Structural Chemistry on [NiFe]-hydrogenases (Molecular Mechanism of O2-tolerance)

樋口芳樹

3rd International Symposium and Workshop on Functional Genomic and Structural Biology (FGSB2018) 2018年7月23日招待有り
Crystallographic Studies of [NiFe]-hydrogenases

樋口芳樹

8th Asian Biological Inorganic Chemistry Conference (AsBIC8) 2016年12月6日招待有り
Structural Biology of [NiFe]-hydrogenases - Reaction mechanism of uptake and production of H2 by the enzyme

樋口芳樹

Swiss-Japanese Workshop 2016 -Hydrogen technology and energy storage 2016 2016年10月6日招待有り
Structural Studies of [NiFe]-hydrogenases

樋口芳樹

5-th International Symposium on Diffraction Structural Biology 2016 2016年8月9日招待有り
Structural and biochemical studies of Hyd-2 type [NiFe]-hydrogenase from Citrobacter sp. S-77 - proposal of the general mechanism of O2-tolerance of [NiFe]-hydrogenases

樋口芳樹

11th International Hydrogenase Conference 2016 2016年7月13日招待有り
Structure, function and evolution of [NiFe]-Hydrogenases

樋口芳樹

2014 International Conference on Artificial Photosynthesis (ICARP2014) 2014年11月27日招待有り
X-ray Structural Study of [NiFe] hydrogenases

樋口芳樹

International Symposium “Catalytic Systems for Chemical Energy Conversion” 2014年7月24日招待有り
X-ray Structural Study of O2-tolerant [NiFe] hydrogenase

樋口芳樹

International Conference on Bio/Mimetic Solar Energy Conversion (iSEC) 2013 2013年11月23日招待有り
Reaction Mechanism of S-Carbamoylation of HypE by HypF in the Maturation of [NiFe]-hydrogenase

樋口芳樹

10th International Conference on Hydrogenases 2013 2013年7月9日招待有り
Structural Study of O2-Tolerant [NiFe] Hydrogenase

樋口芳樹

The 2nd International Conference on MEXT Project of Integrated Research on Chemical Synthesis“Molecular Functions in Complex Systems” 2012年12月11日招待有り
Can we elucidate the reaction mechanism of [NiFe] hydrogenase by neutron diffraction study?

樋口芳樹

Neutron Structural Biology-Hydration Structure in Proteins- 2011年12月11日招待有り
Structural Chemistry of Hydrogen Metabolism by [NiFe] Hydrogenase Based on Its High Resolution X-ray Structure

樋口芳樹

2nd International Symposium on Diffraction Structural Biology 2007 2007年9月12日招待有り
Active site of [NiFe] hydrogenase - inhibited, unready, ready and active states

樋口芳樹

8th European Biological Inorganic Chemistry Conference 2006年7月5日招待有り
New Aspect of the Structural and Spectroscopic Chemistry on [NiFe] hydrogenase Y. Higuchi

樋口芳樹

XIX Congress and General Assembly of the International Union of Crystallography 2002年8月8日招待有り
X-ray structural study for the reaction mechanism of [NiFe] hydrogenase

樋口芳樹

The 1st Biological Inorganic Chemistry Symposium at Taipei - Chemistry in Metalloproteins 2000年11月18日招待有り
Activation mechanism of hydrogen molecules at the Ni-Fe active site of hydrogenase

樋口芳樹

International Conference on Hydrogenases 2000 2000年8月6日招待有り
New crystallographic and chemical insights into the activation of [NiFe] hydrogenase by H2

樋口芳樹

The 9-th International Conference on Bioinorganic Chemistry 1999年7月12日招待有り

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担当経験のある科目(授業)

2004年4月 - 2022年3月

情報科学Ⅱ (兵庫県立大学理学部)
2002年4月 - 2022年3月

生体高分子結晶解析学 (兵庫県立大学大学院生命理学研究科)
2002年4月 - 2022年3月

情報処理基礎 (兵庫県立大学理学部)
2002年4月 - 2022年3月

構造生物学1 (兵庫県立大学理学部)
2002年4月 - 2004年3月

生物物理学 (兵庫県立大学理学部生命科学科)
2002年4月 - 2004年3月

計算機プログラミング (兵庫県立大学理学部生命科学科)
1996年4月 - 2002年3月

現代化学ゼミナール (京都大学大学院理学研究科化学専攻)
1996年4月 - 2002年3月

生化学 (京都大学理学部化学科)

所属学協会

2000年4月 - 現在

日本蛋白質科学会
1994年9月 - 現在

日本生物物理学会
1988年12月 - 現在

日本放射光学会
1987年4月 - 現在

日本生化学会
1980年1月 - 現在

日本化学会
1978年 - 現在

日本結晶学会

共同研究・競争的資金等の研究課題

ヒドロゲナーゼの触媒反応機構と高効率プロトン伝達機構の構造基盤解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(A) 基盤研究(A) 2019年4月 - 2024年3月

樋口芳樹
高速・局所移動水素と電子とのカップリングによる新発想デバイスの設計

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 新学術領域研究(研究領域提案型) 2018年6月 - 2023年3月

森初果, 小林玄器, 樋口芳樹
水素生成[FeFe]ヒドロゲナーゼの反応機構

日本学術振興会科学研究費助成事業国際共同研究加速基金(帰国発展研究) 2017年 - 2019年

緒方英明, 樋口芳樹
活性部位システイン配位子の酸化修飾による[NiFe]ヒドロゲナーゼの活性阻害機構

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究(B) 2016年4月 - 2018年3月

太虎林, 廣田俊, 樋口芳樹, 許力揚
生物酵素による水素エネルギー利用システムの構造基盤解明

科学技術振興機構戦略的創造研究推進事業 (CREST) 2012年10月 - 2018年3月

樋口芳樹
ドメインスワッピングを利用した新規タンパク質ケージの開発

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的萌芽研究 2015年4月 - 2017年3月

廣田俊, 樋口芳樹, 長尾聡
ドメインスワッピングを利用したタンパク質の超分子化技術の開発と機能化

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2014年4月 - 2017年3月

廣田俊, 樋口芳樹, 長尾聡, 山中優
[ＮｉＦｅ]ヒドロゲナーゼの酸素耐性機構の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 基盤研究(B) 2013年4月 - 2016年3月

樋口芳樹
中性子結晶解析法によるヒドロゲナーゼの反応機構およびプロトン経路の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的萌芽研究 2012年4月 - 2014年3月

樋口芳樹
ナイロンオリゴマー分解酵素（ＮｙｌＡＢＣ）の分子設計と物質生産への応用

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2010年4月 - 2014年3月

根来誠司, 武尾正弘, 加藤太一郎, 樋口芳樹, 柴田直樹, 後藤祐児, 池上貴久, 重田育照, 神谷克政
バイオ燃料電池の実用化に必須である高反応性カソード電極用酵素の研究開発

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2011年 - 2013年

片岡邦重, 加納健司, 樋口芳樹
新規Ni酵素による水素活性化機構の解明とその利用

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2010年 - 2012年

樋口芳樹, 庄村康人
Wntシグナル伝達系因子の離合集散を制御するDIXドメインの構造生物学

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 2010年 - 2011年

樋口芳樹
中性子結晶解析法によるヒドロゲナーゼの水素活性化反応機構の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的萌芽研究 2010年 - 2011年

樋口芳樹
還元系金属酵素の有機金属・クラスター化学

日本学術振興会科学研究費助成事業学術創成研究費 2006年 - 2010年

巽和行, 吉澤一成, 樋口芳樹, 川口博之, 松本剛, 大木靖弘
ナイロンオリゴマー分解酵素の立体構造解析と人工アミド合成への応用

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2006年 - 2009年

根来誠司, 武尾正弘, 加藤太一郎, 樋口芳樹, 柴田直樹, 中野英彦
ヒドロゲナーゼの活性部位における金属クラスターの構造化学と機能発現

日本学術振興会科学研究費助成事業特定領域研究 2004年 - 2007年

樋口芳樹, 小森博文
酵素の持つNi-Feヘテロ2核金属錯体における水素活性化機構の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2002年 - 2004年

樋口芳樹, 柴田直樹
動的・準動的X線結晶解析法による蛋白質間相互作用の研究

日本学術振興会科学研究費助成事業特定領域研究(A) 2001年 - 2001年

樋口芳樹
[NiFe]ヒドロゲナーゼにおける水素活性化機構の構造化学的研究

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2000年 - 2001年

樋口芳樹, 廣田俊

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樋口芳樹

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