脇和規 (Kazunori Waki) - マイポータル

基本情報

所属: 東京工業大学生命理工学院研究員

J-GLOBAL ID: 201901016871093945
researchmap会員ID: B000362731

研究キーワード

バイオインフォマティクス

研究分野

論文

dbTMM: an integrated database of large-scale cohort, genome and clinical data for the Tohoku Medical Megabank Project.

Soichi Ogishima, Satoshi Nagaie, Satoshi Mizuno, Ryosuke Ishiwata, Keita Iida, Kazuro Shimokawa, Takako Takai-Igarashi, Naoki Nakamura, Sachiko Nagase, Tomohiro Nakamura …

Human genome variation 8(1) 44-44 2021年12月10日査読有り
The RIKEN integrated database of mammals

Hiroshi Masuya, Yuko Makita, Norio Kobayashi, Koro Nishikata, Yuko Yoshida, Yoshiki Mochizuki, Koji Doi, Terue Takatsuki, Kazunori Waki, Nobuhiko Tanaka …

NUCLEIC ACIDS RESEARCH 39 D861-D870 2011年1月査読有り
SDOP-DB: a comparative standardized-protocol database for mouse phenotypic analyses

Nobuhiko Tanaka, Kazunori Waki, Hideki Kaneda, Tomohiro Suzuki, Ikuko Yamada, Tamio Furuse, Kimio Kobayashi, Hiromi Motegi, Hideaki Toki, Maki Inoue …

BIOINFORMATICS 26(8) 1133-1134 2010年4月査読有り
Introduction to the Japan Mouse Clinic at the RIKEN BioResource Center

Shigeharu Wakana, Tomohiro Suzuki, Tamio Furuse, Kimio Kobayashi, Ikuo Miura, Hideki Kaneda, Ikuko Yamada, Hiromi Motegi, Hideaki Toki, Maki Inoue …

EXPERIMENTAL ANIMALS 58(5) 443-450 2009年10月査読有り
Introduction to the Japan Mouse Clinic at the RIKEN BioResource Center

Shigeharu Wakana, Tomohiro Suzuki, Tamio Furuse, Kimio Kobayashi, Ikuo Miura, Hideki Kaneda, Ikuko Yamada, Hiromi Motegi, Hideaki Toki, Maki Inoue …

EXPERIMENTAL ANIMALS 58(5) 443-450 2009年10月査読有り
Ontology Mapping of PATO to YATO for the improvement of interoperability of quality description

Hiroshi Masuya, Nobuhiko Tanaka, Kazunori Waki, Tatsuya Kushida, Kouji Kozaki, Riichiro Mizoguchi

Nature Precedings 2009年7月査読有り
The transcriptional network that controls growth arrest and differentiation in a human myeloid leukemia cell line.

Harukazu Suzuki, Alistair R R Forrest, Erik van Nimwegen, Carsten O Daub, Piotr J Balwierz, Katharine M Irvine, Timo Lassmann, Timothy Ravasi, Yuki Hasegawa, Michiel J L de Hoon …

Nature genetics 41(5) 553-62 2009年5月査読有り
The regulated retrotransposon transcriptome of mammalian cells

Geoffrey J. Faulkner, Yasumasa Kimura, Carsten O. Daub, Shivangi Wani, Charles Plessy, Katharine M. Irvine, Kate Schroder, Nicole Cloonan, Anita L. Steptoe, Timo Lassmann …

NATURE GENETICS 41(5) 563-571 2009年5月査読有り
Information model development for description of experimental genetics world

Hiroshi Masuya, Nobuhiko Tanaka, Norio Kobayashi, Kazunori Waki, Shigenaru Wakana, Toshihko Shiroishi, Tetsuro Toyoda, Riichiro Mizoguchi

GENES & GENETIC SYSTEMS 83(6) 497-497 2008年12月査読有り
A Resource for Transcriptomic Analysis in the Mouse Brain

Charles Plessy, Michela Fagiolini, Akiko Wagatsuma, Norihiro Harasawa, Takenobu Kuji, Atsuko Asaka-Oba, Yukari Kanzaki, Sayaka Fujishima, Kazunori Waki, Hiroyuki Nakahara …

PLOS ONE 3(8) 2008年8月査読有り
Cytoskeletal rearrangements in synovial fibroblasts as a novel pathophysiological determinant of modeled rheumatoid arthritis

Aidinis, V, P Carninci, M Armaka, W Witke, Harokopos, V, N Pavelka, D Koczan, C Argyropoulos, MM Thwin, S Moller …

PLOS GENETICS 1(4) 455-466 2005年10月査読有り
Antisense transcription in the mammalian transcriptome

S Katayama, Y Tomaru, T Kasukawa, K Waki, M Nakanishi, M Nakamura, H Nishida, CC Yap, M Suzuki, J Kawai …

SCIENCE 309(5740) 1564-1566 2005年9月査読有り
The transcriptional landscape of the mammalian genome

P Carninci, T Kasukawa, S Katayama, J Gough, MC Frith, N Maeda, R Oyama, T Ravasi, B Lenhard, C Wells …

SCIENCE 309(5740) 1559-1563 2005年9月査読有り
The map-based sequence of the rice genome

T Matsumoto, JZ Wu, H Kanamori, Y Katayose, M Fujisawa, N Namiki, H Mizuno, K Yamamoto, BA Antonio, T Baba …

NATURE 436(7052) 793-800 2005年8月査読有り
Libraries enriched for alternatively spliced exons reveal splicing patterns in melanocytes and melanomas

A Watahiki, K Waki, N Hayatsu, T Shiraki, S Kondo, M Nakamura, D Sasaki, T Arakawa, J Kawai, M Harbers …

NATURE METHODS 1(3) 233-239 2004年12月査読有り
Cap analysis gene expression for high-throughput analysis of transcriptional starting point and identification of promoter usage

T Shiraki, S Kondo, S Katayama, K Waki, T Kasukawa, H Kawaji, R Kodzius, A Watahiki, M Nakamura, T Arakawa …

PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA 100(26) 15776-15781 2003年12月査読有り
Subtraction of cap-trapped full-length cDNA libraries to select rare transcripts

T Hirozane-Kishikawa, T Shiraki, K Waki, M Nakamura, T Arakawa, J Kawai, M Fagiolini, TK Hensch, Y Hayashizaki, P Carninci

BIOTECHNIQUES 35(3) 510-+ 2003年9月査読有り
Analysis of the mouse transcriptome for genes involved in the function of the nervous system

S Gustincich, S Batalov, KW Beisel, H Bono, P Carninci, CF Fletcher, S Grimmond, N Hirokawa, ED Jarvis, T Jegla …

GENOME RESEARCH 13(6B) 1395-1401 2003年6月査読有り
Targeting a complex transcriptome: The construction of the mouse full-length cDNA encyclopedia

P Carninci, K Waki, T Shiraki, H Konno, K Shibata, M Itoh, K Aizawa, T Arakawa, Y Ishii, D Sasaki …

GENOME RESEARCH 13(6B) 1273-1289 2003年6月査読有り
Analysis of the mouse transcriptome based on functional annotation of 60,770 full-length cDNAs

Y Okazaki, M Furuno, T Kasukawa, J Adachi, H Bono, S Kondo, Nikaido, I, N Osato, R Saito, H Suzuki …

NATURE 420(6915) 563-573 2002年12月査読有り

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MISC

理研BRC IMPC(国際マウス表現型解析コンソーシアム)参画計画3-表現型解析情報の公開と統合-

桝屋啓志, 田中信彦, 脇和規, 高月照江, 斎藤実香子, 小幡裕一

日本実験動物学会総会講演要旨集 59th 2012年
BioResource Proposer:KEGG MEDICUS及びオントロジを用いたマウス生物学的リソースアノテーション

WAKI Kazunori, MASUYA Hiroshi

情報計算化学生物学会大会予稿集 2011 (CD-ROM) 2011年筆頭著者
バイオリソースProposer:KEGG MEDICUSおよび生物医学オントロジーを用いたマウス生物資源の注釈データベース

WAKI Kazunori, MASUYA Hiroshi

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 34th 2011年筆頭著者
Semantic Web技術を利用した哺乳類バイオリソースのデータベース

MASUYA Hiroshi, TAKATSUKI Terue, SAITO Mikako, WAKI Kazunori, TANAKA Nobuhiko, MEKADA Kazuyuki, NAKATA Hatsumi, SAIJO Kaoru, YOSHIDA Yuko, MAKITA Yuko …

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 34th 2011年
SDOP-DB:マウス表現型解析プロトコルの国際的共有・公開支援のためのデータベース

田中信彦, 脇和規, 若菜茂晴, 桝屋啓志

日本実験動物学会総会講演要旨集 58th 2011年
An Advanced Strategy for Integration of Biological Measurement Data.

Hiroshi Masuya, Georgios V. Gkoutos, Nobuhiko Tanaka, Kazunori Waki, Yoshihiro Okuda, Tatsuya Kushida, Norio Kobayashi, Koji Doi, Kouji Kozaki, Robert Hoehndorf …

Proceedings of the 2nd International Conference on Biomedical Ontology, Buffalo, NY, USA, July 26-30, 2011 833 79-86 2011年査読有り
実験マウスと疾患情報との自動マッピング(The automated mapping between experimental mice and disease information)

脇和規, 桝屋啓志

日本生化学会大会・日本分子生物学会年会合同大会講演要旨集 83回・33回 4P-1201 2010年12月筆頭著者
SDOP-DB:マウス表現型解析プロトコルの国際的共有及び標準化へ向けたデータベース(SDOP-DB: a database for international sharing and standardization of mouse phenotyping protocols)

田中信彦, 脇和規, 金田秀貴, 鈴木智広, 山田郁子, 古瀬民生, 小林喜美男, 茂木浩未, 土岐秀明, 美野輪治 …

日本生化学会大会・日本分子生物学会年会合同大会講演要旨集 83回・33回 4P-1203 2010年12月
Toward international standardisation and sharing of mouse phenotyping protocols

TANAKA Nobuhiko, WAKI Kazunori, KANEDA Hideki, SUZUKI Tomohiro, YAMADA Ikuko, FURUSE Tamio, KOBAYASHI Kimio, MOTEGI Hiromi, TOKI Hideaki, INOUE Maki …

Exp Anim 59(3 Supplement) 293 2010年5月
RIKEN BRC日本マウスクリニックIV:マウスの統合表現型データベース開発に向けた試み:技術と国際的協調

MASUYA Hiroshi, TANAKA Nobuhiko, WAKI Kazunori, KOBAYASHI Norio, DOI Koji, TAKADA Toyoyuki, SHIROISHI Toshihiko, TOUYODA Tetsuro, WAKANA Shigeharu

Experimental Animals 59(3 Supplement) 2010年
理研哺乳類統合データベース

MASUYA Hiroshi, MAKITA Yuko, NISHIKATA Koro, YOSHIDA Yuko, TAKATSUKI Terue, WAKI Kazunori, TANAKA Nobuhiko, MOCHIZUKI Yoshiki, KOBAYASHI Norio, MIZOGUCHI Riichiro …

生化学 2010年
KEGGデータによる変異マウス系統の疾患との関連づけ

WAKI Kazunori, MASUYA Hiroshi

情報計算化学生物学会大会予稿集 2010 2010年筆頭著者
意味論的ウェブに基づくインフラ構造システムにおける哺乳類の広範な情報のトップレベルオントロジーに基づく統合の実装

MASUYA Hiroshi, MAKITA Yuko, KOBAYASHI Norio, YOSHIDA Yuko, MOCHIZUKI Yoshiki, DOI Koji, TAKATSUKI Terue, WAKI Kazunori, TANAKA Nobuhiko, KOZAKI Koji …

Proceedings of Annual Conference of the Japanese Society for Bioinformatics 2010 2010年
表現型,疾患,薬物標的の分類情報を用いたマウスリソースのための注釈付けと検索システム

WAKI Kazunori, MASUYA Hiroshi

Proceedings of Annual Conference of the Japanese Society for Bioinformatics 2010 2010年筆頭著者
上位オントロジーに基づいた生物表現型データ記述の考察

桝屋啓志, 田中信彦, 脇和規, 櫛田達矢, 古崎晃司, 溝口理一郎

人工知能学会全国大会論文集 2010 1B54-1B54 2010年
上位オントロジーに基づく生物表現型データ記述の考察

桝屋啓志, 田中信彦, 脇和規

人工知能学会全国大会論文集 24 1-4 2010年
SDOPDB：マウス表現型解析プロトコル比較検討データベース

田中信彦, 脇和規, 金田秀貴, 鈴木智広, 山田郁子, 古瀬民生, 小林喜美男, 茂木浩未, 土岐秀明, 井上麻紀 …

第2回ASI-BRC連携フォーラム 2009年11月
マウス表現型DB整備(2)マウス実験プロトコル共有データベースの開発

脇和規, 田中信彦, 金田秀貴, 鈴木智広, 古瀬民生, 小林喜美男, 山田郁子, 茂木浩未, 土岐秀明, 井上麻紀 …

日本実験動物学会総会講演要旨集 56th 193 2009年4月24日筆頭著者
マウス表現型DB整備(1)表現型解析プロトコールの国際的共有へ向けた情報技術開発

田中信彦, 脇和規, 金田秀貴, 鈴木智広, 山田郁子, 古瀬民生, 小林喜美男, 茂木浩未, 土岐秀明, 井上麻紀 …

日本実験動物学会総会講演要旨集 56th 193 2009年4月24日
Infrastructures of mouse phenotype DB (1): Technology development for the international sharing of phenotyping procedures

TANAKA Nobuhiko, WAKI Kazunori, KANEDA Hideki, SUZUKI Tomohiro, YAMADA Ikuko, FURUSE Tamio, KOBAYASHI Mikio, MOTEGI Hiromi, TOKI Hideaki, INOUE Maki …

Exp Anim 58(3 Supplement) 274 2009年4月

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講演・口頭発表等

BioResource Proposer: the annotation database of mouse biological resources using KEGG MEDICUS and biomedical ontologies.

Kazunori Waki, Hiroshi Masuya

第 34 回日本分子生物学会年会（横浜） 2011年12月
BioResource Proposer : the annotation and search system of mouse biological resources using molecular network information and ontologies.

Kazunori Waki, Hiroshi Masuya

25th IMGC, Mouse Genetics 2011 (Washington DC, USA) 2011年6月21日
Analysis of repeat elements using tissue-specific expressed CAGE tags

Kazunori Waki, Chikatoshi Kai, Jun Kawai, Yoshihide Hayashizaki, Piero Carninci

20th IUBMB International Congress of Biochemistry and Molecular Biology and 11th FAOBMB Congress (Kyoto, Japan) 2006年1月18日
Genome-wide tissue specific expression analysis of repeats using mouse CAGE tags

Kazunori Waki, Chikatoshi Kai, Jun Kawai, Yoshihide Hayashizaki, Piero Carninci

第28回日本分子生物学会年会（福岡） 2005年12月7日
Analysis of the mouse full-length cDNA libraries

脇和規 Carninci Piero, 白木利幸, 廣實朋子, 中村真理, 坂詰直子, 荒川貴博, 石井善幸, 佐々木大輔, 今野英明, 河合純, 林崎良英

第 25 回日本分子生物学会年会（横浜） 2002年12月
Web-Based System for Sample Tracking in Rice Genome Research Program

Kazunori Waki, Kimiko Yamamoto, Isam Ohta, Masaaki Kise, Katsumi Sakata, Takuji Sasaki

Currents in Computational Molecular Biology (RECOMB2000) (Tokyo, Japan) 2000年4月
Effect of Temporal Pattern of Peripheral Taste Nerve Activity on Self-Organization of Gustatory Neuron types in Hindbrain

K. Waki, Y. Kashimori, A. Tsuboi, T. Kambara

International Conference on Neural Information Processing(ICONIP ’96) (Hong Kong, UK) 1996年11月
動的に変化するシナプス結合をもつニューラルネットワークの動的性質

脇和規, 星野修, 樫森与志喜, 神原武志

第６回数理生物学シンポジウム 1995年11月8日

脇和規

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