共同研究・競争的資金等の研究課題

2012年4月 - 2015年3月

スギ木部形成関連遺伝子データベースの構築に向けたEST単離と網羅的発現解析

日本学術振興会  科学研究費助成事業 基盤研究(B)  基盤研究(B)

課題番号
24380098
体系的課題番号
JP24380098
配分額
(総額)
17,680,000円
(直接経費)
13,600,000円
(間接経費)
4,080,000円

スギ精英樹クローンを用いて成長期及び休眠期を通して定期的に試料を採取し、形成層帯及び分化帯で発現する遺伝子の末端塩基配列(EST)を55,051配列収集した。さらに、得られた配列のうち高発現していると考えられる14,616 isotigに、ForestGenの材関連データベースの既存配列を加えた18,082 probeのマイクロアレイを設計し、成長期を通じた遺伝子発現を網羅的に解析した。その結果、18,082遺伝子中10,380遺伝子が材形成期間に有意な発現挙動を見せ、木部形成が活発な時期に発現が上昇する4,019遺伝子 とそれ以降から成長停止期に発現が上昇する6,361遺伝子とに区分された。

リンク情報
URL
https://kaken.nii.ac.jp/file/KAKENHI-PROJECT-24380098/24380098seika.pdf
KAKEN
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-24380098
ID情報
  • 課題番号 : 24380098
  • 体系的課題番号 : JP24380098