大久保公策 (Kousaku Okubo) - マイポータル

基本情報

所属: 国立遺伝学研究所生命情報・DDBJ研究センター・遺伝子発現解析研究室教授

学位: 医学博士(大阪大学)

J-GLOBAL ID: 200901091918231548
researchmap会員ID: 5000025452

外部リンク: http://bodymap.ims.u-tokyo.ac.jp

研究キーワード

研究分野

ライフサイエンス / 分子生物学 /

学歴

論文

DDBJ new system and service refactoring.

Osamu Ogasawara, Jun Mashima, Yuichi Kodama, Eli Kaminuma, Yasukazu Nakamura, Kousaku Okubo, Toshihisa Takagi

Nucleic acids research 41(Database issue) D25-9-29 2013年1月査読有り
On Theoretical Models of Gene Expression Evolution with Random Genetic Drift and Natural Selection

Osamu Ogasawara, Kousaku Okubo

PLOS ONE 4(11) 2009年11月査読有り
DDBJ with new system and face

H. Sugawara, O. Ogasawara, K. Okubo, T. Gojobori, Y. Tateno

NUCLEIC ACIDS RESEARCH 36 D22-D24 2008年1月査読有り
BodyMap-Xs: anatomical breakdown of 17 million animal ESTs for cross-species comparison of gene expression.

Ogasawara O, Otsuji M, Watanabe K, Iizuka T, Tamura T, Hishiki T, Kawamoto S, Okubo K

Nucleic Acids Res. 34 628-631 2006年査読有り
DDBJ in preparation for overview of research activities behind data submissions.

Okubo K, Sugawara H, Gojobori T, Tateno Y

Nucleic Acids Res. 34(1) 6-9 2006年査読有り
The Human Anatomic Gene Expression Library (H-ANGEL), the H-Inv integrative display of human gene expression across disparate technologies and platforms.

Tanino, M, Debily, MA, Tamura, T, Hishiki, T, Ogasawara, O, Murakawa, K, Kawamoto, S, Itoh, K, Watanabe, S, de Souza, SJ …

Nucleic Acids Res. 33 567-572 2005年査読有り
DDBJ in collaboration with mass-sequencing teams on annotation

Y Tateno, N Saitou, K Okubo, H Sugawara, T Gojobori

NUCLEIC ACIDS RESEARCH 33 D25-D28 2005年1月査読有り
Quantification of gene expression in mouse and human renal proximal tubules.

Kaimori JY, Takenaka M, Okubo K

Methods Mol Biol. 293 209-219 2005年査読有り
I dentification of differentially expressed genes in psoriasis using expression profiling approaches.

Itoh K, Kawasaki S, Kawamoto S, Seishima M, Chiba H, Michibata H, Wakimoto K, Imai Y, Minesaki Y, Otsuji M …

Exp Dermatol. 14(9) 667-674 2005年査読有り
Identification and characterization of a novel component of the cornified envelope, cornifelin

H Michibata, H Chiba, K Wakimoto, M Seishima, S Kawasaki, K Okubo, H Mitsui, H Torii, Y Imai

BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS 318(4) 803-813 2004年6月
Cloning of a gene for a novel epithelium-specific cytosolic phospholipase A(2), cPLA(2)delta, induced in psoriatic skin

H Chiba, H Michibata, K Wakimoto, M Seishima, S Kawasaki, K Okubo, H Mitsui, H Torii, Y Imai

JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY 279(13) 12890-12897 2004年3月
Indexing anatomical concepts to OMIM clinical synopsis using the UMLS metathesaurus

Teruyoshi Hishiki, Osamu Ogasawara, Yoshimasa Tsuruoka, Kousaku Okubo

In Silico Biology 4(1) 31-54 2004年
Zipf's law and human transcriptomes: an explanation with an evolutionary model

O Ogasawara, S Kawamoto, K Okubo

COMPTES RENDUS BIOLOGIES 326(10-11) 1097-1101 2003年10月
A novel diacylglycerol acyltransferase (DGAT2) is decreased in human psoriatic skin and increased in diabetic mice

K Wakimoto, H Chiba, H Michibata, M Seishima, S Kawasaki, K Okubo, H Mitsui, H Torii, Y Imai

BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS 310(2) 296-302 2003年10月
Induction of glia maturation factor-beta in proximal tubular cells leads to vulnerability to oxidative injury through the p38 pathway and changes in antioxidant enzyme activities

J Kaimori, M Takenaka, H Nakajima, T Hamano, M Horio, T Sugaya, T Ito, M Hori, K Okubo, E Imai

JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY 278(35) 33519-33527 2003年8月
Up-regulated gene expression in the conjunctival epithelium of patients with Sjogren's syndrome

S Kawasaki, S Kawamoto, N Yokoi, C Connon, Y Minesaki, S Kinoshita, K Okubo

EXPERIMENTAL EYE RESEARCH 77(1) 17-26 2003年7月

MISC

Cornichon-like protein facilitates secretion of HB-EGF and regulates proper development of cranial nerves

Hideharu Hoshino, Tsukasa Uchida, Toshiaki Otsuki, Shoko Kawamoto, Kousaku Okubo, Masatoshi Takeichi, Osamu Chisaka

MOLECULAR BIOLOGY OF THE CELL 18(4) 1143-1152 2007年4月
「ポストゲノム時代に高まるバイオ自然言語処理への期待：バイオ自然言語処理最新事情 5.ゲノムデータの機械解釈」

情報処理 46(2480) 137-142 2005年

書籍等出版物

「蛋白質核酸酵素」「生命科学データベース統合化の背景」【シリーズ「ライフサイエンス分野の統合データベース」第1回】

大久保公策

2007年
雑誌『科学』「生命科学データベースの現状と課題」

大久保公策

2007年
科学 Vol.77 No.4 生命科学データベースの現状と課題ーパラダイム転換の最後のバリアー

大久保公策

㈱岩波書店東京都千代田区一ツ橋2-5-5 2007年
「蛋白質核酸酵素」編集部 vol.50 No.16 「文献知識の計算機による利用がなぜ必要か」

大久保公策

共立出版株式会社 2005年
科学 Vol.74 No.10 ゲノム語とオントロジーという名の形而上学ー進化と医学

大久保公策, 川本祥子

岩波書店 2004年
Laser Capture Microdissection Methods and Protocols Quantification of Gene Expression in Mouse and Human Renal Proximal Tubules.

Kaimori, J, Takenaka, M, Okubo, K

Humana Press 2004年

講演・口頭発表等

「デジタル時代のジレンマ」フォーラム

大久保公策

第３２回日本分子生物学会 2009年12月10日
「デジタル科学における独占と共有の賢いバランス」

大久保公策

【CBRC】2009シンポジウム 2009年12月4日
「科学データは誰のものか」

大久保公策

統合データベース講習会 AJACSりんくう 2009年11月6日
デジタル科学への最後のステップ

大久保公策

ﾗｲﾌｻｲｴﾝｽ統合ﾃﾞｰﾀﾍﾞｰｽｾﾝﾀｰ 2009ｼﾝﾎﾟｼﾞｳﾑ「科学における情報の上手な権利化と共有化」 2009年10月5日
先端技術と知財問題

大久保公策

日本知財学会第7回年次学術研究発表会 2009年6月14日
「アナトモグラフィー/BodyParts3Dの利用法」

大久保公策

統合データベース講習会 AJACS 本郷4 2009年4月17日
「オープン科学に望まれる制度とは？」

大久保公策

農芸化学会 2009年3月28日
「科学データは誰のものか？」

大久保公策

第31回日本分子生物学会 2008年12月10日
Digital revolution and Life Sciences

Kousaku Okubo

The 939th NIG colloquium 2008年10月31日
「科学データは誰のものか」

大久保公策

統合データベース講習会 AJACS 博多 2008年10月18日
Japan's Data Sharing Center For Publicly-Funded Biomedical Science

Kousaku Okubo, Shoko Kawamoto, Hidemasa Bono, Toshihisa Takagi

2008 CSHL/WT Meeting on Genome Informatics 2008年9月10日
「科学を社会に役立てるには？」

大久保公策

（独）日本学術振興会ゲノムテクノロジー第164委員会第27回研究会 2008年7月22日
「科学データは誰のものか？」

大久保公策

統合データベース講習会 AJACS 本郷1 2008年7月3日
生命研究者として情報基盤を考える

大久保公策

関西眼疾患研究会特別講演 2007年12月19日
補完的課題「生命科学データベース統合に関する調査研究」報告

大久保公策

生命科学の基礎・基盤連携群シンポジウム 2007年11月29日
生命情報基盤から読み解く「科学の仕組み」～オタクとカガクはおんなじか～

大久保公策

国立遺伝学研究所公開講演会2007 2007年11月10日
生命研究者として情報基盤を考える

大久保公策

第900回遺伝研内部交流セミナー 2007年10月19日
生命科学分野でのDB統合の意味と意義

大久保公策

日本バイオインフォマティクス学会第1回JSBi合同研究会 2007年5月29日
生命科学分野でのDB統合の意味と意義

大久保公策

ライフサーベイヤ技術開発計画会議 2007年5月28日
生命科学情報の情報基盤を考える：「知」のめぐりは充分か？

大久保公策

「生命をはかる」研究会第２０回研究会 2007年3月12日

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所属学協会

Works(作品等)

文部科学省データベース統合プロジェクトヒト統合ボディーマップ

Ogasawara O, Arikawa K, Watanabe K, Iizuka T, Okubo K

2007年データベース
BodyMap-Xs

Okubo, K, Ogasawara, O

2006年データベース

共同研究・競争的資金等の研究課題

分子生物学の定式化

科学研究費補助金 2000年 - 2004年