論文

査読有り
2018年8月

Shifting the limits in wheat research and breeding using a fully annotated reference genome.

Science (New York, N.Y.)
  • International Wheat
  • Genome Sequencing
  • Consortium (IWGSC
  • IWGSC RefSeq
  • principal investigators
  • Appels R
  • Eversole K
  • Feuillet C
  • Keller B
  • Rogers J
  • Stein N
  • IWGSC whole-genome assembly principal investigators
  • Pozniak CJ
  • Stein N
  • Choulet F
  • Distelfeld A
  • Eversole K
  • Poland J
  • Rogers J
  • Ronen G
  • Sharpe AG
  • Whole-genome sequencing
  • and assembly
  • Pozniak C
  • Ronen G
  • Stein N
  • Barad O
  • Baruch K
  • Choulet F
  • Keeble-Gagnère G
  • Mascher M
  • Sharpe AG
  • Ben-Zvi G
  • Josselin AA
  • Hi-C data-based scaffolding
  • Stein N
  • Mascher M
  • Himmelbach A
  • Whole-genome assembly quality control and analyses
  • Choulet F
  • Keeble-Gagnère G
  • Mascher M
  • Rogers J
  • Balfourier F
  • Gutierrez-Gonzalez J
  • Hayden M
  • Josselin AA
  • Koh C
  • Muehlbauer G
  • Pasam RK
  • Paux E
  • Pozniak CJ
  • Rigault P
  • Sharpe AG
  • Tibbits J
  • Tiwari V
  • Pseudomolecule assembly
  • Choulet F
  • Keeble-Gagnère G
  • Mascher M
  • Josselin AA
  • Rogers J
  • RefSeq genome structure
  • gene analyses
  • Spannagl M
  • Choulet F
  • Lang D
  • Gundlach H
  • Haberer G
  • Keeble-Gagnère G
  • Mayer KFX
  • Ormanbekova D
  • Paux E
  • Prade V
  • Šimková H
  • Wicker T
  • Automated annotation
  • Choulet F
  • Spannagl M
  • Swarbreck D
  • Rimbert H
  • Felder M
  • Guilhot N
  • Gundlach H
  • Haberer G
  • Kaithakottil G
  • Keilwagen J
  • Lang D
  • Leroy P
  • Lux T
  • Mayer KFX
  • Twardziok S
  • Venturini L
  • Manual gene curation
  • Appels R
  • Rimbert H
  • Choulet F
  • Juhász A
  • Keeble-Gagnère G
  • Subgenome comparative analyses
  • Choulet F
  • Spannagl M
  • Lang D
  • Abrouk M
  • Haberer G
  • Keeble-Gagnère G
  • Mayer KFX
  • Wicker T
  • Transposable elements
  • Choulet F
  • Wicker T
  • Gundlach H
  • Lang D
  • Spannagl M
  • Phylogenomic analyses
  • Lang D
  • Spannagl M
  • Appels R
  • Fischer I
  • Transcriptome analyses
  • RNA-seq data
  • Uauy C, Borrill P
  • Ramirez-Gonzalez RH
  • Appels R
  • Arnaud D
  • Chalabi S
  • Chalhoub B
  • Choulet F
  • Cory A
  • Datla R
  • Davey MW
  • Hayden M
  • Jacobs J
  • Lang D
  • Robinson SJ
  • Spannagl M
  • Steuernagel B
  • Tibbits J
  • Tiwari V
  • van Ex F
  • Wulff BBH
  • Whole-genome methylome
  • Pozniak CJ
  • Robinson SJ
  • Sharpe AG
  • Cory A
  • Histone mark analyses
  • Benhamed M
  • Paux E
  • Bendahmane A
  • Concia L
  • Latrasse D
  • BAC chromosome MTP
  • IWGSC–Bayer Whole-Genome Profiling
  • WGP) tags
  • Rogers J
  • Jacobs J
  • Alaux M
  • Appels R
  • Bartoš J
  • Bellec A
  • Berges H
  • Doležel J
  • Feuillet C
  • Frenkel Z
  • Gill B
  • Korol A
  • Letellier T
  • Olsen OA
  • Šimková H
  • Singh K
  • Valárik M
  • van der Vossen E
  • Vautrin S
  • Weining S
  • Chromosome LTC mapping
  • physical mapping quality control
  • Korol A
  • Frenkel Z
  • Fahima T
  • Glikson V
  • Raats D
  • Rogers J
  • RH mapping
  • Tiwari V
  • Gill B
  • Paux E
  • Poland J
  • Optical mapping
  • Doležel J
  • Číhalíková J
  • Šimková H
  • Toegelová H
  • Vrána J
  • Recombination analyses
  • Sourdille P
  • Darrier B
  • Gene family analyses
  • Appels R
  • Spannagl M
  • Lang D
  • Fischer I
  • Ormanbekova D
  • Prade V
  • CBF gene family
  • Barabaschi D
  • Cattivelli L
  • Dehydrin gene family
  • Hernandez P
  • Galvez S
  • Budak H
  • NLR gene family
  • Steuernagel B
  • Jones JDG
  • Witek K
  • Wulff BBH
  • Yu G
  • PPR gene family
  • Small I
  • Melonek J
  • Zhou R
  • Prolamin gene family
  • Juhász A
  • Belova T
  • Appels R
  • Olsen OA
  • WAK gene family
  • Kanyuka K
  • King R
  • Stem solidness
  • S
  • QTL team
  • Nilsen K
  • Walkowiak S
  • Pozniak CJ
  • Cuthbert R
  • Datla R
  • Knox R
  • Wiebe K
  • Xiang D
  • Flowering locus C (FLC) gene team
  • Rohde A
  • Golds T
  • Genome size analysis
  • Doležel J
  • Čížková J
  • Tibbits J
  • MicroRNA
  • tRNA annotation
  • Budak H
  • Akpinar BA
  • Biyiklioglu S
  • Genetic maps
  • mapping
  • Muehlbauer G
  • Poland J
  • Gao L
  • Gutierrez-Gonzalez J
  • N'Daiye A
  • BAC libraries
  • chromosome sorting
  • Doležel J
  • Šimková H
  • Číhalíková J
  • Kubaláková M
  • Šafář J
  • Vrána J
  • BAC pooling
  • BAC library repository,and access
  • Berges H
  • Bellec A
  • Vautrin S
  • IWGSC sequence
  • data repository and access
  • Alaux M
  • Alfama F
  • Adam-Blondon AF
  • Flores R
  • Guerche C
  • Letellier T
  • Loaec M
  • Quesneville H
  • Physical maps
  • BAC-based sequences
  • A BAC sequencing
  • and assembly
  • Pozniak CJ
  • Sharpe AG
  • Walkowiak S
  • Budak H
  • Condie J
  • Ens J
  • Koh C
  • Maclachlan R
  • Tan Y
  • Wicker T
  • B BAC sequencing
  • and assembly
  • Choulet F
  • Paux E
  • Alberti A
  • Aury JM
  • Balfourier F
  • Barbe V
  • Couloux A
  • Cruaud C
  • Labadie K
  • Mangenot S
  • Wincker P
  • D
  • D
  • a
  • D physical mapping
  • Gill B
  • Kaur G
  • Luo M
  • Sehgal S
  • AL physical mapping
  • Singh K
  • Chhuneja P
  • Gupta OP
  • Jindal S
  • Kaur P
  • Malik P
  • Sharma P
  • Yadav B
  • AS physical mapping
  • Singh NK
  • Khurana J
  • Chaudhary C
  • Khurana P
  • Kumar V
  • Mahato A
  • Mathur S
  • Sevanthi A
  • Sharma N
  • Tomar RS
  • D
  • BL,and
  • DL IWGSC–Bayer Whole-Genome Profiling (WGP
  • physical maps
  • Rogers J
  • Jacobs J
  • Alaux M
  • Bellec A
  • Berges H
  • Doležel J
  • Feuillet C
  • Frenkel Z
  • Gill B
  • Korol A
  • van der Vossen E
  • Vautrin S
  • AL physical mapping
  • Gill B
  • Kaur G
  • Luo M
  • Sehgal S
  • DS physical mapping
  • BAC sequencing
  • and assembly
  • Bartoš J
  • Holušová K
  • Plíhal O
  • DL BAC sequencing
  • a
  • d assembly
  • Clark MD
  • Heavens D
  • Kettleborough G
  • Wright J
  • A physical mapping
  • BAC sequencing,assembly
  • annotation
  • Valárik M
  • Abrouk M
  • Balcárková B
  • Holušová K
  • Hu Y
  • Luo M
  • BS BAC sequencing
  • and assembly
  • Salina E
  • Ravin N
  • Skryabin K
  • Beletsky A
  • Kadnikov V
  • Mardanov A
  • Nesterov M
  • Rakitin A
  • Sergeeva E
  • B BAC sequencing
  • and assembly
  • Handa H
  • Kanamori H
  • Katagiri S
  • Kobayashi F
  • Nasuda S
  • Tanaka T
  • Wu J
  • A physical mapping
  • BAC sequencing
  • Appels R
  • Hayden M
  • Keeble-Gagnère G
  • Rigault P
  • Tibbits J
  • B physical mapping
  • BAC sequencing
  • and assembly
  • Olsen OA
  • Belova T
  • Cattonaro F
  • Jiumeng M
  • Kugler K
  • Mayer KFX
  • Pfeifer M
  • Sandve S
  • Xun X
  • Zhan B
  • DS BAC sequencing
  • and assembly
  • Šimková H
  • Abrouk M
  • Batley J
  • Bayer PE
  • Edwards D
  • Hayashi S
  • Toegelová H
  • Tulpová Z
  • Visendi P
  • DL physical mapping
  • BAC sequencing
  • Weining S
  • Cui L
  • Du X
  • Feng K
  • Nie X
  • Tong W
  • Wang L, Figures
  • Borrill P
  • Gundlach H
  • Galvez S
  • Kaithakottil G
  • Lang D
  • Lux T
  • Mascher M
  • Ormanbekova D
  • Prade V
  • Ramirez-Gonzalez RH
  • Spannagl M
  • Stein N
  • Uauy C
  • Venturini L
  • Manuscript
  • writing team
  • Stein N
  • Appels R
  • Eversole K
  • Rogers J
  • Borrill P
  • Cattivelli L
  • Choulet F
  • Hernandez P
  • Kanyuka K
  • Lang D
  • Mascher M
  • Nilsen K
  • Paux E
  • Pozniak CJ
  • Ramirez-Gonzalez RH
  • Šimková H
  • Small I
  • Spannagl M
  • Swarbreck D
  • Uauy C
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6403
DOI
10.1126/science.aar7191

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DOI
https://doi.org/10.1126/science.aar7191
PubMed
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/30115783
ID情報
  • DOI : 10.1126/science.aar7191
  • ISSN : 0036-8075
  • PubMed ID : 30115783

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