石野園子 (Sonoko Ishino) - マイポータル

基本情報

所属: Kyushu University Associate Professor

学位: 博士（薬学）(2003年7月大阪大学薬学研究科)

研究者番号: 80399740
ORCID ID: https://orcid.org/0000-0002-1833-1735
J-GLOBAL ID: 200901022620358225
researchmap会員ID: 5000098316

外部リンク: http://www.agr.kyushu-u.ac.jp/lab/seibutsukagaku/index.html

研究キーワード

研究分野

ライフサイエンス / 分子生物学 /

経歴

2008年 - 現在

九州大学農学研究院
2005年 - 2008年

大阪大学微生物病研究所
1995年 - 2005年

生物分子工学研究所
1989年 - 1995年

蛋白工学研究所
1988年 - 1989年

Yale大学
1980年 - 1988年

塩野義製薬株式会社

学歴

1976年4月 - 1980年3月

大阪大学, 薬学部

論文

Genetic and biochemical characterizations of aLhr1 helicase in the thermophilic crenarchaeon sulfolobus acidocaldarius

Shoji Suzuki, Norio Kurosawa, Takeshi Yamagami, Shunsuke Matsumoto, Tomoyuki Numata, Sonoko Ishino, Yoshizumi Ishino

Catalysts 12(1) 2022年1月
Development of a time-series shotgun metagenomics database for monitoring microbial communities at the Pacific coast of Japan

Kazutoshi Yoshitake, Gaku Kimura, Tomoko Sakami, Tsuyoshi Watanabe, Yukiko Taniuchi, Shigeho Kakehi, Akira Kuwata, Haruyo Yamaguchi, Takafumi Kataoka, Masanobu Kawachi …

Scientific Reports 11(1) 2021年12月査読有り
Family D DNA polymerase interacts with GINS to promote CMG-helicase in the archaeal replisome.

Keisuke Oki, Mariko Nagata, Takeshi Yamagami, Tomoyuki Numata, Sonoko Ishino, Takuji Oyama, Yoshizumi Ishino

Nucleic acids research 50(7) 3601-3615 2021年9月27日
DNA polymerase D temporarily connects primase to the CMG-like helicase before interacting with proliferating cell nuclear antigen.

Keisuke Oki, Takeshi Yamagami, Mariko Nagata, Kouta Mayanagi, Tsuyoshi Shirai, Naruhiko Adachi, Tomoyuki Numata, Sonoko Ishino, Yoshizumi Ishino

Nucleic acids research 49(8) 4599-4612 2021年5月7日
Two conformations of DNA polymerase D-PCNA-DNA, an archaeal replisome complex, revealed by cryo-electron microscopy

Kouta Mayanagi, Keisuke Oki, Naoyuki Miyazaki, Sonoko Ishino, Takeshi Yamagami, Kosuke Morikawa, Kenji Iwasaki, Daisuke Kohda, Tsuyoshi Shirai, Yoshizumi Ishino

BMC Biology 18(1) 152-152 2020年10月査読有り
The replication machinery of LUCA: common origin of DNA replication and transcription

Eugene V. Koonin, Mart Krupovic, Sonoko Ishino, Yoshizumi Ishino

BMC Biology 18(1) 61 2020年6月査読有り
Switch of the interactions between the ribosomal stalk and EF1A in the GTP- and GDP-bound conformations.

Maruyama K, Imai H, Kawamura M, Ishino S, Ishino Y, Ito K, Uchiumi T

Scientific reports 9(1) 14761 2019年10月査読有り
Pol B, a Family B DNA Polymerase, in Thermococcus kodakarensis is Important for DNA Repair, but not DNA Replication.

Kushida T, Narumi I, Ishino S, Ishino Y, Fujiwara S, Imanaka T, Higashibata H

Microbes and environments 34(3) 316-326 2019年9月査読有り
Elucidating functions of DP1 and DP2 subunits from the Thermococcus kodakarensis family D DNA polymerase

Natsuki Takashima, Sonoko Ishino, Keisuke Oki, Mika Takafuji, Takeshi Yamagami, Ryotaro Matsuo, Kouta Mayanagi, Yoshizumi Ishino

Extremophiles 23 161-172 2019年1月22日
Replication protein A complex in Thermococcus kodakarensis interacts with DNA polymerases and helps their effective strand synthesis

Mariko Nagata, Sonoko Ishino, Takeshi Yamagami, Yoshizumi Ishino

Bioscience, Biotechnology and Biochemistry 83(4) 695-704 2019年1月1日
New archaeal viruses discovered by metagenomic analysis of viral communities in enrichment cultures

Ying Liu, David Brandt, Sonoko Ishino, Yoshizumi Ishino, Eugene V. Koonin, J?rn Kalinowski, Mart Krupovic, David Prangishvili

Environmental Microbiology 2019年1月1日
Direct visualization of DNA baton pass between replication factors bound to PCNA

Kouta Mayanagi, Sonoko Ishino, Tsuyoshi Shirai, Takuji Oyama, Shinichi Kiyonari, Daisuke Kohda, Kosuke Morikawa, Yoshizumi Ishino

Scientific Reports 8(1) 16209-16209 2018年12月1日
The mesophilic archaeon Methanosarcina acetivorans counteracts uracil in DNA with multiple enzymes: EndoQ, ExoIII, and UDG

Miyako Shiraishi, Sonoko Ishino, Matthew Heffernan, Isaac Cann, Yoshizumi Ishino

Scientific Reports 8 2018年12月1日
Activation of the mismatch-specific endonuclease EndoMS/NucS by the replication clamp is required for high fidelity DNA replication

Sonoko Ishino, St?phane Skouloubris, Hanae Kudo, Caroline L'Hermitte-Stead, Asmae Es-Sadik, Jean Christophe Lambry, Yoshizumi Ishino, Hannu Myllykallio

Nucleic Acids Research 46 6206-6217 2018年7月6日
Crystal structure of the novel lesion-specific endonuclease PfuEndoQ from Pyrococcus furiosus

Ken ichi Miyazono, Sonoko Ishino, Naruto Makita, Tomoko Ito, Yoshizumi Ishino, Masaru Tanokura

Nucleic Acids Research 46(9) 4807-4818 2018年5月1日
Two family B DNA polymerases from Aeropyrum pernix, based on revised translational frames

Katsuya Daimon, Sonoko Ishino, Namiko Imai, Sachiyo Nagumo, Takeshi Yamagami, Hiroaki Matsukawa, Yoshizumi Ishino

Frontiers in Molecular Biosciences 5 2018年4月16日
Possible function of the second RecJ-like protein in stalled replication fork repair by interacting with Hef

Mariko Nagata, Sonoko Ishino, Takeshi Yamagami, Jan-Robert Simons, Tamotsu Kanai, Haruyuki Atomi, Yoshizumi Ishino

SCIENTIFIC REPORTS 7 2017年12月
The Cdc45/RecJ-like protein forms a complex with GINS and MCM, and is important for DNA replication in Thermococcus kodakarensis

Mariko Nagata, Sonoko Ishino, Takeshi Yamagami, Hiromi Ogino, Jan-Robert Simons, Tamotsu Kanai, Haruyuki Atomi, Yoshizumi Ishino

NUCLEIC ACIDS RESEARCH 45(18) 10693-10705 2017年10月
A Novel Type of Polyhedral Viruses Infecting Hyperthermophilic Archaea

Ying Liu, Sonoko Ishino, Yoshizumi Ishino, Gerard Pehau-Arnaudet, Mart Krupovic, David Prangishvili

JOURNAL OF VIROLOGY 91(13) 2017年7月
A functional endonuclease Q exists in the bacterial domain: identification and characterization of endonuclease Q from Bacillus pumilus

Miyako Shiraishi, Sonoko Ishino, Isaac Cann, Yoshizumi Ishino

BIOSCIENCE BIOTECHNOLOGY AND BIOCHEMISTRY 81(5) 931-937 2017年5月

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MISC

X線小角散乱と計算科学を用いた統合的解析による天然変性タンパク質の動的構造と機能の理解

小田隆, 大井里香, 古寺哲幸, 安藤敏夫, 小沼剛, 菅瀬謙治, 苙口友隆, 井上倫太郎, 杉山正明, 石野園子 …

日本農芸化学会大会講演要旨集(Web) 2022 2022年
好熱性アーキアにおけるDNA修復に働く新規ヘリカーゼ様タンパク質の機能解析

鈴木匠爾, 鈴木匠爾, 黒沢則夫, 山上健, 沼田倫征, 石野園子, 石野良純

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 42nd 2019年
超好熱性アーキアThermococcus kodakarensis由来ファミリーD DNAポリメラーゼの分子解剖による機能分布の解明

沖啓輔, 山上健, 永田麻梨子, 高島夏希, 真柳浩太, 白井剛, 石野園子, 石野良純

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 41st ROMBUNNO.2P‐0079 (WEB ONLY) 2018年
クライオ電顕で「見る」古細菌複製フォーク複合体の機能構造

真柳浩太, 沖啓輔, 石野園子, 宮崎直幸, 岩崎憲治, 神田大輔, 白井剛, 石野良純

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 41st ROMBUNNO.3AW‐10‐5 (WEB ONLY) 2018年
PolD‐PCNA‐DNA複合体の単粒子解析

真柳浩太, 沖啓輔, 石野園子, 宮崎直幸, 岩崎憲治, 神田大輔, 白井剛, 石野良純

日本生化学会大会(Web) 90th ROMBUNNO.2P‐0585 (WEB ONLY)-0585] 2017年12月
バイオ系のキャリアデザイン生命科学をめぐる幾筋もの道で出会った景色

石野園子

生物工学会誌 95(6) 338-341 2017年
分子認識と環境応答における分子機構解明を目指す電子顕微鏡学単粒子解析により明らかにされたreplisomeの切り替え機構(Switching mechanism of the replisome as revealed by single particle analysis)

真柳浩太, 石野園子, 高藤三加, 光岡薫, 白井剛, 清成信一, 西田洋一, 神田大輔, 森川耿右, 石野良純

日本生化学会大会プログラム・講演要旨集 89回 [1S13-4] 2016年9月
構成サブユニットDP1,DP2の機能解明を目指したファミリーD DNAポリメラーゼの分子解剖

高島夏希, 石野園子, 高藤三加, 高藤三加, 真柳浩太, 松尾亮太郎, 山上健, 石野良純

日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集 16th 70 2016年5月19日
超好熱性アーキアThermococcus kodakarensis由来ファミリーD DNAポリメラーゼの構造と機能の相関

高島夏希, 石野園子, 高藤三加, 高藤三加, 真柳浩太, 原智彦, 山上健, 石野良純

日本生化学会大会(Web) 88th 2P0716 (WEB ONLY)-[2P0716] 2015年12月
T.kodakarensis Hefタンパク質の天然変性領域による他因子との相互作用

石野園子, 山上健, 古寺哲幸, 安藤敏夫, 天野剛志, 合田奈都子, 廣明秀一, 石野良純

日本Archaea研究会講演会要旨集 27th 9-10 2014年7月25日
複製フォークの停止修復に関わるHefタンパク質に見られる天然変性領域の機能解析

石野園子, 山上健, 冨田宏矢, 金井保, 跡見晴幸, 石野良純

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 36th 2013年
赤潮発生予測技術開発を目指した海洋微生物のメタゲノム解析

南雲吉代, 金田敏枝, 石野園子, 山上健, 森一樹, 田代康介, 久原哲, 島崎洋平, 大嶋雄治, 石野良純

環境バイオテクノロジー学会大会プログラム講演要旨集 2013 2013年
好熱性アーキアThermoplasma acidophilum における複製ヘリカーゼの分岐進化した活性化メカニズム

尾木野弘実, 石野園子, 真柳浩太, 大山拓次, 白井剛, 森川耿右, HAUGLAND, Gyri Teien, BIRKELAND Nils‐Kare, 神田大輔 …

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 36th 2P-0128 (WEB ONLY) 2013年
アーキア研究から見えてくるDNA複製装置の分子進化 : DNAポリメラーゼの分布から進化を考察する (特集第38回学術講演会) -- (シンポジウム「アーキアを用いた進化研究」より)

石野園子, 大門克哉, 石野良純

Viva origino 41(1) 8-11 2013年
S1 アーキア研究から見えてくるDNA複製装置の分子進化(アーキアを用いた進化研究,シンポジウム,第38回学術講演会講演要旨集)

石野良純, 大門克哉, 石野園子

Viva origino 41 31-31 2013年
Classification and functions of DNA polymerases in archaea, the third domain of life

Yoshizumi Ishino, Sonoko Ishino

GENES & GENETIC SYSTEMS 87(6) 386-386 2012年12月
Application of PCNA to processive PCR by reducing the stability of its ring structure

Ishino Sonoko, Kawamura A, Ishino Y

極限環境生物学会誌 = Journal of Japanese Society for Extremophiles 11(1) 19-25 2012年8月
Biophysical analysis of PCNA from Pyrococcus furiosus

Kuwamura A, Ishino Y, Ishino Sonoko

極限環境生物学会誌 = Journal of Japanese Society for Extremophiles 11(1) 12-18 2012年8月
Thermoplasma acidophilum由来Cdc6/Orc1とホモ4量体のGINSによるMCMの相乗的な活性化

尾木野弘実, 石野園子, 真柳浩太, 大山拓次, 白井剛, 森川耿右, HAUGLAND, Gyri Teien, BIRKELAND Nils‐Kare, 石野良純

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 35th 3P-0193 (WEB ONLY) 2012年
Thermococcus kodakarensisの3種のmcm遺伝子について

石野良純, 石野園子, 藤野誠司, 尾木野弘実, 冨田宏矢, 金井保, 跡見晴幸

日本Archaea研究会講演会要旨集 24th 2011年

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所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

アーキアにおける新規DNA修復機構の探索

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2021年4月 - 2024年3月

石野園子
翻訳サイクルの広範に働くリボソームストーク蛋白質の多彩な分子機能

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 基盤研究(B) 2019年4月 - 2022年3月

内海利男, 伊東孝祐, 西川周一, 石野園子
超好熱性アーキアから発見された新規エンドヌクレアーゼによるDNA修復経路の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 基盤研究(C) 2018年4月 - 2021年3月

石野園子

産業財産権

特開2018-153168 微生物収集装置

石野良純, 石野園子, 金田敏枝, 田代康介, 久原哲
WO2017-090684 DNAポリメラーゼ変異体

石野良純, 石野園子, 山上健, 上森隆司, 高津成彰
WO2017-090685 DNAポリメラーゼ変異体

石野良純, 石野園子, 山上健, 上森隆司, 高津成彰
WO2016-039377 耐熱性のミスマッチエンドヌクレアーゼの利用方法

上森隆司, 石野良純, 相良武宏, 石野園子, 山上健, 白井剛
WO2014-181875 新規DNA切断酵素

石野良純, 石野園子, 白石都
特開2005-164433 蛍光マレイミド試薬を用いたタンパク質超分子複合体の化学量論比測定方法

大山拓次, 石野園子, 森川耿右

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