入江直樹 (Naoki A Irie) - マイポータル

基本情報

所属: 統合進化科学研究センター, SOKENDAI 教授

学位: 医学(京都大学)

J-GLOBAL ID: 201101026951546734
researchmap会員ID: B000004635

外部リンク: https://rcies.soken.ac.jp/labs/irie/index_j.html

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研究分野

経歴

2024年4月 - 現在

統合進化科学研究センター副センター長
2023年4月 - 現在

統合進化科学研究センター国立大学法人総合研究大学院大学, 教授
2016年10月 - 2023年3月

東京大学生物普遍性研究機構
2013年8月 - 2023年3月

東京大学, 大学院理学系研究科生物科学専攻, 准教授
2010年4月 - 2013年8月

独立行政法人理化学研究所, 研究員
2009年4月 - 2010年3月

京都大学医学(系)研究科(研究院) 先天異常標本研究センター, 研究員
2009年3月

京都大学, 大学院医学研究科, 博士号取得（医学）

論文

Deciphering the origin of developmental stability: The role of intracellular expression variability in evolutionary conservation

Yui Uchida, Masato Tsutsumi, Shunsuke Ichii, Naoki Irie, Chikara Furusawa

Evolution & Development 2024年3月査読有り
Hagfish genome elucidates vertebrate whole-genome duplication events and their evolutionary consequences.

Daqi Yu, Yandong Ren, Masahiro Uesaka, Alan J S Beavan, Matthieu Muffato, Jieyu Shen, Yongxin Li, Iori Sato, Wenting Wan, James W Clark …

Nature ecology & evolution 2024年1月12日
Stability in gene expression and body-plan development leads to evolutionary conservation.

Yui Uchida, Hiroyuki Takeda, Chikara Furusawa, Naoki Irie

EvoDevo 14(1) 4-4 2023年3月14日査読有り最終著者責任著者
Emergent roles of maternal microchimerism in postnatal development.

Alexandria Borges, Flore Castellan, Naoki Irie

Development, growth & differentiation 2022年12月15日査読有り最終著者責任著者
Whole-embryonic identification of maternal microchimeric cell types in mouse using single-cell RNA sequencing

Kana Fujimoto, Akira Nakajima, Shohei Hori, Yumiko Tanaka, Yoshitaka Shirasaki, Sotaro Uemura, Naoki Irie

SCIENTIFIC REPORTS 12(1) 2022年11月査読有り最終著者責任著者
The pentameric hydrocoel lobes organize adult pentameral structures in a sea cucumber, Apostichopus japonicus

Sumio Udagawa, Akiko Nagai, Mani Kikuchi, Akihito Omori, Atsushi Tajika, MiekoSaito, Toru Miura, Naoki Irie, Yasuhiro Kamei, Mariko Kondo

Developmental Biology 492 71-78 2022年10月査読有り
Potential contribution of intrinsic developmental stability toward body plan conservation.

Yui Uchida, Shuji Shigenobu, Hiroyuki Takeda, Chikara Furusawa, Naoki Irie

BMC biology 20(1) 82-82 2022年4月11日査読有り最終著者責任著者
Distinguishing Evolutionary Conservation from Derivedness.

Jason Cheok Kuan Leong, Masahiro Uesaka, Naoki Irie

Life (Basel, Switzerland) 12(3) 2022年3月17日査読有り最終著者責任著者
Beyond recapitulation: Past, present, and future.

Masahiro Uesaka, Naoki Irie

Journal of experimental zoology. Part B, Molecular and developmental evolution 338(1-2) 9-12 2022年1月査読有り最終著者責任著者
Measuring potential effects of the developmental burden associated with the vertebrate notochord.

Satoko Fujimoto, Kaori Yamanaka, Chiharu Tanegashima, Osamu Nishimura, Shigehiro Kuraku, Shigeru Kuratani, Naoki Irie

Journal of experimental zoology. Part B, Molecular and developmental evolution 338(1-2) 129-136 2021年3月10日査読有り最終著者責任著者
The developmental hourglass model and recapitulation: An attempt to integrate the two models.

Masahiro Uesaka, Shigeru Kuratani, Naoki Irie

Journal of experimental zoology. Part B, Molecular and developmental evolution 338(1-2) 76-86 2021年1月27日査読有り最終著者責任著者
Whole embryonic detection of maternal microchimeric cells highlights significant differences in their numbers among individuals.

Kana Fujimoto, Akira Nakajima, Shohei Hori, Naoki Irie

PloS one 16(12) e0261357 2021年査読有り最終著者責任著者
Derivedness Index for Estimating Degree of Phenotypic Evolution of Embryos: A Study of Comparative Transcriptomic Analyses of Chordates and Echinoderms.

Jason Cheok Kuan Leong, Yongxin Li, Masahiro Uesaka, Yui Uchida, Akihito Omori, Meng Hao, Wenting Wan, Yang Dong, Yandong Ren, Si Zhang …

Frontiers in cell and developmental biology 9 749963-749963 2021年査読有り最終著者責任著者
How can recapitulation be reconciled with modern concepts of evolution?

Shigeru Kuratani, Masahiro Uesaka, Naoki Irie

Journal of experimental zoology. Part B, Molecular and developmental evolution 338(1-2) 28-35 2020年12月31日査読有り最終著者
In the spotlight-Established researcher.

Naoki Irie

Journal of experimental zoology. Part B, Molecular and developmental evolution 338(1-2) 5-6 2020年9月17日査読有り筆頭著者最終著者責任著者
Genomic insights of body plan transitions from bilateral to pentameral symmetry in Echinoderms.

Yongxin Li, Akihito Omori, Rachel L Flores, Sheri Satterfield, Christine Nguyen, Tatsuya Ota, Toko Tsurugaya, Tetsuro Ikuta, Kazuho Ikeo, Mani Kikuchi …

Communications biology 3(1) 371-371 2020年7月10日査読有り最終著者責任著者
Toward understanding of evolutionary constraints: experimental and theoretical approaches.

Chikara Furusawa, Naoki Irie

Biophysical reviews 12(5) 1155-1161 2020年6月22日査読有り最終著者責任著者
The developmental transcriptome for Lytechinus variegatus exhibits temporally punctuated gene expression changes.

John D Hogan, Jessica L Keenan, Lingqi Luo, Jonas Ibn-Salem, Arjun Lamba, Daphne Schatzberg, Michael L Piacentino, Daniel T Zuch, Amanda B Core, Carolyn Blumberg …

Developmental biology 460(2) 139-154 2020年4月15日査読有り
Recapitulation-like developmental transitions of chromatin accessibility in vertebrates.

Uesaka M, Kuratani S, Takeda H, Irie N

Zoological letters 5 33-33 2019年査読有り最終著者
Embryonic lethality is not sufficient to explain hourglass-like conservation of vertebrate embryos

Yui Uchida, Masahiro Uesaka, Takayoshi Yamamoto, Hiroyuki Takeda, Naoki Irie

EvoDevo 9(1) 7-7 2018年3月16日査読有り最終著者責任著者