工藤紀雄 (Norio Kudo) - マイポータル

基本情報

所属: 理化学研究所環境資源科学研究センター

ORCID ID: https://orcid.org/0000-0001-6468-7006
J-GLOBAL ID: 201801021311287066
researchmap会員ID: B000306737

研究分野

ライフサイエンス / 構造生物化学 /

学歴

論文

中枢移行性を有するHDAC6選択的阻害剤の開発

橋本公佑, 井手聡一郎, 新真由美, 中田明子, 伊藤昭博, 伊藤孝, 工藤紀雄, 吉田稔, 長岡康夫, 住吉孝明

日本薬学会年会要旨集 142年会 27T-pm12 2022年3月
Mechanism-based inhibitors of SIRT2: structure–activity relationship, X-ray structures, target engagement, regulation of α-tubulin acetylation and inhibition of breast cancer cell migration

Alexander L. Nielsen, Nima Rajabi, Norio Kudo, Kathrine Lundø, Carlos Moreno-Yruela, Michael Bæk, Martin Fontenas, Alessia Lucidi, Andreas S. Madsen, Minoru Yoshida …

RSC Chemical Biology 2(2) 612-626 2021年
A novel GSK3 inhibitor that promotes self-renewal in mouse embryonic stem cells

Hiroki Kobayashi, Haruna Nishimura, Norio Kudo, Hiroyuki Osada, Minoru Yoshida

Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry 84(10) 1-8 2020年7月8日査読有り
Design, Synthesis and Structure-Activity Relationship Study of Pyrilamine Derivatives as Histone Deacetylase Inhibitors

Seiya Hiranaka, Mayumi Arata, Akiko Nakata, Akiko Tanaka, Yoshinobu Hashizume, Norio Kudo, Akihiro Ito, Minoru Yoshida, Shinichi Uesato, Yasuo Nagaoka …

Design, Synthesis and Structure-Activity Relationship Study of Pyrilamine Derivatives as Histone Deacetylase Inhibitors 101(2) 726-737 2019年10月査読有り
Biocompatibility and therapeutic potential of glycosylated albumin artificial metalloenzymes

Nature Catalysis 2019年7月査読有り
Identification of a novel small molecule that inhibits deacetylase but not defatty-acylase reaction catalysed by SIRT2

Norio Kudo, Akihiro Ito, Mayumi Arata, Akiko Nakata, Minoru Yoshida

Philosophical Transactions of the Royal Society B: Biological Sciences 373(1748) 2018年6月5日査読有り
Opening the Selectivity Pocket in the Human Lysine Deacetylase Sirtuin2 - New Opportunities, New Questions.

Robaa D, Monaldi D, Wössner N, Kudo N, Rumpf T, Schiedel M, Yoshida M, Jung M

Chemical record (New York, N.Y.) 2018年6月査読有り
Correction to: Halistanol sulfates I and J, new SIRT1-3 inhibitory steroid sulfates from a marine sponge of the genus Halichondria.

Fumiaki Nakamura, Norio Kudo, Yuki Tomachi, Akiko Nakata, Misao Takemoto, Akihiro Ito, Hodaka Tabei, Daisuke Arai, Nicole de Voogd, Minoru Yoshida …

The Journal of antibiotics 71(4) 483-483 2018年3月
Halistanol sulfates i and J, new SIRT1-3 inhibitory steroid sulfates from a marine sponge of the genus Halichondria

Fumiaki Nakamura, Norio Kudo, Yuki Tomachi, Akiko Nakata, Misao Takemoto, Akihiro Ito, Hodaka Tabei, Daisuke Arai, Nicole De Voogd, Minoru Yoshida …

Journal of Antibiotics 71(2) 273-278 2018年2月1日査読有り
Chemical and structural biology of protein lysine deacetylases

Minoru Yoshida, Norio Kudo, Saori Kosono, Akihiro Ito

PROCEEDINGS OF THE JAPAN ACADEMY SERIES B-PHYSICAL AND BIOLOGICAL SCIENCES 93(5) 297-321 2017年5月査読有り
Kinetic and Structural Basis for Acyl-Group Selectivity and NAD(+) Dependence in Sirtuin-Catalyzed Deacylation

Jessica L. Feldman, Kristin E. Dittenhafer-Reed, Norio Kudo, Julie N. Thelen, Akihiro Ito, Minoru Yoshida, John M. Denu

BIOCHEMISTRY 54(19) 3037-3050 2015年5月査読有り
Structure of the histone chaperone CIA/ASF1-double bromodomain complex linking histone modifications and site-specific histone eviction

Yusuke Akai, Naruhiko Adachi, Yohei Hayashi, Masamitsu Eitoku, Norihiko Sano, Ryo Natsume, Norio Kudo, Masaru Tanokura, Toshiya Senda, Masami Horikoshi

PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA 107(18) 8153-8158 2010年5月査読有り
Crystal Structures of the CERT START Domain with Inhibitors Provide Insights into the Mechanism of Ceramide Transfer

Norio Kudo, Keigo Kumagai, Ryosuke Matsubara, Shu Kobayashi, Kentaro Hanada, Soichi Wakatsuki, Ryuichi Kato

JOURNAL OF MOLECULAR BIOLOGY 396(2) 245-251 2010年2月査読有り
Structural basis for specific lipid recognition by CERT responsible for nonvesicular trafficking of ceramide

Norio Kudo, Keigo Kurnagai, Nario Tornishige, Torshiyuki Yamaji, Soichi Wakatsulki, Masahiro Nishijima, Kentaro Hanada, Ryulichi Kato

PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA 105(2) 488-493 2008年1月査読有り
Development of an automated large-scale protein-crystallization and monitoring system for high-throughput protein-structure analyses

Masahiko Hiraki, Ryuichi Kato, Minoru Nagai, Tadashi Satoh, Satoshi Hirano, Kentaro Ihara, Norio Kudo, Masamichi Nagae, Masanori Kobayashi, Michio Inoue …

ACTA CRYSTALLOGRAPHICA SECTION D-BIOLOGICAL CRYSTALLOGRAPHY 62 1058-1065 2006年9月査読有り
Crystal structures of the short-chain flavin reductase HpaC from Sulfolobus tokodaii strain 7 in its three states: NAD(P)(+)-free, NAD(+)-bound, and NADP(+)-bound

M Okai, N Kudo, WC Lee, M Kamo, K Nagata, M Tanokura

BIOCHEMISTRY 45(16) 5103-5110 2006年4月査読有り
Crystal structure of glutamine amidotransferase from Pyrococcus horikoshii OT3

S Maruoka, WC Lee, M Kamo, N Kudo, K Nagata, M Tanokura

PROCEEDINGS OF THE JAPAN ACADEMY SERIES B-PHYSICAL AND BIOLOGICAL SCIENCES 81(10) 459-462 2005年12月査読有り
Crystal structure of the short-chain flavin reductase HpaC from Sulfolobus tokodaii strain 7

Masahiko Okai, Norio Kudo, Koji Nagata, Woo Cheol Lee, Masayuki Kamo, Masaru Tanokura

Proceedings of the Japan Academy Series B: Physical and Biological Sciences 81(6) 229-232 2005年6月
Crystallization and preliminary X-ray analysis of HCE-1, a hatching enzyme of medaka fish, Oryzias latipes

N Kudo, S Yasumasu, Iuchi, I, M Tanokura

ACTA CRYSTALLOGRAPHICA SECTION D-BIOLOGICAL CRYSTALLOGRAPHY 60 725-726 2004年4月査読有り
Crystallization and secondary-structure determination of a protein of the Lrp/AsnC family from a hyperthermophilic archaeon

N Kudo, MD Allen, H Koike, Y Katsuya, M Suzuki

ACTA CRYSTALLOGRAPHICA SECTION D-BIOLOGICAL CRYSTALLOGRAPHY 57 469-471 2001年3月査読有り

もっとみる

MISC

HDAC6選択的阻害活性を有するピリラミン誘導体の探索研究

天野日菜子, 平中誠弥, 式田亮史, 中田明子, 新真由美, 工藤紀雄, 伊藤孝, 伊藤昭博, 吉田稔, 布村一人 …

メディシナルケミストリーシンポジウム講演要旨集 39th (CD-ROM) 2022年
コータクチンのアセチル化によるがん細胞運動制御機構と創薬研究

伊藤昭博, 工藤紀雄, 吉田稔

MEDCHEM NEWS 27(4) 190-194 2017年11月
ヒストンシャペロンCIA‐ブロモドメイン複合体の構造と機能

赤井祐介, 安達成彦, 林陽平, 栄徳勝光, 佐野徳彦, 夏目亮, 工藤紀雄, 田之倉優, 堀越正美, 千田俊哉

日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集 10th 152 2010年5月15日
Crystallization and preliminary X-ray crystallographic analysis of peptide deformylase from Thermus thermophilus HB8

M Kamo, N Kudo, WC Lee, H Motoshima, M Tanokura

ACTA CRYSTALLOGRAPHICA SECTION D-BIOLOGICAL CRYSTALLOGRAPHY 60 1299-1300 2004年7月
Cloning, purification, crystallization, and preliminary crystallographic analysis of acylphosphatase from Pyrococcus horikoshii OT3.

Miyazono, K, Kudo, N, Tanokura, M

Acta Crystal. D60 (6), 1135-1136.(6) 1135-1136 2004年6月
Structural and Functional Characterization of Oryzacystatin-I Monomer and Dimer

NAGATA Koji, IRIMOTO Yoshinobu, KUDO Norio, ABE Keiko, ARAI Soichi, YAMANE Hisakazu, TANOKURA Masaru

Peptide science : proceedings of the ... Japanese Peptide Symposium 1999 473-476 2000年3月1日

共同研究・競争的資金等の研究課題

HDACの遺伝的・化学的改変による環境ストレス応答最適化法の開発

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2019年4月 - 2022年3月

上田実, 工藤紀雄
内因性代謝物質による脱アセチル化酵素サーチュイン活性制御機構の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的萌芽研究 2014年4月 - 2016年3月

伊藤昭博, 本賢一, 工藤紀雄