志見剛 (Takeshi Shimi) - マイポータル

基本情報

所属: 金沢大学ナノ生命科学研究所特任准教授

学位: 博士(理学)(大阪大学)

連絡先: t-shimistaff.kanazawa-u.ac.jp
研究者番号: 60817568
J-GLOBAL ID: 201801014025636421
Researcher ID: AAC-2322-2022
researchmap会員ID: B000310311

外部リンク: https://shimilab.github.io/

研究キーワード

研究分野

ライフサイエンス / 細胞生物学 /

経歴

2023年7月 - 現在

金沢大学, ナノ生命科学研究所, 特任准教授
2018年4月 - 2023年5月

東京工業大学, 科学技術創成研究院細胞制御工学研究センター, 特任准教授
2017年8月 - 2019年3月

Northwestern University, Feinberg School of Medicine, Department of Cell and Molecular Biology, 助教
2016年5月 - 2017年7月

Northwestern University, Feinberg School of Medicine, Department of Biochemistry and Molecular Genetics, 助教
2015年6月 - 2016年4月

University of Chicago, Department of Human Genetics, 上級研究員
2012年2月 - 2015年5月

Northwestern University, Feinberg School of Medicine, Department of Cell and Molecular Biology, 助教
2006年4月 - 2012年1月

Northwestern University, Feinberg School of Medicine, Department of Cell and Molecular Biology, 博士研究員
2005年4月 - 2006年3月

情報通信研究機構, 未来 ICT研究所, 特別研究員

論文

Probing Nanomechanics by Direct Indentation Using Nanoendoscopy-AFM Reveals the Nuclear Elasticity Transition in Cancer Cells

Takehiko Ichikawa, Yohei Kono, Makiko Kudo, Takeshi Shimi, Naoyuki Miyashita, Tomohiro Maesaka, Kojiro Ishibashi, Kundan Sivashanmugan, Takeshi Yoshida, Keisuke Miyazawa …

ACS Applied Nano Materials 2025年10月12日査読有り
Crosstalk between mitotic reassembly and repair of the nuclear envelope

Yohei Kono, Takeshi Shimi

Nucleus 2024年12月31日査読有り招待有り最終著者責任著者
Probing nanomechanics by direct indentation using Nanoendoscopy-AFM reveals the nuclear elasticity transition in cancer cells

Takehiko Ichikawa, Yohei Kono, Makiko Kudo, Takeshi Shimi, Naoyuki Miyashita, Tomohiro Maesaka, Kojiro Ishibashi, Takeshi Yoshida, Kundan Sivashanmugan, Rikinari Hanayama …

bioRxiv 2024年12月13日
Roles of the lamin A-specific tail region in the localization to sites of nuclear envelope rupture

Yohei Kono, Chan-Gi Pack, Takehiko Ichikawa, Arata Komatsubara, Stephen Adam, Keisuke Miyazawa, Loïc Rolas, Sussan Nourshargh, Ohad Medalia, Robert D Goldman …

PNAS Nexus 2024年11月21日査読有り最終著者責任著者
ラミノパチーにおける核膜の修復異常

河野洋平, 志見剛

生化学 96(1) 101-105 2024年2月25日査読有り招待有り最終著者
Delayed localization of A-type lamins to the rupture sites in Hutchinson–Gilford progeria syndrome

Yohei Kono, Chan-Gi Pack, Takehiko Ichikawa, Arata Komatsubara, Stephen A. Adam, Keisuke Miyazawa, Loïc Rolas, Sussan Nourshargh, Ohad Medalia, Robert D. Goldman …

bioRxiv 2023年9月2日最終著者責任著者
Epigenetic plasticity safeguards heterochromatin configuration in mammals

Kei Fukuda, Takeshi Shimi, Chikako Shimura, Takao Ono, Takehiro Suzuki, Kenta Onoue, Satoko Okayama, Hisashi Miura, Ichiro Hiratani, Kazuho Ikeda …

Nucleic Acids Research 51(12) 6190-6207 2023年5月13日
核膜研究の最前線ラミノパチーにおいて核膜の修復異常を引き起こす分子機構の解明(Hot topics on nuclear envelope Molecular mechanisms underlying defective repair of nuclear envelope ruptures in laminopathies)

Shimi Takeshi, Kono Yohei, Adam Stephen, Sato Yuko, Reddy Karen, Zheng Yixian, Medalia Ohad, Goldman Robert, Kimura Hiroshi

The Journal of Physiological Sciences 73(Suppl.1) 43-43 2023年5月
Nucleoplasmic lamin C rapidly accumulates at sites of nuclear envelope rupture with BAF and cGAS

Yohei Kono, Stephen A. Adam, Yuko Sato, Karen L. Reddy, Yixian Zheng, Ohad Medalia, Robert D. Goldman, Hiroshi Kimura, Takeshi Shimi

Journal of Cell Biology 221(12) e202201024 2022年10月27日査読有り最終著者責任著者
Superfluid helium nanoscope insert with millimeter working range

Naoki Kamiya, Kazuki Kuramoto, Kento Takishima, Tatsuya Yumoto, Haruka Oda, Takeshi Shimi, Hiroshi Kimura, Michio Matsushita, Satoru Fujiyoshi

Review of Scientific Instruments 93(10) 103703 2022年10月1日
Nucleoplasmic Lamin C Rapidly Accumulates at Sites of Nuclear Envelope Rupture with BAF and cGAS

Yohei Kono, Stephen A. Adam, Karen L. Reddy, Yixian Zheng, Ohad Medalia, Robert D. Goldman, Hiroshi Kimura, Takeshi Shimi

bioRxiv 2022年1月5日最終著者責任著者
RNA polymerase II condensate formation and association with Cajal and histone locus bodies in living human cells

Takashi Imada, Takeshi Shimi, Ai Kaiho, Yasushi Saeki, Hiroshi Kimura

Genes to Cells 26(5) 298-312 2021年3月19日
Computational analyses reveal spatial relationships between nuclear pore complexes and specific lamins

Mark Kittisopikul, Takeshi Shimi, Meltem Tatli, Joseph Riley Tran, Yixian Zheng, Ohad Medalia, Khuloud Jaqaman, Stephen A. Adam, Robert D. Goldman

Journal of Cell Biology 220(4) e202007082 2021年2月11日査読有り
Variable immersion microscopy with a high numerical aperture

Keita Ishida, Kanta Naruse, Yuta Mizouchi, Yoshihiro Ogawa, Michio Matsushita, Takeshi Shimi, Hiroshi Kimura, Satoru Fujiyoshi

Optics Letters 46(4) 856-856 2021年2月10日
RNA polymerase II condensate formation and association with Cajal and histone locus bodies in living human cells

Takashi Imada, Takeshi Shimi, Ai Kaiho, Yasushi Saeki, Hiroshi Kimura

bioRxiv 2020年12月25日
Adaptive multiorientation resolution analysis of complex filamentous network images

Mark Kittisopikul, Amir Vahabikashi, Takeshi Shimi, Robert D Goldman, Khuloud Jaqaman

Bioinformatics 36(20) 5093-5103 2020年7月11日
Computational analysis of lamin isoform interactions with nuclear pore complexes

Mark Kittisopikul, Takeshi Shimi, Meltem Tatli, Joseph R. Tran, Yixian Zheng, Ohad Medalia, Khuloud Jaqaman, Stephen A. Adam, Robert D. Goldman

bioRxiv 2020年4月3日
A mosaic of old and young nucleoporins

Takeshi Shimi, Hiroshi Kimura

Journal of Cell Biology 218(2) 385-386 2019年1月15日
The molecular architecture of lamins in somatic cells

Yagmur Turgay, Matthias Eibauer, Anne E. Goldman, Takeshi Shimi, Maayan Khayat, Kfir Ben-Harush, Anna Dubrovsky-Gaupp, K. Tanuj Sapra, Robert D. Goldman, Ohad Medalia

Nature 543(7644) 261-264 2017年3月1日
Analyses of the Dynamic Properties of Nuclear Lamins by Fluorescence Recovery After Photobleaching (FRAP) and Fluorescence Correlation Spectroscopy (FCS)

Shimi Takeshi, Chan-Gi Pack, Robert D. Goldman

Methods in Molecular Biology 99-111 2016年5月5日

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MISC

Nanoendoscopy-AFM Reveals Softened Nuclear Elasticity in Q353R Laminopathy Cardiomyocytes

A. S. BOROWIAK, T. SHIMI, Y. KONO, T. FUKUMA

33rd International Colloquium on Scanning Probe Microscope (ICSPM33) 2025年12月
Controlling Cellular Electromechanical Properties via Ferroelectric Crystal Surfaces

A. S. BOROWIAK, Y. KONO, T. SHIMI, T. FUKUMA

33rd International Colloquium on Scanning Probe Microscope (ICSPM33) S1-3 2025年12月
Direct Intracellular Probing with Nanoendoscopy-AFM Reveals Nuclear Softening during Epithelial-Mesenchymal Transition

T. Ichikawa, Y. Kono, M. Kudo, T. Shimi, T. Fukuma

33rd International Colloquium on Scanning Probe Microscope (ICSPM33) S1-2 2025年12月
ラミンAとCの異なる役割：核膜修復とクロマチン相互作用

河野洋平, 川瀬雅貴, 滝沢由政, 島津美幸, 大黒多希子, 宮成悠介, 福間剛士, 胡桃坂仁志, 眞貝洋一, 木村宏 …

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 48th 3PS-18 2025年12月
細胞核への力学的ストレスに対するクロマチンの抵抗性と応答

川瀬雅貴, 河野洋平, 市川壮彦, 木村宏, 福間剛士, 眞貝洋一, 志見剛

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 48th 3AS-15 2025年12月
ナノ内視鏡AFMを用いたクロマチン採取技術の開発

志見剛, 市川壮彦, Cong Quang Vu, 河野洋平, 宮澤佳甫, 西村達也, 新井敏, 福間剛士

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 48th 1MS-17 2025年12月
The mechanical properties of cells grown at the interface of ferroelectric domain walls

Alexis Borowiak, Takeshi Shimi, Yohei Kono, Takeshi Fukuma

第63回日本生物物理学会年会 1Pos095 2025年9月
Exploring the elastic properties of beating dilated cardiomyopathy cells with the Q353R mutation using nanoendoscopy-AFM

ALEXIS BOROWIAK, TAKEHIKO ICHIKAWA, YOHEI KONO, TAKESHI SHIMI, MASAMICHI ITO, RYO NITTA, TAKESHI FUKUMA

応用物理学会秋季学術講演会講演予稿集(CD-ROM) 86th 8p-P02-13 2025年9月
Large-scale data analysis of the stiffness of FUCCI HeLa cells grown on a ferroelectric crystal

ALEXIS BOROWIAK, YOHEI KONO, TAKESHI SHIMI, TAKESHI FUKUMA

応用物理学会秋季学術講演会講演予稿集(CD-ROM) 86th 8p-P02-12 2025年9月
Using the boundaries of ferroelectric domains as a potential virtual electrode for living cells

ALEXIS BOROWIAK, YOHEI KONO, TAKESHI SHIMI, TAKESHI FUKUMA

応用物理学会秋季学術講演会講演予稿集(CD-ROM) 86th 7p-N306-7 2025年9月
Nuclear membrane mechanical statistical analysis of Human Induced Pluripotent Stem Cell-derived cardiomyocytes

Alexis S. Borowiak, Takehiko Ichikawa, Takeshi Shimi, Yohei Kono, Masamichi Itou, Ryo Nitta, Takeshi Fukuma

The 26th International Conference on Non-contact Atomic Force Microscopy (NC-AFM 2025) P-2 2025年8月
Applying an electrical field gradient to living cells via ferroelectric boundaries

Alexis S. Borowiak, Takeshi Shimi, Yohei Kono, Takeshi Fukuma

The 26th International Conference on Non-contact Atomic Force Microscopy (NC-AFM 2025) P-1 2025年8月
Controlling the membrane potential and stiffness of cancer cells via ferroelectric surfaces

Alexis S. Borowiak, Takehiko Ichikawa, Yohei Kono, Takeshi Shimi, Takeshi Fukuma

The 26th International Conference on Non-contact Atomic Force Microscopy (NC-AFM 2025) S10-6 2025年8月
Investigating the Electromechanical Properties of Nuclei in Living Cells at the Interface of 180° Ferroelectric Domain Walls

Alexis Borowiak, Takeshi Shimi, Yohei Kono, Takeshi Fukuma

2025 IEEE International Symposium on Applications of Ferroelectrics (IEEE ISAF 2025) 3211 2025年7月
核ラミナと相互作用するヘテロクロマチンが核の力学的特性を制御する

川瀬雅貴, 河野洋平, 市川壮彦, 宮田一輝, 木村宏, 福間剛士, 眞貝洋一, 志見剛

第18回日本エピジェネティクス研究会年会 P-68 2025年6月
クライオ電子線トモグラフィーによる哺乳類細胞の高次クロマチン構造解析

滝沢由政, 松本翔太, 畠澤卓, 小林由紀, 小笠原光雄, 河野洋平, 志見剛, 胡桃坂仁志

学術変革領域(A)「細胞運命コード」第２回領域会議 2025年6月
Investigating the nucleus elasticity of the beating cardiomyocytes nucleus in laminopathy by nanoendoscopy-AFM

Alexis Borowiak, Takehiko Ichikawa, Yohei Kono, Takeshi Shimi, Masamichi Ito, Ryo Nitta, Takeshi Fukuma

The 9th NanoLSI Symposium in conjunction with 19th International Symposium on Macrocyclic and Supramolecular Chemistry 2025 (ISMSC2025) PNA_11 2025年5月
Development of Genomic DNA Manipulation Method Using Nanoendoscopy-AFM

Takeshi Shimi, Takehiko Ichikawa, Cong Quang Vu, Yohei Kono, Keisuke Miyazawa, Tatsuya Nishimura, Satoshi Arai, Takeshi Fukuma

The 9th NanoLSI Symposium in conjunction with 19th International Symposium on Macrocyclic and Supramolecular Chemistry 2025 (ISMSC2025) PNA_14 2025年5月
Modulating the electromechanical properties of the nucleus in living cells via ferroelectric surfaces

ALEXIS BOROWIAK, TAKEHIKO ICHIKAWA, YOHEI KONO, TAKESHI SHIMI, TAKESHI FUKUMA

第72回応用物理学会春季学術講演会 16p-K402-15 2025年3月
Investigating the mechanical properties of beating hiPSC derived-cardiomyocytes nuclear membranes via nanoendoscopy-AFM

ALEXIS BOROWIAK, TAKEHIKO ICHIKAWA, YOHEI KONO, TAKESHI SHIMI, MASAMICHI ITO, RYO NITTA, TAKESHI FUKUMA

第72回応用物理学会春季学術講演会 15a-P04-6 2025年3月

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講演・口頭発表等

New insights into the structure of the nuclear lamina revealed by nanoscale resolution microscopy

志見剛

Cold Spring Harbor Meeting Nuclear Organization and Function 2014年
Three-dimensional structure and organization of the nuclear lamina revealed by nanoscale resolution microscopy

志見剛

The 4D Nucleome 2014年
Loss of nuclear lamin B1 is required for chromatin remodeling during cellular senescence

志見剛

Molecular Biology Society of Japan Annual Meeting 2013年
The nuclear lamin networks: defining the chromatin landscape

志見剛

Symposium: chromatin structure dynamics and functions 2013年
The roles of nuclear lamin B1 in poliferation, longevity and senescence

志見剛

American Society for Cell Biology 51st Annual Meeting 2011年
Role for B-type lamins in the normal premature aging of progeria cells reveals process of senescence

志見剛

Gordon Research Conferences Intermediate Filaments 2010年
The A- and B-type nuclear lamin networks: microdomains involved in chromatin organization and transcription

志見剛

American Society for Cell Biology 48th Annual Meeting 2008年

共同研究・競争的資金等の研究課題

核内環境による生命力維持機構の解明

科学技術振興機構戦略的な研究開発の推進戦略的創造研究推進事業 CREST 2024年10月 - 2030年3月

胡桃坂仁志, 藤芳暁, 山口潤一郎, 志見剛
核ラミナとヘテロクロマチンの構造が相互依存する分子メカニズムの解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2024年4月 - 2027年3月

志見剛
細胞核形成における分子機構についての研究

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2021年4月 - 2025年3月

藤芳暁, 工藤史貴, 志見剛
細胞核形成における分子機構についての研究

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2021年4月 - 2025年3月

藤芳暁, 工藤史貴, 志見剛
細胞シート工学を用いたラミノパチー疾患モデル構築と核ラミナ修復機構の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業国際共同研究加速基金(国際共同研究強化(B)) 2020年10月 - 2025年3月

志見剛, 河野洋平, 木村宏
核ラミナが核膜孔複合体の構築を制御する分子メカニズムの解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2020年4月 - 2023年3月

志見剛
核ラミナが核膜孔の分布を制御する分子メカニズムの解明

日本学術振興会科学研究費助成事業研究活動スタート支援 2019年4月 - 2021年3月

志見剛

産業財産権

特許第3879001号生物試料を高精度に測定する方法

志見剛, 原口徳子
特開2005-141002 生物試料を高精度に測定する方法

志見剛, 原口徳子
特許US 20140162288 A1 Biomarker for replicative senescence

Goldman RD, Shimi T, Adam SA
特許US 7336417 B2 Method of measuring biological sample with high accuracy

Shimi T, Haraguchi T

志見剛

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研究分野

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論文

MISC

講演・口頭発表等

共同研究・競争的資金等の研究課題

産業財産権

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