今西 規

J-GLOBALへ         更新日: 18/11/05 18:08
 
アバター
研究者氏名
今西 規
 
イマニシ タダシ
eメール
imanishitokai.ac.jp
URL
https://kaken.nii.ac.jp/d/r/80270461.ja.html
所属
東海大学
部署
医学部
職名
教授
学位
博士(理学)(東京大学大学院理学系研究科)

プロフィール

「ゲノム情報を生かした未来の医療を創る」をモットーに、医学部で人類遺伝学・生命情報学の研究を行っている。主な研究テーマは、感染症診断のための迅速なゲノム解析システムの開発や、顔形状を規定するゲノム要因の探索など。生命情報学分野のデータベースとして、ヒト遺伝子の統合データベースH-InvDB(http://hinv.jp/ )、リンク自動管理システム(http://biodb.jp/ )、遺伝的形質に関連するゲノム多型のデータベースVaDE(http://bmi-tokai.jp/VaDE/ )などを開発した。

研究分野

 
 

経歴

 
2012年10月
 - 
現在
東海大学 医学部基礎医学系分子生命科学 教授
 
2004年4月
 - 
現在
北海道大学大学院 情報科学研究科 客員教授(併任)
 
2001年4月
 - 
2012年9月
産業技術総合研究所 研究チーム長
 
1994年4月
 - 
2001年3月
国立遺伝学研究所 助手
 
1998年10月
 - 
1999年9月
University of Washington (Seattle, USA) Visiting Scholar
 

学歴

 
1990年4月
 - 
1993年3月
東京大学大学院 理学系研究科 博士課程
 
1988年4月
 - 
1990年3月
東京大学大学院 理学系研究科 修士課程
 
1984年4月
 - 
1988年3月
東京大学 理学部 生物学科
 

論文

 
Kryukov K, Ueda MT, Imanishi T, Nakagawa S
Virus research      2018年2月   [査読有り]
Watanabe N, Kryukov K, Nakagawa S, Takeuchi JS, Takeshita M, Kirimura Y, Mitsuhashi S, Ishihara T, Aoki H, Inokuchi S, Imanishi T, Inoue S
PloS one   13(8) e0202049   2018年   [査読有り]
Ogawa T, Kryukov K, Imanishi T, Shiroguchi K
Scientific reports   7(1) 13576   2017年12月   [査読有り]
Mitsuhashi S, Nakagawa S, Takahashi Ueda M, Imanishi T, Frith MC, Mitsuhashi H
Scientific reports   7(1) 14789   2017年11月   [査読有り]
Mari Tenno, Katsuyuki Shiroguchi, Sawako Muroi, Eiryo Kawakami, Keita Koseki, Kirill Kryukov, Tadashi Imanishi, Florent Ginhoux, Ichiro Taniuchi
The Journal of Experimental Medicine   jem.20170729   2017年10月   [査読有り]
Mitsuhashi S, Kryukov K, Nakagawa S, Takeuchi JS, Shiraishi Y, Asano K, Imanishi T
Scientific reports   7(1) 5657   2017年7月   [査読有り]
Horio Y, Shiraishi Y, Watanabe N, Inoue S, Imanishi T, Asano K.
Respirology Case Reports   5(4)    2017年   [査読有り]
Shimada M.K, Sanbonmatsu R, Yamaguchi-Kabata Y, Yamasaki C, Suzuki Y, Chakraborty R, Gojobori T, Imanishi T.
Molecular Genetics and Genomics   291(5) 1851-1869   2016年   [査読有り]
Kryukov K, Imanishi T.
PLoS ONE   11(9)    2016年   [査読有り]
Nagai Y, Takahashi Y, Imanishi T.
Nucleic Acids Research   43(D1) D868-D872   2015年   [査読有り]
Yamada C, Kondo M, Kishimoto N, Shibata T, Nagai Y, Imanishi T, Oroguchi T, Ishii N, Nishizaki Y.
Journal of Diabetes Investigation   6(4) 408-415   2015年   [査読有り]
International Glossina Genome Initiative
Science (New York, N.Y.)   344(6182) 380-386   2014年4月   [査読有り]
International Glossina Genome Initiative, Science (New York, N.Y.), 2014, vol. 344, no. 6182, pp. 380-386, 2014
Watanabe J, Hattori M, Berriman M, Lehane M.J, Hall N, Solano P, Aksoy S, Hide W, Tour{é} Y, Attardo G.M, Darby A.C, Toyoda A, Hertz-Fowler C, Larkin D.M, Cotton J.A, Sanders M.J, Swain M.T, Quail M.A, Inoue N, Ravel S, Taylor T.D, Srivastava T.P, Sharma V, Warren W, Wilson R.K, Suzuki Y, Lawson D, Hughes D.S.T, Megy K, Masiga D.K, Mireji P.O, Hansen I.A, Van Den Abbeele J, Benoit J.B, Bourtzis K, Obiero G.F.O, Robertson H.M, Jones J.W, Zhou J.-J, Field L.M, Friedrich M, Nyanjom S.R.G, Telleria E.L, Caljon G, Ribeiro J.M.C, Acosta-Serrano A, Ooi C.-P, Rose C, Price D.P, Haines L.R, Christoffels A, Sim C, Pham D.Q.D, Denlinger D.L, Geiser D.L, Omedo I.A, Winzerling J.J, Peyton J.T, Marucha K.K, Jonas M, Meuti M.E, Rawlings N.D, Zhang Q, Macharia R.W, Michalkova V, Dashti Z.J.S, Baumann A.A, G{ä}de G, Marco H.G, Caers J, Schoofs L, Riehle M.A, Hu W, Tu Z, Tarone A.M, Malacrida A.R, Kibet C.K, Scolari F, Koekemoer J.J.O, Willis J, Gomulski L.M, Falchetto M, Scott M.J, Fu S, Sze S.-H, Luiz T, Weiss B, Walshe D.P, Wang J, Wamalwa M, Mwangi S, Ramphul U.N, Snyder A.K, Brelsfoard C.L, Thomas G.H, Tsiamis G, Arensburger P, Rio R.V.M, Macdonald S.J, Panji S, Kruger A, Benkahla A, Balyeidhusa A.S.P, Msangi A, Okoro C.K, Stephens D, Stanley E.J, Mpondo F, Wamwiri F, Mramba F, Siwo G, Githinji G, Harkins G, Murilla G, Lehv{ä}slaiho H, Malele I, Auma J.E, Kinyua J.K, Ouma J, Okedi L, Manga L, Aslett M, Koffi M, Gaunt M.W, Makgamathe M, Mulder N, Manangwa O, Abila P.P, Wincker P, Gregory R, Bateta R, Sakate R, Ommeh S, Lehane S, Imanishi T, Osamor V.C, Kawahara Y.
Science   344(6182) 380-386   2014年   [査読有り]
Takenaka Y, Noda-Ogura A, Imanishi T, Yamaguchi A, Gojobori T, Shigeri Y
Gene   528(2) 201-205   2013年10月   [査読有り]
Takenaka Y, Noda-Ogura A, Imanishi T, Yamaguchi A, Gojobori T, Shigeri Y, Gene, 2013, vol. 528, no. 2, pp. 201-205, 2013
Takeda J, Yamasaki C, Murakami K, Nagai Y, Sera M, Hara Y, Obi N, Habara T, Gojobori T, Imanishi T
Nucleic acids research   41(Database issue) D915-9   2013年1月   [査読有り]
Takeda J, Yamasaki C, Murakami K, Nagai Y, Sera M, Hara Y, Obi N, Habara T, Gojobori T, Imanishi T, Nucleic acids research, 2013, vol. 41, no. Database issue, pp. D915-9, 2013
Imanishi T, Nagai Y, Habara T, Yamasaki C, Takeda J, Mikami S, Bando Y, Tojo H, Nishimura T
Journal of proteome research   12(1) 62-66   2013年1月   [査読有り]
Imanishi T, Nagai Y, Habara T, Yamasaki C, Takeda J, Mikami S, Bando Y, Tojo H, Nishimura T, Journal of proteome research, 2013, vol. 12, no. 1, pp. 62-66, 2013
Umezawa H, Shikata S, Shibata H, Imanishi T, Ito Y, Hirabayashi J, Sumi H, Suzuki K, Chino Y, Izu N, Ishikawa Y, Horiuchi S, Yasutaka T, Okuma S.
AIST Today (International Edition)   (50) 13-18   2013年   [査読有り]
Nagai Y, Imanishi T
Database : the journal of biological databases and curation   2013 bat073   2013年   [査読有り]
Takeda J.I, Yamasaki C, Murakami K, Nagai Y, Sera M, Hara Y, Obi N, Habara T, Gojobori T, Imanishi T.
Nucleic Acids Research   41(D1)    2013年   [査読有り]
Imanishi T, Nagai Y, Habara T, Yamasaki C, Takeda J.-I, Mikami S, Bando Y, Tojo H, Nishimura T.
Journal of Proteome Research   12(1) 62-66   2013年   [査読有り]
Takenaka Y, Noda-Ogura A, Imanishi T, Yamaguchi A, Gojobori T, Shigeri Y.
Gene   528(2) 201-205   2013年   [査読有り]
Ishibashi M, Noda AO, Sakate R, Imanishi T
Gene   504(1) 1-5   2012年8月   [査読有り]
Taniya T, Tanaka S, Yamaguchi-Kabata Y, Hanaoka H, Yamasaki C, Maekawa H, Barrero RA, Lenhard B, Datta MW, Shimoyama M, Bumgarner R, Chakraborty R, Hopkinson I, Jia L, Hide W, Auffray C, Minoshima S, Imanishi T, Gojobori T
Genomics   99(1) 1-9   2012年1月   [査読有り]
Taniya T, Tanaka S, Yamaguchi-Kabata Y, Hanaoka H, Yamasaki C, Maekawa H, Barrero RA, Lenhard B, Datta MW, Shimoyama M, Bumgarner R, Chakraborty R, Hopkinson I, Jia L, Hide W, Auffray C, Minoshima S, Imanishi T, Gojobori T, Genomics, 2012, vol. 99...
Minaka Ishibashi, Akiko Ogura Noda, Ryuichi Sakate, Tadashi Imanishi
Gene   504(1)    2012年   [査読有り]
Minaka Ishibashi, Akiko Ogura Noda, Ryuichi Sakate, Tadashi Imanishi, 2012, 'Evolutionary growth process of highly conserved sequences in vertebrate genomes', Gene, vol. 504, no. 1
Gough CA, Homma K, Yamaguchi-Kabata Y, Shimada MK, Chakraborty R, Fujii Y, Iwama H, Minoshima S, Sakamoto S, Sato Y, Suzuki Y, Tada-Umezaki M, Nishikawa K, Imanishi T, Gojobori T, PloS one, vol. 7, no. 11, pp. e50445
7(11) e50445   2012年   [査読有り]
Gough CA, Homma K, Yamaguchi-Kabata Y, Shimada MK, Chakraborty R, Fujii Y, Iwama H, Minoshima S, Sakamoto S, Sato Y, Suzuki Y, Tada-Umezaki M, Nishikawa K, Imanishi T, Gojobori T, PloS one, 2012, vol. 7, no. 11, pp. e50445, 2012
Kikugawa S, Nishikata K, Murakami K, Sato Y, Suzuki M, Altaf-Ul-Amin M, Kanaya S, Imanishi T, BMC systems biology, vol. 6 Suppl 2, pp. S7
6 Suppl 2 S7   2012年   [査読有り]
Kikugawa S, Nishikata K, Murakami K, Sato Y, Suzuki M, Altaf-Ul-Amin M, Kanaya S, Imanishi T, BMC systems biology, 2012, vol. 6 Suppl 2, pp. S7, 2012
Hara Y, Imanishi T, Satta Y
Genome biology and evolution   4(11) 1133-1145   2012年   [査読有り]
Hayashida K, Hara Y, Abe T, Chisato Yamasaki C.Y, Toyoda A, Kosuge T, Suzuki Y, Sato Y, Kawashima S, Katayama T, Wakaguri H, Noboru Inoue N.I, Keiichi Homma K.H, Tada-Umezaki M, Yagi Y, Yasuyuki Fujii Y.F, Takuya Habara T.H, Kanehisa M, Hidemi Watanabe H.W, Ito K, Gojobori T, Hideaki Sugawara H.S, Imanishi T, Weir W, Gardner M, Arnab Pain A.P, Shiels B, Hattori M, Nene V, Sugimoto C.
mBio   3(5)    2012年   [査読有り]
Gough CA, Homma K, Yamaguchi-Kabata Y, Shimada MK, Chakraborty R, Fujii Y, Iwama H, Minoshima S, Sakamoto S, Sato Y, Suzuki Y, Tada-Umezaki M, Nishikawa K, Imanishi T, Gojobori T
PloS one   7(11) e50445   2012年   [査読有り]
Kikugawa S, Nishikata K, Murakami K, Sato Y, Suzuki M, Altaf-Ul-Amin M, Kanaya S, Imanishi T
BMC systems biology   6 Suppl 2(SUPPL.2) S7   2012年   [査読有り]
Hayashida K, Hara Y, Abe T, Yamasaki C, Toyoda A, Kosuge T, Suzuki Y, Sato Y, Kawashima S, Katayama T, Wakaguri H, Inoue N, Homma K, Tada-Umezaki M, Yagi Y, Fujii Y, Habara T, Kanehisa M, Watanabe H, Sugimoto C, mBio, vol. 3, no. 5, pp. e00204-12
3(5) e00204-12   2012年   [査読有り]
Hayashida K, Hara Y, Abe T, Yamasaki C, Toyoda A, Kosuge T, Suzuki Y, Sato Y, Kawashima S, Katayama T, Wakaguri H, Inoue N, Homma K, Tada-Umezaki M, Yagi Y, Fujii Y, Habara T, Kanehisa M, Watanabe H, Sugimoto C, mBio, 2012, vol. 3, no. 5, pp. e002...
Taniya T, Tanaka S, Yamaguchi-Kabata Y, Hanaoka H, Yamasaki C, Maekawa H, Barrero R.A, Lenhard B, Datta M.W, Shimoyama M, Bumgarner R, Chakraborty R, Hopkinson I, Jia L, Hide W, Auffray C, Minoshima S, Imanishi T, Gojobori T.
Genomics   99(1) 1-9   2012年   [査読有り]
Hara Y, Imanishi T
BMC evolutionary biology   11(1) 308   2011年10月   [査読有り]
Endo T, Ueno K, Yonezawa K, Mineta K, Hotta K, Satou Y, Yamada L, Ogasawara M, Takahashi H, Nakajima A, Nakachi M, Nomura M, Yaguchi J, Sasakura Y, Yamasaki C, Sera M, Yoshizawa AC, Imanishi T, Taniguchi H, Inaba K
Nucleic acids research   39(Database issue) D807-14   2011年1月   [査読有り]
Endo T, Ueno K, Yonezawa K, Mineta K, Hotta K, Satou Y, Yamada L, Ogasawara M, Takahashi H, Nakajima A, Nakachi M, Nomura M, Yaguchi J, Sasakura Y, Yamasaki C, Sera M, Yoshizawa AC, Imanishi T, Taniguchi H, Inaba K, Nucleic acids research, 2011, v...
Gaudet P, Bairoch A, Field D, Sansone SA, Taylor C, Attwood TK, Bateman A, Blake JA, Bult CJ, Cherry JM, Chisholm RL, Cochrane G, Cook CE, Eppig JT, Galperin MY, Gentleman R, Goble CA, Gojobori T, Hancock JM, Howe DG, Imanishi T, Kelso J, Landsman D, Lewis SE, Mizrachi IK, Orchard S, Ouellette BF, Ranganathan S, Richardson L, Rocca-Serra P, Schofield PN, Smedley D, Southan C, Tan TW, Tatusova T, Whetzel PL, White O, Yamasaki C, BioDBCore Working Group
Nucleic acids research   39(Database issue) D7-10   2011年1月   [査読有り]
Gaudet P, Bairoch A, Field D, Sansone SA, Taylor C, Attwood TK, Bateman A, Blake JA, Bult CJ, Cherry JM, Chisholm RL, Cochrane G, Cook CE, Eppig JT, Galperin MY, Gentleman R, Goble CA, Gojobori T, Hancock JM, BioDBCore Working Group, Nucleic acids...
Yuichiro Hara, Tadashi Imanishi
BMC Evolutionary Biology   11(1)    2011年   [査読有り]
Yuichiro Hara, Tadashi Imanishi, 2011, 'Abundance of ultramicro inversions within local alignments between human and chimpanzee genomes', BMC Evolutionary Biology, vol. 11, no. 1, p. 308
Gaudet P, Bairoch A, Field D, Sansone SA, Taylor C, Attwood TK, Bateman A, Blake JA, Bult CJ, Cherry JM, Chisholm RL, Cochrane G, Cook CE, Eppig JT, Galperin MY, Gentleman R, Goble CA, Gojobori T, Hancock JM, BioDBCore Working Group, Database : the journal of biological databases, curation, vol. 2011, pp. baq027
2011 baq027   2011年   [査読有り]
Gaudet P, Bairoch A, Field D, Sansone SA, Taylor C, Attwood TK, Bateman A, Blake JA, Bult CJ, Cherry JM, Chisholm RL, Cochrane G, Cook CE, Eppig JT, Galperin MY, Gentleman R, Goble CA, Gojobori T, Hancock JM, BioDBCore Working Group, Database : th...
Gaudet P, Bairoch A, Field D, Sansone S.-A, Taylor C, Attwood T.K, Bateman A, Blake J.A, Bult C.J, Cherry J.M, Chisholm R.L, Cochrane G, Cook C.E, Eppig J.T, Galperin M.Y, Gentleman R, Goble C.A, Gojobori T, Hancock J.M, Howe D.G, Imanishi T, Kelso J, Landsman D, Lewis S.E, Karsch-Mizrachi I, Orchard S, Ouellette B.F.F, Ranganathan S, Richardson L, Rocca-Serra P, Schofield P.N, Smedley D, Southan C, Tan T.W, Tatusova T, Whetzel P.L, White O, Yamasaki C.
Nucleic Acids Research   39(SUPPL. 1)    2011年   [査読有り]
Gaudet P, Bairoch A, Field D, Sansone SA, Taylor C, Attwood TK, Bateman A, Blake JA, Bult CJ, Cherry JM, Chisholm RL, Cochrane G, Cook CE, Eppig JT, Galperin MY, Gentleman R, Goble CA, Gojobori T, Hancock JM, Howe DG, Imanishi T, Kelso J, Landsman D, Lewis SE, Karsch Mizrachi I, Orchard S, Ouellette BF, Ranganathan S, Richardson L, Rocca-Serra P, Schofield PN, Smedley D, Southan C, Tan TW, Tatusova T, Whetzel PL, White O, Yamasaki C, BioDBCore Working Group
Database : the journal of biological databases and curation   2011 baq027   2011年   [査読有り]
Endo T, Ueno K, Yonezawa K, Mineta K, Hotta K, Satou Y, Yamada L, Ogasawara M, Takahashi H, Nakajima A, Nakachi M, Nomura M, Yaguchi J, Sasakura Y, Yamasaki C, Sera M, Yoshizawa A.C, Imanishi T, Taniguchi H, Inaba K.
Nucleic Acids Research   39(SUPPL. 1)    2011年   [査読有り]
Shimada MK, Hayakawa Y, Takeda J, Gojobori T, Imanishi T
BMC evolutionary biology   10(1) 122   2010年4月   [査読有り]
Yamasaki C, Murakami K, Takeda J, Sato Y, Noda A, Sakate R, Habara T, Nakaoka H, Todokoro F, Matsuya A, Imanishi T, Gojobori T
Nucleic acids research   38(Database issue) D626-32   2010年1月   [査読有り]
Takeda J, Suzuki Y, Sakate R, Sato Y, Gojobori T, Imanishi T, Sugano S
Nucleic acids research   38(Database issue) D86-90   2010年1月   [査読有り]
Makoto K Shimada, Yosuke Hayakawa, Jun-ichi Takeda, Takashi Gojobori, Tadashi Imanishi
BMC Evolutionary Biology   10(1)    2010年   [査読有り]
Makoto K Shimada, Yosuke Hayakawa, Jun-ichi Takeda, Takashi Gojobori, Tadashi Imanishi, 2010, 'A comprehensive survey of human polymorphisms at conserved splice dinucleotides and its evolutionary relationship with alternative splicing', BMC Evo...
Imanishi T.
AIST Today (International Edition)   (37)    2010年   [査読有り]
Endo T, Ueno K, Yonezawa K, Mineta K, Hotta K, Satou Y, Yamada L, Ogasawara M, Takahashi H, Nakajima A, Nakachi M, Nomura M, Yaguchi J, Konno A, Sasakura Y, Yoshizawa AC, Taniguchi H, Yamasaki C, Sera M, Imanishi T, Inaba K, Genome biology, vol. 11, no. Suppl 1, pp. P11-P11
11(Suppl 1) P11-P11   2010年   [査読有り]
Endo T, Ueno K, Yonezawa K, Mineta K, Hotta K, Satou Y, Yamada L, Ogasawara M, Takahashi H, Nakajima A, Nakachi M, Nomura M, Yaguchi J, Konno A, Sasakura Y, Yoshizawa AC, Taniguchi H, Yamasaki C, Sera M, Imanishi T, Inaba K, Genome biology, 2010, ...
Kawahara Y, Sakate R, Matsuya A, Murakami K, Sato Y, Zhang H, Gojobori T, Itoh T, Imanishi T
Bioinformatics (Oxford, England)   25(24) 3321-3322   2009年12月   [査読有り]
Imanishi T, Nakaoka H
Nucleic acids research   37(Web Server issue) W17-22   2009年7月   [査読有り]
Jin L, Kryukov K, Suzuki Y, Imanishi T, Ikeo K, Gojobori T
Gene   435(1-2) 1-8   2009年4月   [査読有り]
Shimada MK, Matsumoto R, Hayakawa Y, Sanbonmatsu R, Gough C, Yamaguchi-Kabata Y, Yamasaki C, Imanishi T, Gojobori T
Nucleic acids research   37(Database issue) D810-5   2009年1月   [査読有り]

Misc

 
筋機能と病態研究のフロンティア ナノポアシークエンサーを用いたD4Z4リピートの解析
三橋 里美, 中川 草, 上田 真保子, 今西 規, 三橋 弘明, フリス・マーティン
日本筋学会学術集会プログラム・抄録集   4回 31-31   2018年8月
ナノポアシーケンサーを活用した感染症細菌叢ゲノムの迅速解析
中川 草, 今西 規
バイオサイエンスとインダストリー   76(3) 234-235   2018年5月
次世代シーケンサーを用いた胸水細菌叢解析
白石 良樹, 友松 克允, 坂巻 文雄, 端山 直樹, 小熊 剛, 青木 琢也, Kryukov Kirill, 中川 草, 今西 規, 浅野 浩一郎
日本呼吸器学会誌   7(増刊) 148-148   2018年3月
GenomeSyncとGenome Searchツールキットを用いたメタゲノムの配列の分類(Classifying metagenomic reads using GenomeSync and Genome Search Toolkit)
Kryukov Kirill, 今西 規
日本細菌学雑誌   73(1) 93-93   2018年2月
【どこでも 誰でも より長く ナノポアシークエンサーが研究の常識を変える!】 迅速な細菌種の組成解析
中川 草, 三橋 里美, Kryukov Kirill, 今西 規
実験医学   36(1) 32-37   2018年1月
16S rRNA遺伝子のアンプリコンシークエンスによる細菌組成の解析は、ナノポア技術に基づくシークエンサーMinIONの登場により大きく変わりつつある。ロングリードが得られること、そして逐次的なシークエンスが可能という特徴を活かして、われわれを含め世界各地の研究グループがMinIONを使ってさまざまなDNAサンプルの細菌組成を迅速に決定することに成功している。われわれはさらに機器のポータブルという特徴を活かし、MinIONとラップトップ型コンピューターを使って持ち運び可能な迅速細菌同定シス...

特許

 
茂里 康, 山口 篤, 竹中 康浩, 今西 規, 小倉 彰子, 五條堀 孝
田中 進, ロベルト A バレロ, 谷家 貴之, 前川 陽俊, 花岡 秀樹, 今西 規, 五條堀 孝
ロベルト A バレロ, 田村 卓郎, 五條堀 孝, 池尾 一穂, 今西 規