飯田渓太 (Keita Iida) - マイポータル

基本情報

所属: 大阪大学蛋白質研究所助教

研究者番号: 10709653
J-GLOBAL ID: 201301052022350901

外部リンク

研究キーワード

研究分野

経歴

2019年4月 - 現在

大阪大学蛋白質研究所細胞システム研究室助教
2018年7月 - 2019年3月

東京大学生産技術研究所定量生物学研究室特任助教
2017年1月 - 2018年6月

東北大学東北メディカル・メガバンク機構兼業
2017年1月 - 2018年6月

東北大学災害科学国際研究所災害精神医学分野助教
2015年5月 - 2016年12月

東北大学病院臨床研究推進センター特任助教
2015年4月 - 2015年4月

東北大学病院助教
2013年4月 - 2015年3月

東北大学大学院医学系研究科障害科学専攻機能医科学講座融合医工学分野助手

受賞

2020年2月

日本数学会 2019年度日本数学会応用数学研究奨励賞

飯田渓太
2018年12月

エディテージ・エッジ基礎研究グラント

飯田渓太

論文

Functional annotation-driven unsupervised clustering of single-cell transcriptomes

Keita Iida, Jumpei Kondo, Masahiro Inoue, Mariko Okada

2021年6月10日筆頭著者責任著者
Building patient‐specific models for receptor tyrosine kinase signaling networks

Kyoichi Ebata, Sawa Yamashiro, Keita Iida, Mariko Okada

The FEBS Journal 2021年5月14日査読有り
Novel candidates of pathogenic variants of the BRCA1 and BRCA2 genes from a dataset of 3,552 Japanese whole genomes (3.5KJPNv2)

Hideki Tokunaga, Keita Iida, Atsushi Hozawa, Soichi Ogishima, Yoh Watanabe, Shogo Shigeta, Muneaki Shimada, Yumi Yamaguchi-Kabata, Shu Tadaka, Fumiki Katsuoka, Shin Ito, Kazuki Kumada, Yohei Hamanaka, Nobuo Fuse, Kengo Kinoshita, Masayuki Yamamoto, Nobuo Yaegashi, Jun Yasuda

PLOS ONE 16(1) e0236907 - e0236907 2021年1月11日査読有り
Quantifying heterogeneity of stochastic gene expression

Keita Iida, Nobuaki Obata, Yoshitaka Kimura

Journal of Theoretical Biology 465 56 - 62 2019年3月査読有り筆頭著者責任著者
Mathematical Theory to Compute Stochastic Cellular Processes

Keita Iida, Yoshitaka Kimura

APPLICATIONS + PRACTICAL CONCEPTUALIZATION + MATHEMATICS = FRUITFUL INNOVATION 11 117 - 120 2016年査読有り筆頭著者
Vaginal LPS changed gene transcriptional regulation response to ischemic reperfusion and increased vulnerability of fetal brain hemorrhage

Yupeng Dong, Yoshitaka Kimura, Takuya Ito, Clarissa Velayo, Takafumi Sato, Rika Sugibayashi, Kiyoe Funamoto, Kudo Hitomi, Keita Iida, Miyuki Endo, Naoaki Sato, Nobuo Yaegashi

BIOCHEMICAL AND BIOPHYSICAL RESEARCH COMMUNICATIONS 468(1-2) 228 - 233 2015年12月査読有り
Intrauterine Ischemic Reperfusion Switches the Fetal Transcriptional Pattern from HIF-1α- to P53-Dependent Regulation in the Murine Brain

Yupeng Dong, Takuya Ito, Clarissa Velayo, Takafumi Sato, Keita Iida, Miyuki Endo, Kiyoe Funamoto, Naoaki Sato, Nobuo Yaegashi, Yoshitaka Kimura

PLoS ONE 9(10) e110577 - e110577 2014年10月17日査読有り
Theoretical study on the translation and rotation of an elliptic camphor particle

Keita Iida, Hiroyuki Kitahata, Masaharu Nagayama

PHYSICA D-NONLINEAR PHENOMENA 272 39 - 50 2014年4月査読有り筆頭著者
Molecular Patterns of Neurodevelopmental Preconditioning: A Study of the Effects of Antenatal Steroid Therapy in a Protein-Restriction Mouse Model

Clarissa Velayo, Takuya Ito, Yupeng Dong, Miyuki Endo, Rika Sugibayashi, Kiyoe Funamoto, Keita Iida, Nobuo Yaegashi, Yoshitaka Kimura

ISRN Obstetrics and Gynecology 2014 1 - 13 2014年3月13日査読有り
樟脳粒の自発運動：粒子形状と運動の関係について

飯田渓太, 北畑裕之, 長山雅晴

日本計算工学会講演会論文集 2013年6月筆頭著者
Spontaneous motion of an elliptic camphor particle

Hiroyuki Kitahata, Keita Iida, Masaharu Nagayama

PHYSICAL REVIEW E 87(1) 2013年1月査読有り
Numerical simulation of camphor motions at the air-water interface

飯田渓太, 北畑裕之, 長山雅晴

日本計算工学会講演会論文集 17 2012年5月筆頭著者
Experimental and theoretical studies on the self-motion of a phenanthroline disk coupled with complex formation

Keita Iida, Nobuhiko J. Suematsu, Yumi Miyahara, Hiroyuki Kitahata, Masaharu Nagayama, Satoshi Nakata

PHYSICAL CHEMISTRY CHEMICAL PHYSICS 12(7) 1557 - 1563 2010年査読有り筆頭著者

MISC

生物学と数学の両面から細胞の分子過程を探る

飯田渓太

2019年8月25日
2018年度応用数学合同研究集会に参加して

飯田渓太

2019年2月2日
妊娠高血圧症候群(HDP)フェノタイピングのためのアルゴリズムの検討

水野聖士, 永家聖, 飯田渓太, 笠原直子, 田宮元, 栗山進一, 八重樫伸生, 田中博, 菅原準一, 荻島創一

日本疫学会学術総会講演集(Web) 28th 133 (WEB ONLY) 2018年2月1日
Effects of Maternal Inflammation on the Fetal Brain in a Murine Model

Yupeng Dong, Takuya Ito, Clarissa Velayo, Rika Sugibayashi, Kiyoe Funamoto, Keita Iida, Miyuki Endo, Naoaki Sato, Takahiro Minato, Ken Haneda, Sayaka Oshio, Motoyoshi Kawataki, Nobuo Yaegashi, Yoshitaka Kimura

REPRODUCTIVE SCIENCES 22 368A - 368A 2015年3月
繰り返す虚血再灌流負荷は母体低栄養マウス胎仔の脳出血発症リスクを増大させる

伊藤拓哉, 杉林里佳, 木村芳孝, 董宇鵬, 飯田渓太, 佐藤尚明, 八重樫伸生

日本産科婦人科学会雑誌 66(2) 580 - 580 2014年2月
胎児心拍細変動における胎児心電図の抽出アルゴリズムの検討(I)

飯田渓太, 木村芳孝, 伊藤拓哉, 董宇鵬, 羽根田健, 大塩清佳, 西郡秀和, 八重樫伸生

日本産科婦人科学会雑誌 66(2) 719 - 719 2014年2月
胎児心拍細変動における胎児心電図の抽出アルゴリズムの検討(II)

木村芳孝, 飯田渓太, 伊藤拓哉, 董宇鵬, 羽根田健, 大塩清佳, 西郡秀和, 八重樫伸生

日本産科婦人科学会雑誌 66(2) 719 - 719 2014年2月

書籍等出版物

医学のあゆみ

Johannes Nicolaus Wibisana, 飯田渓太, 岡田眞里子(担当:共著, 範囲:免疫系の１細胞解析による転写制御機構の予測)

医歯薬出版株式会社 2021年3月
Self-Organized Motion (Chap. 2)

(担当:共著)

2018年11月

講演・口頭発表等

Probabilistic model of eukaryotic gene expressions

飯田渓太

応用数学合同研究集会 2019年12月14日
一般化超幾何関数を用いた遺伝子発現モデルの解表示とその応用可能性について

飯田渓太

京大応用数学セミナー 2019年10月23日
一般超幾何関数を用いた遺伝子発現モデルの解表示、生命データに基づく便利なパラメータ推定法の探求、複雑系分野への展開について

飯田渓太

軽井沢グラフと解析研究集会 2019年10月6日
コラボ研究について

飯田渓太

代謝統合オミクス若手の会 2019年8月29日
Quantifying biological parameters on genetic switches

Keita Iida

ICIAM2019 2019年7月18日
１細胞レベルの確率遺伝子発現モデリング、解析、パラメータ推定

飯田渓太

社会創造数学セミナーシリーズ（第100回HMMCセミナー） 2019年7月11日招待有り
Quantitative modeling of stochastic gene expression

飯田渓太, 尾畑伸明, 木村芳孝

応用数学合同研究集会 2018年12月16日
遺伝子発現ゆらぎの確率論的定式化と生物学への応用

飯田渓太, 尾畑伸明, 木村芳孝

数学と諸分野の連携を通した知の創造 2018年12月8日招待有り
１細胞データを用いた遺伝子発現モデルのパラメータ推定

飯田渓太

軽井沢グラフと解析研究集会 2018年10月7日
Quantifying heterogeneity of stochastic gene expression

Keita Iida, Nobuaki Obata, Yoshitaka Kimura

日本生物物理学会 2018年9月16日
Theoretical framework for single-cell gene expression analysis

飯田渓太, 尾畑伸明, 木村芳孝

第15回生物数学の理論とその応用 2018年9月12日
Mathematical framework for single-cell gene expression analysis

Keita Iida, Nobuaki Obata, Yoshitaka Kimura

2018年7月14日
遺伝子発現ノイズの確率論的定式化とパラメータ推定

飯田渓太, 尾畑伸明, 木村芳孝

軽井沢グラフと解析研究集会 2018年2月13日
遺伝子発現ノイズの確率論的定式化とパラメータ推定

飯田渓太, 尾畑伸明, 木村芳孝

細胞内ネットワークのダイナミクス 2018年1月31日
うつ病の個別化予防、個別化医療技術開発に向けた数理、機械学習の応用

飯田渓太, 高橋雄太, 兪志前, 小柴生造, 瀧靖之, 菅原準一, 寳澤篤, 田宮元, 栗山進一, 布施昇男, 木下賢吾, 荻島創一, 富田博秋

第2回東北メディカル・メガバンク計画合同研究会 2017年12月22日
遺伝子発現ゆらぎの確率論的定式化と生物学への応用

飯田渓太, 尾畑伸明, 木村芳孝

応用数学合同研究集会 2017年12月15日
遺伝子発現ゆらぎの確率論的定式化

飯田渓太, 尾畑伸明, 木村芳孝

水戸数学・情報数理研究会2017 2017年8月19日
遺伝⼦発現系の数理モデリング〜確率論と決定論の視点から〜

飯田渓太, 木村芳孝, 荻島創一, 尾畑伸明

第１６回講演会兼第６３回応用数学連携フォーラム 2017年6月29日招待有り
Single-cell遺伝⼦発現解析への数理的アプローチ

飯田渓太, 水野聖士, 永家聖, 笠原直子, 木村芳孝, 荻島創一

第5回NGS現場の会 2017年5月22日
「遺伝子発現ノイズの働き」についての生物学的，数理的考察

飯田渓太, 木村芳孝

超幾何方程式研究会2017 2017年1月7日

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担当経験のある科目(授業)

2020年4月 - 2020年4月

生物学実験1 (大阪大学)

共同研究・競争的資金等の研究課題

一細胞データから遺伝子の制御構造を定量推定するための確率・統計理論の構築

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究 2020年4月 - 2023年3月

飯田渓太
がん可塑性の機構解明に向けた知識データ活用型の革新的オミクス解析

大阪大学蛋白質研究所蛋白質研究所新分野開拓支援プログラム 2020年4月 - 2022年3月

飯田渓太, 近藤純平, 井上正宏
オミクス解析における実験と数理の協働

大阪大学蛋白質研究所 2020年度大阪大学蛋白質研究所セミナー 2021年1月 - 2021年1月

飯田渓太, 市川彩花
確率・統計を用いた１細胞遺伝子発現の数理解析と生物学的パラメータの推定

エディテージ・エッジ基礎研究グラント 2019年1月

飯田渓太
遺伝子発現解析によるマウス胎仔低酸素バイオマーカーの探索

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究(B) 2015年4月 - 2017年3月

飯田渓太
遺伝子発現における確率的現象の数理解析

基礎科学研究 2013年4月 - 2015年4月

その他

代謝統合オミクス若手会

2020年8月 - 2020年8月

http://transomics.umin.jp/20200828report.html
生命科学・数学・情報科学による新たな理論生命科学へのアプローチ

2014年9月 - 2014年9月

ワークショップの開催

飯田渓太

基本情報

研究キーワード

研究分野

経歴

受賞

論文

MISC

書籍等出版物

講演・口頭発表等

担当経験のある科目(授業)

共同研究・競争的資金等の研究課題

その他

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